北黄海浮游病毒多样性及其与宿主、环境因子的关系

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    41076088
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    50.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    D0604.生物海洋学与海洋生物资源
  • 结题年份:
    2013
  • 批准年份:
    2010
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2011-01-01 至2013-12-31

项目摘要

浮游病毒是海洋生态系统中数量最庞大的生物体,在生物地球化学循环中起着重要作用,可以影响微食物环中的C、N流,调节水体中微生物群落结构,介导微生物之间的基因转移。北黄海具有特殊的地理位置和独特的海洋生态系统,本课题拟通过宏基因组技术,研究北黄海浮游病毒群落结构的特点及其基因多样性,分析基因功能,探讨该海域微型生物的主要代谢途径。通过分析海域内养殖区域、鸭绿江入海口、黄渤海交界水域、冷水团、暖流流经水域、近岸沉积物表层浮游病毒基因多样性、宿主及环境因子的差异,确定病毒多样性的影响因素,探讨养殖等人类活动对病毒群落结构所产生的影响。本研究结果将有助于揭示北黄海微型生物生态的特点,为海洋环境预警、环境评价及修复提供依据。

结项摘要

浮游病毒是海洋生态系统中数量最庞大的生物体,在生物地球化学循环中起着重要作用,可以影响微食物环中的C、N流,调节水体中微生物群落结构,介导微生物之间的基因转移[1-3]。北黄海具有特殊的地理位置和独特的海洋生态系统,本课题利用流式细胞仪研究发现北黄海浮游病毒丰度在9.53×104 ~ 2.74×107个/ ml 之间,浮游病毒峰值出现在秋季,且夏、秋季丰度显著高于春、冬季(P<0.01),水平分布上不同季节在不同地点病毒丰度分布不同,垂直分布上除夏季表层高于底层外,其他季节浮游病毒丰度在垂直分布上并无显著的差异。浮游病毒丰度与其宿主相关性分析显示:春季和秋季,浮游病毒丰度与异养细菌丰度呈显著正相关;夏季,浮游病毒丰度与主要宿主相关性不显著;冬季,浮游病毒丰度与与异养细菌丰度呈显著正相关,与聚球藻丰度呈显著负相关。浮游病毒丰度与环境因子相关性分析显示:春季,浮游病毒与硝酸盐、亚硝酸盐以及磷酸盐呈显著的正相关,与Chla呈显著的负相关;夏季,浮游病毒与硅酸盐、磷酸盐呈显著正相关;秋季,浮游病毒与溶解氧、亚硝酸盐呈显著正相关;冬季,浮游病毒与硅酸盐呈显著正相关。分析推断得出环境因子对浮游病毒的影响可能是通过影响病毒宿主生长或影响病毒生存状态来实现的。在渤海养殖区,浮游病毒丰度在2.5×105 ~ 2.17×106个/ml之间,浮游病毒丰度与其宿主和环境因子相关性分析显示:春季,浮游病毒丰度与温度呈显著正相关;夏季,浮游病毒丰度与微微型真核浮游植物丰度呈显著负相关;秋季,浮游病毒丰度与聚球藻丰度呈显著负相关;冬季,浮游病毒丰度与磷酸盐、温度呈显著负相关。北黄海浮游病毒宏基因组学研究共获得10322个病毒序列,其中肌尾噬菌体科病毒序列占总病毒序列的24.54%,短尾噬菌体科病毒序列占12.76%,长尾噬菌体科病毒序列占14.76%,藻类DNA病毒科病毒序列占4.66%。KEGG基因功能注释显示病毒基因最主要的功能为复制和修复及核苷酸代谢功能。非养殖区与养殖区研究对比表明,浮游病毒对养殖区群落结构调控起到重要的作用,同时,病毒的群落结构也受到宿主等环境因子的影响;人类养殖活动等对超微型生物群落结构及超微型生物的生态位产生了较大的影响。本研究将有助于揭示北黄海微型生物生态的特点,为海洋环境预警、环境评价及修复提供依据。

项目成果

期刊论文数量(5)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
胶州湾微微型浮游植物丰度及其与环境因子的相关性分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
    海洋与湖沼
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    杨琳;汪岷;刘冠群;王健;卢龙飞;王艳;孙辉;刘东艳;刘哲
  • 通讯作者:
    刘哲
东海、黄海浮游病毒及异养细菌的分布研究*
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    海洋与湖沼
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    卢龙飞;汪岷;梁彦韬;王 芳;杨 琳;王 健;孙 辉;汪 俭
  • 通讯作者:
    汪 俭
南黄海秋季浮游病毒丰度分布及其与宿主和环境因子的相关性研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    海洋与湖沼
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    王艳;汪岷;杨琳;卢龙飞;王健;孙辉
  • 通讯作者:
    孙辉
渤海浮游病毒的时空分布
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    海洋与湖沼
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    汪岷;王 健;刘 哲;刘东艳;杨 琳;卢龙飞;王 艳;孙 辉
  • 通讯作者:
    孙 辉

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其他文献

2010-2011年胶州湾叶绿素a与环境因子的时空变化特征
  • DOI:
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  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    海洋学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    王玉珏;刘哲;张永;汪岷;刘东艳
  • 通讯作者:
    刘东艳
北欧海微微型真核浮游生物的多样性和群落结构及其与环境因子的关系
  • DOI:
    10.11693/hyhz20190400074
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    海洋与湖沼
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    韩郁烨;郭萃;段雪萍;管旭冉;姜勇;邵红兵;矫玉田;汪岷
  • 通讯作者:
    汪岷
海洋蓝藻固氮基因
  • DOI:
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  • 发表时间:
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  • 期刊:
    海洋科学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    顾海峰;汪岷;丁昌玲;孙军;韩笑天
  • 通讯作者:
    韩笑天
秦皇岛褐潮期超微型浮游生物丰度及多样性研究
  • DOI:
    10.16441/j.cnki.hdxb.20150426
  • 发表时间:
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  • 期刊:
    中国海洋大学学报(自然科学版)
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    马玉;汪岷;夏骏;宫政;宋雪;刘倩;李岩;姜勇;邵红兵;张耀元
  • 通讯作者:
    张耀元
春季东海产卵场及其邻近海域的束毛藻与网采浮游植物群落
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    渔业科学进展
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    丁昌玲;孙军;汪岷
  • 通讯作者:
    汪岷

其他文献

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汪岷的其他基金

病毒在南极冰缘水华过程中的作用及其对气候变化引发的多重压力的响应
  • 批准号:
    42120104006
  • 批准年份:
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  • 资助金额:
    231 万元
  • 项目类别:
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南极普利兹湾海域浮游病毒生态特性及其与主要宿主相互关系的研究
  • 批准号:
    41976117
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    2019
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  • 项目类别:
    面上项目

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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