基于可控组装微纳界面的循环肿瘤细胞多维度分型富集及临床应用

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    21874089
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    66.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    B0401.分离与分析
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2018
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2019-01-01 至2022-12-31

项目摘要

Detecting, isolating, and analyzing circulating tumor cell (CTC) is of great clinical significance in cancer diagnosis, treatment assessment, prognostic monitoring, and drug resistance mechanisms. Most of current methods focus on counting the number of CTC, which unfortunately miss the characterization of cancer cell subpopulations, and are incapable of releasing different subtypes of CTC correspondingly, leading to the limited clinical relevance. In this project, aptamers against different biomarkers for different types of CTC will be evolved in complex conditions. The nanoparticle-aptamer conjugates with multivalent binding affinity will be constructed to greatly improve the capture efficiency, and the controllable assembly of aptamer density on nanoparticle will be used to provide a series of molecules with different binding affinities to realize CTC subpopulation recognition. Using the nanoparticle-aptamer conjugates with various binding capacity modified microfluidic chip and controllable release strategy, the new strategy sorts CTC according to levels of two subtype markers and thereby separates them into their corresponding subpopulations. More importantly, breast cancer samples will be analyzed and subtyped for understanding of CTC phenotype and clinical relevance. The affinity probes, multivalent DNA aptamer nanospheres, microfluidic devices, and CTC enrichment method developed in this project will provide useful tools for cancer diagnosis, metastasis monitoring, assessment of resistance to therapy and basic research.
循环肿瘤细胞(CTC)分析在肿瘤分期、疗效评估、预测肿瘤进展或复发、抗药性研究等方面具有重大意义。目前CTC富集平台集中在总数分析,无法获得不同分型CTC数目,难以分别释放各种类型CTC进行下游分析,因此难以建立较好临床相关性。本项目拟通过发展复杂体系中核酸适体筛选技术,获得多条复杂体系中能特异性识别多种类型CTC标志物的核酸适体;通过适体纳米探针的多价结合提高亲和能力,并调控适体纳米探针的修饰密度,获得梯度亲和力适体纳米探针,实现CTC分型识别;在不同芯片结构单元依次修饰不同亲和力纳米适体探针,结合通道区域结构设计及可控释放,实现根据双标志物的多维度分型富集及选择释放;通过临床样品分析,建立乳腺癌各类型CTC的临床相关性,为深入理解乳腺癌CTC的转移机制及探究各类型CTC生物学意义提供科学依据。项目的成功实施将为癌症的精准诊断、转移监测、抗药性评估提供科学依据。

结项摘要

循环肿瘤细胞(CTC)分析在肿瘤分期、疗效评估、预测肿瘤进展或复发、抗药性研究等方面具有重大意义。目前CTC富集平台集中在总数分析无法获得不同分型CTC数目,难以建立较好临床相关性。本项目通过筛选获得了循环肿瘤细胞标志物EpCAM、CSV、PD-L1等多种靶标的核酸适体序列;发展了流动多价、拓扑匹配多价、DNA纳米光刻技术、优势互补多价识别策略,构筑了亲和力可调控适体纳米微流控芯片;实现了临床病人样品,并探究了不同类型癌CTC在临床诊断和肿瘤进展中的意义。在项目实施过程中在国际化学期刊上发表论文30 篇,申请专利3项,培养优秀青年基金获得者1人,培养/共同培养了生物分析化学博士4名,硕士2名。

项目成果

期刊论文数量(30)
专著数量(0)
科研奖励数量(1)
会议论文数量(0)
专利数量(3)
Amplified visualization and function exploration of exosomal protein-specific glycosylation using hybridization chain reaction from non-functional epitope
使用非功能表位的杂交链式反应对外泌体蛋白特异性糖基化的放大可视化和功能探索
  • DOI:
    10.1007/s11426-022-1240-5
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    Science China-chemistry
  • 影响因子:
    9.6
  • 作者:
    Siyin Kang;Lin Zhu;Wencheng Wang;Yinzhu Lu;Zhenlong You;Chi Zhang;Yuanfeng Xu;Chaoyong Yang;Yanling Song
  • 通讯作者:
    Yanling Song
Recent Advances in Aptamer-Based Liquid Biopsy
基于适体的液体活检的最新进展
  • DOI:
    10.1021/acsabm.1c01202
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    ACS Appl. Bio Mater.
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Jialu Zhang;Yihao Huang;Miao Sun;Shuang Wan;Chaoyong Yang;Yanling Song
  • 通讯作者:
    Yanling Song
Microfluidic Single-Cell Omics Analysis
微流控单细胞组学分析
  • DOI:
    10.1002/smll.201903905
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    Small
  • 影响因子:
    13.3
  • 作者:
    Xu Xing;Wang Junxia;Wu Lingling;Guo Jingjing;Song Yanling;Tian Tian;Wang Wei;Zhu Zhi;Yang Chaoyong
  • 通讯作者:
    Yang Chaoyong
Dispen-Seq: a single-microparticle dispenser based strategy towards flexible cell barcoding for single-cell RNA sequencing
Dispen-Seq:一种基于单微粒分配器的策略,用于单细胞 RNA 测序的灵活细胞条形码
  • DOI:
    10.1007/s11426-020-9925-8
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    Science China. Chemistry
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Tian Tian;Chen Yingwen;Bi Yunpeng;Li Xingrui;Gao Mingxuan;Zhang Xuebing;Ruan Weidong;Song Jia;Xu Xing;Wu Lingling;Zhu Zhi;Song Yanling;Yang Chaoyong
  • 通讯作者:
    Yang Chaoyong
Enhanced molecular recognition on microfluidic affinity interfaces
增强微流体亲和界面上的分子识别
  • DOI:
    10.1016/j.trac.2022.116827
  • 发表时间:
    2022-11
  • 期刊:
    TrAC Trends in Analytical Chemistry
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Weizhi Liu;Qiuyue Wu;Wencheng Wang;Xing Xu;Chaoyong Yang;Yanling Song
  • 通讯作者:
    Yanling Song

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其他文献

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宋彦龄的其他基金

生物分析化学
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2020
  • 资助金额:
    120 万元
  • 项目类别:
    优秀青年科学基金项目

相似国自然基金

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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