基于功能化温敏聚合物和生物质谱的O-GlcNAc糖蛋白/糖肽富集、鉴定新方法研究

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基本信息

项目摘要

O-GlcNAcylated proteins play important role in critical cellular physiological activity,such as stress responses and energy metabolism. However, the characteristics of O-GlcNAcylation face the challenges owing to low stoichiometric ratio, rapid cycling dynamics, and extremely lack of enrichment method. In this project, we will prepare thermosensitive polymer modified by novel scissionable staudinger reagent for efficient, highly selective, and reversible O-GlcNAcylated proteins/peptides enrichment from complex samples. The novel Staudinger reagent will not noly be used to selectively reversible release enrichment of O-GlcNAc-modified proteins/peptides for mass spectrometry(MS) identification, but also enhance its hydrophobicity results in remarkably increasing sensitivity and MS signal intensity. The thermosensitive polymer will achieve the enrichment procedure in homogeneous solution, which can avoid resistance to mass transfer, accelerate the reaction rate and significantly improve enrichment speed and efficiency, the established enrichment method, combined with bio-mass spectrometry, will be applied to identify O-GlcNAc modification sites in breast cancer, aiming at providing technical support for the research of anticancer drugs.
蛋白质O-GlcNAc修饰水平及位点的改变影响着细胞内几乎所有生理活动。然而以生物质谱为工具的O-GlcNAc修饰研究,仍然面临着修饰丰度低、动态变化、非修饰肽段干扰等问题,因此高效的富集方法成为O-GlcNAc修饰研究的关键。我们拟将新型Staudinger分子与温敏聚合物温度响应沉淀性质相结合,建立一种可以高效、稳定、可逆的对O-GlcNAc修饰富集鉴定的新方法。新型Staudinger分子不仅可以将富集到的O-GlcNAc修饰蛋白/肽段可逆释放用于位点鉴定,而且肽段疏水性的增强将显著改善其在质谱中的信号。以温敏聚合物作为富集基质,实现了在均相体系中对O-GlcNAc修饰蛋白/肽段的富集,显著降低固相载体富集的传质阻力与空间位阻,将大幅提高富集反应的速率和效率。该方法与生物质谱相结合,用于研究乳腺癌中O-GlcNAc修饰位点及表达量的改变,为研发新的抗癌药物提供技术支撑。

结项摘要

针对项目书中的四点研究目标,我们1)创新性地合成了具有超高水溶性的温度响应载体材料,建立了均相反应富集的新策略。他们通过调节富集体系的温度,可准确控制载体的溶解性:即富集时,载体完全溶解,与目标蛋白/肽段形成均相体系,降低富集反应的界面传质阻力,提高反应速率和富集效率。富集完成后改变体系温度可引发载体自组装,载体从溶液中完全沉淀,从而实现简单高效的样品回收。该温度敏感均相反应体系成功应用于在转录调控、营养代谢、信号转导、蛋白降解等生物过程中均发挥重要作用的O-GlcNAc修饰糖蛋白的富集,经质谱鉴定得到超过1700个可信度高的O-GlcNAc修饰蛋白,从而获得目前细胞水平研究中最大规模的O-GlcNAc数据集2)合成了一种新型的功能化温度敏感型聚合物PNIPAM-HRP-Staudinger,该聚合物对翻译后修饰蛋白的检测灵敏度放大超过100倍。结合体内代谢标记技术与蛋白印迹技术实现了对叠氮类生物分子的多级放大检测。对于项目计划书中描述的4点要求已经超额完成,项目执行期间还详细的考察了材料的物理性能、富集条件等,同时还利用功能性温度敏感型聚合物制备了“化学western”抗体,用于超灵敏检测叠氮标记的翻译后修饰蛋白。经过2015-2017三年实施,本项目进展顺利,已发表基金署名SCI收录论文6篇,其中Analytical Chemistry 2篇、Talanta 1篇、Anal Bioanal Chem 1篇、中国科学2篇;申请专利两三项,已授权一项,超额完成了项目计划书规定的指标。

项目成果

期刊论文数量(5)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(3)
Preparation of polymer brushes grafted graphene oxide by atom transfer radical polymerization as a new support for trypsin immobilization and efficient proteome digestion
原子转移自由基聚合制备聚合物刷接枝氧化石墨烯作为胰蛋白酶固定化和高效蛋白质组消化的新载体
  • DOI:
    10.1007/s00216-017-0417-4
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    Anal Bioanal Chem
  • 影响因子:
    4.3
  • 作者:
    Cong Guo;Xinyuan Zhao;Wanjun Zhang
  • 通讯作者:
    Wanjun Zhang
Synthesis of a Highly Azide-Reactive and Thermosensitive Biofunctional Reagent for Efficient Enrichment and Large-Scale Identification of O‑GlcNAc Proteins by Mass Spectrometry
合成高度叠氮化物反应性和热敏性生物功能试剂,用于通过质谱法有效富集和大规模鉴定 O-GlcNAc 蛋白
  • DOI:
    10.1021/acs.analchem.6b04960
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    Analytical chemistry
  • 影响因子:
    7.4
  • 作者:
    Wanjun Zhang;Tong Liu;Hangyan Dong
  • 通讯作者:
    Hangyan Dong
A novel strategy for global mapping of O-GlcNAc proteins and peptides using selective enzymatic deglycosylation, HILIC enrichment and mass spectrometry identification
利用选择性酶促去糖基化、HILIC 富集和质谱鉴定对 O-GlcNAc 蛋白和肽进行全局作图的新策略
  • DOI:
    dx.10.1016/j.talanta.2017.03.049
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    Talanta
  • 影响因子:
    6.1
  • 作者:
    Bingquan Shen;Wanjun Zhang;Zhaomei Shi
  • 通讯作者:
    Zhaomei Shi
A Novel Method for Analysis of Tyrosine Phosphopeptides Based on a Centrifugal Enrichment Device
基于离心富集装置的酪氨酸磷酸肽分析新方法
  • DOI:
    10.1016/s1872-2040(17)61042-9
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    CHINESE JOURNAL OF ANALYTICAL CHEMISTRY
  • 影响因子:
    1.2
  • 作者:
    SUN Jie;ZHANG Wan-Jun;SHI Zhao-Mei;QIN Wei-Jie
  • 通讯作者:
    QIN Wei-Jie
Sensitive Western-Blot Analysis of Azide-Tagged Protein Post Translational Modifications (PTMs) Using Thermo-responsive Polymer Self-assembly
使用热响应聚合物自组装对叠氮标记蛋白翻译后修饰 (PTM) 进行灵敏的蛋白质印迹分析
  • DOI:
    10.1021/acs.analchem.7b04531
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    Analytical chemistry
  • 影响因子:
    7.4
  • 作者:
    Tong Liu;Wanjun Zhang;Zheng Zhang;Ming-Li Chen
  • 通讯作者:
    Ming-Li Chen

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其他文献

通过资产证券化解决小额贷款公司融资困境——以中和农信小额贷款资产支持专项计划为例
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  • 通讯作者:
    邢珺
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  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
    林汉川
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  • 发表时间:
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  • 作者:
    林汉川;张万军;杨柳
  • 通讯作者:
    杨柳

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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