长臂虾总科(十足目,真虾下目)分子系统学及其演化机制初探

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    41406147
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    25.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    D0604.生物海洋学与海洋生物资源
  • 结题年份:
    2017
  • 批准年份:
    2014
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2015-01-01 至2017-12-31

项目摘要

Palaemonoidea Rafinesque, 1815 is one of the most speciose superfamilies of Caridea, Decapoda, Crustacea. Palaemonoidean shrimps are distributed worldwide, in marine, brackish and freshwater habitats. Furthermore, the Palaemonoidea is an important crustacean group in shallow water and coast, even encountered in deep sea and groundwater, with high diversity in both morphology and lifestyle. It has a great significance for ecology, biodiversity and systematics studies, and some palaemonoidean species are of important economic value. However, since erected, the taxonomic studies of the Palaemonoidea were largely based on the morphological characteristics, remaining many controversies about its phylogeny and evolutionary process unsolved. Therefore, based on abundant fresh specimens and adequate collections of literatures, this project will carry out a comprehensive investigation on the molecular systematics of the Palaemonoidea to elucidate the phylogenetic relationships among the affiliated taxa of this superfamily. In addition, we attempt to explore the origination and evolutionary mechanism by incorporating morphological, ecological, paleontological and zoogeographical data, and to provide new insights and evidence into the classification of this controversial superfamily. This study aims to assist with the conservation and exploitation of marine biodiversity, and to provide basic information for the further approaches of oceanological and biological researches.
长臂虾总科隶属于甲壳动物亚门,十足目,真虾下目,是真虾下目种类最丰富的总科之一,世界性分布,海洋、半咸水和淡水环境中都有生活,是浅海和近岸重要的甲壳动物类群,甚至在深海和地下水体中也有发现,形态和生活方式多样,具有重要的生态学、生物多样性和系统学研究意义,部分种类还具有很高的经济价值。然而长臂虾总科建立至今,主要是基于形态学方面的研究,关于其系统发育和演化过程,目前尚有颇多争论。本项目将在收集掌握大量新鲜标本和文献资料的基础上,对长臂虾总科进行全面的分子系统学研究,阐明长臂虾总科内部分类单元之间的系统发育关系,并尝试通过结合形态学、生态学、古生物学和动物地理学等数据,探讨长臂虾总科的起源和演化机制,为分类系统的划分提供新的观点和依据。本研究旨在服务于海洋生物多样性的保护和开发工作,也为海洋科学和生命科学的进一步研究提供基础资料。

结项摘要

长臂虾总科隶属于甲壳动物亚门,十足目,真虾下目,是真虾下目种类最丰富的总科之一,世界性分布,海洋、半咸水和淡水环境中都有生活,形态和生活方式多样,具有重要的生态学、生物多样性和系统学研究意义,部分种类还具有很高的经济价值。然而长臂虾总科建立至今,主要是基于形态学方面的研究,关于其系统发育和演化过程,目前尚有颇多争论。本研究在收集和掌握大量资料和标本的基础上,采用分子系统学方法对长臂虾总科内部系统发育关系及其分化历史进行了研究。多基因联合的系统发育分析显示叶颚虾科和膜角虾科嵌套在隐虾亚科内部,其科级分类地位不被支持,这一结果与幼体形态学的证据相一致。而拟贝隐虾科与隐虾亚科的系统发育关系较远,其分类学地位还有待于进一步探索。结合形态学、生态学等一系列证据,我们对共栖生活的长臂虾类的分化历史进行了推测。分析显示相同或相似共栖宿主的隐虾类,可能由不同的分化途径演化而来,彼此之间的系统发育关系可能并不十分亲密。而“宿主转移”现象很可能在隐虾类的演化过程中十分常见,有时具有不同共栖宿主的隐虾类可能来自于一个较近的共同祖先。此外,基于形态和分子证据,我们建立了深海长臂虾一新属,深岩虾属Bathymenes Kou, Li & Bruce, 2016和近钩岩虾属1新种,维纳斯近钩岩虾Philarius venustus Kou & Li, 2016。

项目成果

期刊论文数量(5)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
A new palaemonid shrimp of the "Philarius gerlachei (Nobili, 1905) species complex" (Crustacea: Decapoda: Palaemonidae) from Hainan Island, South China Sea
南海海南岛“Philarius gerlachei (Nobili, 1905)物种复合体”中的一新长臂虾科虾(甲壳纲:十足目:长臂虾科)
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    Raffles Bulletin of Zoology
  • 影响因子:
    1.1
  • 作者:
    Kou Qi;Li Xinzheng
  • 通讯作者:
    Li Xinzheng
Phylogeny of Indo-West Pacific pontoniine shrimps (Crustacea: Decapoda: Caridea) based on multilocus analysis
基于多位点分析的印度-西太平洋桥虾(甲壳纲:十足目:Caridea)系统发育
  • DOI:
    10.1111/jzs.12108
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    Journal of Zoological Systematics and Evolutionary Research
  • 影响因子:
    1.9
  • 作者:
    Gan Zhi Bin;Li Xin Zheng;Chan Tin-Yam;Chu Ka Hou;Kou Qi
  • 通讯作者:
    Kou Qi
Divergent evolutionary pathways and host shifts among the commensal pontoniine shrimps: a preliminary analysis based on selected Indo-Pacific species
共生桥虾之间不同的进化途径和宿主转移:基于选定的印度太平洋物种的初步分析
  • DOI:
    10.1007/s13127-014-0198-y
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    Organisms, Diversity and Evolution
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Kou Qi;Li Xin-Zheng;Chan Tin-Yam;Chu Ka Hou
  • 通讯作者:
    Chu Ka Hou
Re-evaluation of the systematic status of two deep-water recorded Periclimenes species (Decapoda : Palaemonidae), with a preliminary analysis on the evolution of certain echinoid-associated palaemonid shrimps and related taxa
重新评估两种深水记录的拟虾类(十足目:长虾科)的系统地位,并对某些与海胆相关的长虾类和相关类群的进化进行初步分析
  • DOI:
    10.1071/is15064
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    Invertebrate Systematics
  • 影响因子:
    2.2
  • 作者:
    Kou Qi;Li Xinzheng;Gan Zhibin
  • 通讯作者:
    Gan Zhibin
Designation of a new genus Bathymenes for the deep-sea pontoniine shrimps of the 'Periclimenes alcocki species group' (Decapoda, Caridea, Palaemonidae), with a checklist of the species assigned to the genus
为“Periclimenes alcocki 物种组”(十足目、Caridea、Palaemonidae)的深海浮桥虾指定一个新属 Bathymenes,并附有分配给该属的物种清单
  • DOI:
    10.1007/s00343-015-4359-4
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    Chinese Journal of Oceanology and Limnology
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Kou Qi;Li Xinzheng;Bruce Ale;er J.
  • 通讯作者:
    er J.

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其他文献

海南岛三亚珊瑚礁区大型底栖动物群落特征
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    海洋科学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    张宝琳;寇琦;甘志彬;许鹏
  • 通讯作者:
    许鹏
Biodiversity variability of macrobenthic in the Yellow Sea and East China Sea between 2001 and 2011
2001-2011年黄海和东海大型底栖动物生物多样性变化
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    Zoological Systematics
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    寇琦;隋吉星;甘志彬;张宝琳
  • 通讯作者:
    张宝琳

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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