新型可基因编码的长寿因子活性检测探针的研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    21807061
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    25.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    B0702.生物分子的化学生物学
  • 结题年份:
    2021
  • 批准年份:
    2018
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2019-01-01 至2021-12-31

项目摘要

Sirtuins are NAD-dependant deacylases thar are found in all organisms. In mammalian cells, there are seven subtypes of sirtuin that participate in a number of biological processes, ranging gene expression, metabolism to cellular stress response. Sirtuin function is related to aging and aging-related diseases, and therefore sirtuin is an important drug target. Unfortunately, the study of sirtuin is suffering from the lack of detection tools with high reliability, high selectivity, fast response and easy operation. Herein, the applicant proposes the use of genetically encoded sirtuin probe based on genetic code expansion to overcome the drawbacks of exsiting probes, including molecular instability, tendency of false positive result et al., while summarizes the weakness and challenges of this approach. A series of solutions combining synthetic chemistry, protein engineering, directed evolution et al., have been proposed, in order to estabilish a highly reliable and fast-response method for sirtuin detection and realize the selective monitoring of sirtuin subtype activity in living cells.
Sirtuin是细胞中普遍存在的一类依赖NAD的蛋白质去酰基化酶,在哺乳细胞中有七种亚型,调控着从基因表达、新陈代新到细胞应激反应等许多生理过程,与生命衰老及衰老有关的疾病密切相关,是重要的药物作用靶点。因缺少可靠性高、选择性好、检测快速且简便易操作的活性检测手段,sirtuin的相关研究受到了极大的制约。申请人提出了使用基因密码子扩展技术开发基因编码型sirtuin检测探针的方法,可克服现有检测探针诸如分子稳定低、易造成假阳性结果等弊端,同时凝炼了目前工作中的不足和挑战,提出了基于合成化学、蛋白质工程、直接进化等手段的一系列解决方案,目标在于建立快速可靠的sirtuin检测方法以及实现sirtuin在细胞内的亚型选择性检测。

结项摘要

Sirtuin是一种依赖NAD的蛋白质去酰基化酶,在基础生物学研究和药物研发中发挥着重要作用。本项目针对了sirtuin活性的准确检测这一科学问题,希望通过基因密码子扩展技术来构建基于蛋白质(特别是荧光蛋白)的sirtuin活性检测探针,实现sirtuin活性的快速检测和在细胞内的亚型选择性检测。在项目的执行过程中,我们优化了sirtuin在大肠杆菌内的荧光活性检测体系,提高了检测灵敏度和sirtuin亚型覆盖度。对于亚型选择性检测,我们编码不同的酰基化赖氨酸来开展研究,然而实验结果表明sirtuin亚型对不同酰基化赖氨酸的选择性很低,提示文献研究中可能的偏差。利用编码的非天然氨基酸,我们开展了广泛的sirtuin去酰基化活性研究,揭示了一些过去未知的活性,如SIRT6的去硫辛酰化活性。另一方面,我们还初步探索了一种生物正交的蛋白质赖氨酸酰基化和去酰基化体系,代表了一种新型的蛋白质翻译后修饰研究工具。此外,我们还首次实现了谷氨酸衍生物的基因编码,可用于多种蛋白质修饰类型的构建。

项目成果

期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Diverse protein manipulations with genetically encoded glutamic acid benzyl ester.
使用基因编码的谷氨酸苄酯进行多种蛋白质操作
  • DOI:
    10.1039/d1sc01882e
  • 发表时间:
    2021-07-21
  • 期刊:
    Chemical science
  • 影响因子:
    8.4
  • 作者:
    Yang X;Miao H;Xiao R;Wang L;Zhao Y;Wu Q;Ji Y;Du J;Qin H;Xuan W
  • 通讯作者:
    Xuan W
Toward an Orthogonal Protein Lysine Acylation and Deacylation System
正交蛋白质赖氨酸酰化和脱酰化系统
  • DOI:
    10.1002/cbic.202100551
  • 发表时间:
    2021-12
  • 期刊:
    ChemBioChem
  • 影响因子:
    3.2
  • 作者:
    Ruotong Xiao;Lei Zhao;Hongpeng Ma;Qiaoli Liu;Hongqiang Qin;Xiaozhou Luo;Weimin Xuan
  • 通讯作者:
    Weimin Xuan
Genetically encoding ε-N-benzoyllysine in proteins
蛋白质中的基因编码γ-N-苯甲酰赖氨酸
  • DOI:
    10.1039/d0cc07954e
  • 发表时间:
    2021-02-18
  • 期刊:
    CHEMICAL COMMUNICATIONS
  • 影响因子:
    4.9
  • 作者:
    Ji, Yanli;Ren, Conghui;Xuan, Weimin
  • 通讯作者:
    Xuan, Weimin

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其他文献

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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