川榛居群遗传多样性及与近缘种的系统发育关系研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31500555
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    20.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1611.经济林学
  • 结题年份:
    2018
  • 批准年份:
    2015
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2016-01-01 至2018-12-31

项目摘要

Corylus kweichowensis Hu is the Chinese unique plant resources, which has high economic and cultivated values. It has good characteristics as a parent material to cultivate new hazel varieties, especially suitable for cultivation in the south of China. C. kweichowensis Hu is mainly in wild state distribution now, which has not been effective developed and utilized. It’s population genetic diversity of group level has not been studied until now. In addition, there is a controversial taxonomic relationship between C. kweichowensis Hu and C. heterophylla Fisch with similar morphological characteristics. In this project, the genetic variation on group level of Corylus will be investigated by using morphological markers, SSR, AFLP molecular markers with nuclear ITS and chloroplast DNA sequences methods. Phylogenetic tree and network diagram will be constructed. Meanwhile,the ancient haplotype and distribution will also be determined. We will analysiz the distribution of original group and phylogenetic relationship of these two germplasm. The comprehensive evaluation data of genetic diversity can be obtained through this project, which can puts forward the feasible strategy of protection for C. kweichowensis Hu. The resluts of this project can also provide some evidence to elucidate the evolutionary relationship between C. kweichowensis Hu and C. heterophylla Fisch.
川榛(Corylus kweichowensis Hu )是我国特有的榛属植物资源,具有较高的经济价值和育种价值,是培育适合南方栽培的榛子新品种的良好亲本材料。川榛目前呈野生状态分布,没有进行有效的开发利用,其居群水平的遗传多样性尚未有研究。另外,对形态特征较为相近的川榛和平榛之间的分类学关系也存在着争议。针对上述问题,本研究拟利用形态标记、SSR、AFLP分子标记结合核ITS和叶绿体DNA序列,研究川榛居群的遗传变异水平;同时构建系统发育树及网络图,确定古老单倍型及其分布地,分析川榛和平榛的原始类群及系统进化情况。通过研究可以获得川榛资源遗传多样性的综合评价数据,为川榛资源的保护提出可行的策略,同时阐明川榛和平榛的系统进化关系。

结项摘要

榛子是重要的经济树种,其果实是世界四大坚果之一,营养丰富,用途广泛,经济价值高。宝贵的资源是育种的基础,川榛(Corylus kweichowensis Hu)是我国目前最有生产价值和育种潜力的榛种之一。本研究利用SSR分子标记对川榛居群的遗传多样性情况进行了检测,结果表明川榛居群表现出较高的遗传多样性,遗传分化系数(FST)和AMOVA分析均表明川榛居群的遗传变异主要发生在居群内个体间,居群间遗传变异较低。居群间存在较高的基因流。根据居群的遗传多样性情况,提出了优先就地保护的居群;利用1对ITS序列和5对叶绿体DNA序列,对榛属植物进行遗传多样性和系统发育分析,基于核ITS序列获得的网络关系基本符合当前的形态学分类和系统发育关系,基于叶绿体的单倍型分布与地理分区密切相关;利用2b-RAD 测序获得的SNP 位点,解析洲际分离的榛属形态模式和进化史。结果表明榛属和虎榛子属最近共祖时间为53.7Ma,中新世中期至上新世,榛属物种快速分化,分析证明中国西南地区为世界榛属植物最可能的祖先分布区,榛属物种洲际间断分布的过程中,经历了多次迁移与隔离事件。两条重要的长距离迁移路线导致榛属植物从东亚扩散到北美洲和欧洲。本项研究为我国野生川榛资源的保护以及开发利用奠定了基础,相关利用工作已经启动,我们已经选出了多个川榛的优良单株,并开展了杂交育种工作。

项目成果

期刊论文数量(7)
专著数量(0)
科研奖励数量(1)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
大别山野生川榛坚果主要性状分析及评价
  • DOI:
    10.13430/j.cnki.jpgr.2017.04.004
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    植物遗传资源学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    王陆军;赵天田;马庆华;肖正东;王贵禧
  • 通讯作者:
    王贵禧
中国特有种川榛的地理分布格局与气候环境因子的关系分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    植物资源与环境学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    王陆军;赵天田;马庆华;肖正东;王贵禧
  • 通讯作者:
    王贵禧
平榛ChWRKY28基因克隆及表达模式分析
  • DOI:
    10.13275/j.cnki.lykxyj.2016.02.016
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    林业科学研究
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    赵天田;梁丽松;马庆华;王贵禧
  • 通讯作者:
    王贵禧
Resolving the Speciation Patterns and Evolutionary History of the Intercontinental Disjunct Genus Corylus (Betulaceae) Using Genome-Wide SNPs.
利用全基因组 SNP 解析洲际分离属榛属(桦科)的物种形成模式和进化历史
  • DOI:
    10.3389/fpls.2018.01386
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    Frontiers in plant science
  • 影响因子:
    5.6
  • 作者:
    Yang Z;Zhao TT;Ma QH;Liang LS;Wang GX
  • 通讯作者:
    Wang GX
Comparative Genomics and Phylogenetic Analysis Revealed the Chloroplast Genome Variation and Interspecific Relationships of Corylus (Betulaceae) Species.
比较基因组学和系统发育分析揭示了榛属(桦科)物种的叶绿体基因组变异和种间关系
  • DOI:
    10.3389/fpls.2018.00927
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    Frontiers in plant science
  • 影响因子:
    5.6
  • 作者:
    Yang Z;Zhao T;Ma Q;Liang L;Wang G
  • 通讯作者:
    Wang G

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其他文献

冷藏桃果实醇酰基转移酶基因的克隆及对外源乙烯的响应表达
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    林业科学研究
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    王贵章;陈新;赵天田;梁丽松;马庆华;王贵禧
  • 通讯作者:
    王贵禧
Analysis of SSR information in the pistil transcriptome and the development and characterization of novel tri-nucleotide SSR markers in Corylus
榛子雌蕊转录组SSR信息分析及新型三核苷酸SSR标记的开发和表征
  • DOI:
    10.17660/ejhs.2019/84.5.7
  • 发表时间:
    2019-11
  • 期刊:
    European Journal of Horticultural Science
  • 影响因子:
    0.9
  • 作者:
    赵天田;马庆华
  • 通讯作者:
    马庆华

其他文献

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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