小麦体细胞杂种渐渗系的遗传分析及外源DNA渐渗引起的遗传和表观遗传变异研究

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31271707
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    83.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1307.作物基因组及遗传学
  • 结题年份:
    2016
  • 批准年份:
    2012
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2013-01-01 至2016-12-31

项目摘要

Somatic hybridization, which could circumvent barriers of sexual hybridization, provides an alternative route to introgression. Broad phenotypic variations such as salt and drought tolerance, disease resistance, long spike, large grain, dwarfism, awnless and high quality were induced in derivatives of an asymmetric somatic hybridization involving bread wheat (Triticum aestivum cv. JN177) and tall wheatgrass (Thinopyrum ponticum Podp); however, how did these variations happened was unknown. Previous research indicated that except for the direct transfer of a few donor genes, the somatic hybridization also induced abundant variations to the genome of the introgression lines. Among those new traits induced by somatic hybridization, some controlled by QTL and others controlled by single gene variations. To explore the relationship between the novel traits of the introgression lines and the genetic and epigenetic variations induced by somatic hybridization, genetic analysis and preliminary gene mapping will be performed on some superior agronomic traits of 6 somatic hybridization introgression lines with different phenotypic traits, the variations in genomic sequences, gene expression and DNA methylation pattern of the 6 introgression lines will also be exploited by using a spectrum of DNA profiling techniques.
体细胞杂交可以克服远缘不亲和障碍, 是构建外源DNA渐渗系的有效方法。普通小麦"济南177"与UV照射的长穗偃麦草原生质体的非对称体细胞杂交产生了一系列具有新的农艺性状的渐渗系,包括耐盐、抗旱、抗病、大穗、大粒、矮秆、无芒、优质等。然而,这些性状是如何产生的目前还不清楚。前期研究表明体细胞杂交除了可以转移少量供体基因以外, 还诱导受体基因组产生大量的变异;体细胞杂种渐渗系不但可以产生由主效QTL控制的性状, 还诱导功能基因等位变异产生新性状。为了深入了解体细胞杂交渐渗产生的优异农艺性状与遗传和表观遗传变异的关系, 我们拟对6个具有不同重要性状的新种质进行遗传分析和渐渗/变异主效基因的定位;同时, 利用多种分子标记技术对这些具有不同农艺性状的体细胞杂种渐渗系的基因组序列、基因表达以及DNA甲基化修饰变异进行检测, 探讨由"体细胞基因组冲击"引起的遗传和表观遗传变异与小麦优异新种质形成的关系。

结项摘要

小麦与长穗偃麦草的非对称体细胞杂交产生了一系列具有新的农艺性状的渐渗系,包括耐盐、抗旱、抗病、大穗、大粒、矮秆、无芒、优质等。我们选取6种代表性渐渗系进行新性状的遗传分析并检测了渐渗系基因组的遗传和表观遗传变异。我们针对籽粒大小、耐盐碱、抗秆锈病、无芒等性状构建了遗传群体,利用SR3/济南17的DH群体检测到5个效应值较大的耐盐QTL,其中5A染色体上的QTL即之前定位到的耐盐主效QTL;发现SR3中1B和2B染色体上各有一个抗杆锈病基因;通过SR3/济南17的DH群体还定位到5A染色体末端的一个芒抑制基因B1。通过对6种渐渗系的遗传和表观遗传变异分析发现,渐渗系中存在广泛的遗传和表观遗传变异,主要包括序列丢失、基因表达调控改变、胞嘧啶甲基化修饰模式变化和逆转录转座子激活等,新表型的产生可能与外源遗传物质渐渗导致的遗传和表观遗传变异有关。

项目成果

期刊论文数量(8)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Isolation and characterization of novel Glu-St1 alleles from Pseudoroegneria spicata and Pd. strigosa.
Pseudoroegneria spicata 和 Pd 中新型 Glu-St1 等位基因的分离和表征。
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    Genetica
  • 影响因子:
    1.5
  • 作者:
    Yu Liang;Lei Sun;Guangmin Xia;Shuwei Liu
  • 通讯作者:
    Shuwei Liu
Characterization of low molecular weight gluteninsubunit genes from Pseudoroegneriaspicata and Pd. strigosa
来自 Pseudoroegneriaspicata 和 Pd 的低分子量麦谷蛋白亚基基因的表征。
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    Journal of Applied Genetics
  • 影响因子:
    2.4
  • 作者:
    Yu Liang;Daozheng Yang;Guangmin Xia;Shuwei Liu
  • 通讯作者:
    Shuwei Liu
Induced and constitutive DNA methylation in a salinity tolerant wheat introgression line.
耐盐小麦渗入系中的诱导和组成型 DNA 甲基化。
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    Plant and Cell Physiology
  • 影响因子:
    4.9
  • 作者:
    Lina Kong;Wenlong Yu;Guangmin Xia;Shuwei Liu
  • 通讯作者:
    Shuwei Liu
WRKY transcription factors in wheat and their induction by biotic and abiotic stress.
小麦中的 WRKY 转录因子及其生物和非生物胁迫的诱导。
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    Plant Molecular Biology Reporter
  • 影响因子:
    2.1
  • 作者:
    Chen Meng;Lumin Qin;Lina Kong;Guangmin Xia
  • 通讯作者:
    Guangmin Xia
Novel LMW glutenin subunitgenes from wild emmer wheat (Triticumturgidum ssp. dicoccoides) inrelation to Glu-3 evolution
野生二粒小麦(Triticumturgidum ssp. dicoccoides)中与 Glu-3 进化相关的新型 LMW 麦谷蛋白亚基基因
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    Development Genes and Evolution
  • 影响因子:
    2.4
  • 作者:
    Daozheng Yang;Lei Sun;Guangmin Xia;Shuwei Liu
  • 通讯作者:
    Shuwei Liu

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  • 通讯作者:
    张忠和

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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