LncRNA(HAL6)调控拟南芥高温胁迫响应的分子机制研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31870234
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    25.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0205.植物与环境互作
  • 结题年份:
    2020
  • 批准年份:
    2018
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2019-01-01 至2020-12-31

项目摘要

Heat stress influences plant adversely in development, yield and quality. Long non-coding RNAs (lncRNAs), a category of transcriptional regulator found recently, play a crucial role in development and stress responses. However, the mechanism by which lncRNAs are employed to respond to stresses is unclear. In our previous study, we identified 136 heat-induced lncRNAs in Arabidopsis of which HAL6 could be induced significantly. Analysis shows HAL6 is ubiquitously expressed in most tissues and located in nucleus. Overexpression of HAL6 enables plant to become more resistant to heat stress which indicates that HAL6 functions as a key regulator to heat stress. RIP (RNA Binding Protein Immunoprecipitation) demonstrates HSP101 acts downstream of HAL6. Therefore, to further investigate the effect of HAL6 in plant physiology, we will screen and confirm the target protein.using high-throughput sequencing which would shed light on the molecular mechanism adopted by HAL6.This project will significantly expand our view of lncRNA regulating heat stress and development.
高温胁迫严重影响植物的生长发育、产量和品质。长链非编码RNA是近年来发现的基因表达调控因子,在生物体生长发育和胁迫响应过程中具有非常重要的生物学功能。但人们对植物胁迫应答过程中lncRNA的作用机制却知之甚少。我们的研究发现拟南芥中存在136个高温响应的lncRNA,其中HAL6表达量受到高温胁迫明显诱导。初步分析表明其在各个组织中均有表达,并定位在细胞质中。表型实验发现超表达HAL6明显提高转基因植物的高温抗性,说明HAL6为植物应答高温胁迫关键因子。RNA pull down实验初步筛选出HAL6互作蛋白为HSP101等功能蛋白,推测为HAL6下游直接靶蛋白。因此本项目通过深入研究HAL6的表达调控与生物学功能,结合高通量测序筛选与转基因功能鉴定靶蛋白,明确其参与高温胁迫的作用机理,阐明其自身调控机制,为深入理解lncRNA的作用机理提供全新的理论依据。

结项摘要

长链非编码RNA是近年来备受关注的基因表达调控因子,其作用涉及动植物的生长发育及外界逆境响应等多种生物学过程,具有重要的生物学功能。但人们对于植物lncRNA在应答外界逆境信号的功能及调控的机制却知之甚少。我们通过链特异转录组测序发现并鉴定了拟南芥高温响应的lncRNA HAL6。高温胁迫条件下,HAL6的转录水平明显升高,过表达HAL6植株萌发和成苗的高温抗性明显增加,说明HAL6为植物应答高温胁迫关键因子。因此本项目通过深入研究高温胁迫下HAL6功能和作用机制、明确高温胁迫和lncRNA之间的内在联系;结合突变体、RNA-IP技术等筛选鉴定HAL6调节蛋白HSFA2,阐明高温胁迫下HAL6的分子调控机制,为深入理解miRNA的作用机理提供全新的理论依据和应用工具。

项目成果

期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
拓展荧光显微镜在细胞生物学实验教学中的应用
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    实验室科学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    郭骞欢;郭选辰;郭兴启;彭清才;颜 康
  • 通讯作者:
    颜 康
Dual roles of the serine/arginine-rich splicing factor SR45a in promoting and interacting with nuclear cap-binding complex to modulate the salt-stress response in Arabidopsis
富含丝氨酸/精氨酸的剪接因子 SR45a 在促进和与核帽结合复合物相互作用以调节拟南芥盐胁迫反应中的双重作用
  • DOI:
    10.1111/nph.17175
  • 发表时间:
    2021-02-10
  • 期刊:
    NEW PHYTOLOGIST
  • 影响因子:
    9.4
  • 作者:
    Li, Ying;Guo, Qianhuan;Yan, Kang
  • 通讯作者:
    Yan, Kang

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其他文献

基于调制增强切片MSB的滚动轴承故障特征提取方法
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
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  • 作者:
    冯坤;颜康;胡明辉;贺雅;江志农
  • 通讯作者:
    江志农
应用动态生成树的GPU显存数据复用优化
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
    董小社
种子特异启动子At2S3驱动热激转录因子AtHsfA6a提高烟草热抗性
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    应用与环境生物学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    高艳霞;郭骞欢;李敏;贾凤娟;颜康;郑成超
  • 通讯作者:
    郑成超

其他文献

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颜康的其他基金

高温胁迫下可变剪切调控拟南芥miRNA400加工机理研究
  • 批准号:
    31401096
  • 批准年份:
    2014
  • 资助金额:
    28.0 万元
  • 项目类别:
    青年科学基金项目

相似国自然基金

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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