中国西北突厥语族人群混合起源的遗传学解析

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基本信息

  • 批准号:
    31671297
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    60.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0605.遗传与进化
  • 结题年份:
    2020
  • 批准年份:
    2016
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2017-01-01 至2020-12-31

项目摘要

The Turkic speaking people between eastern and western Eurasia are the most typical mixed population, and are the major population along the Silk Road. Most ethnic populations between Turkey and Gansu of China speak Turkic languages, including eight populations in China. We have finished genotyping 2707 Y chromosomes from 11 Turkic populations residing in China and Russia and found that they were complicatedly mixed by eastern and western Eurasians. However, the origin and genetic admixture history of Turks are not clear. The Bronze Age Chermurchek Culture is believed to be the origin of Turkic culture. We plan to analyze the whole Y chromosomes and whole genomic polymorphisms associated to important traits for 20 human bone samples from Chermurchek to trace the origin of this ancient population and its possible relationship to modern Turkic people. We will also analyze the whole Y chromosomes and SNP capture 10K genome-wide sequences on 200 individuals picked out of 2707 samples. By comparison to the neighboring ethnic groups like Sino-Tibetan and Indo-European, we hope to reveal the precise ages and routes of the gene flows into Turkic populations. This study will be helpful to understand the origin of population along the Silk Road, adaption and epidemiology in Central Asia, etc.
欧亚东西方之间的突厥系群是最典型的混合人群,是丝绸之路上的主要人口成分。土耳其到中国甘肃之间的大多数民族都属于突厥系,包括中国维吾尔等8个民族群体。我们前期对中俄两国突厥系11人群2707个现代样本进行了Y染色体分型,发现突厥由东西方不同的遗传谱系组成。然而,突厥系群的起源和群体混合历史不清。新疆北部的青铜时代切木尔切克文化被认为很可能是突厥的源头。本项目拟对切木尔切克文化的20个人骨DNA样本进行Y染色体全测序和全基因组重要性状相关多态性分析,研究该古群体源于何处,是否与现代突厥族群有关。从现代突厥已分型样本中挑选200个关键样本进行Y染色体全测序,以及全基因组10K SNPs捕获测序。通过比较突厥和周边族群,揭示各成分融入突厥的时间序列和基因流路线。本研究将对丝绸之路人群起源和东西方融合、环境适应和流行病病因等问题也具参考价值。

结项摘要

欧亚东西方之间的突厥系群是最典型的混合人群,是丝绸之路上的主要人口成分。土耳其到中国西部之间的大多数民族都属于突厥系,包括中国维吾尔等8个民族群体。通过与哈萨克斯坦、俄罗斯、蒙古相关团队的合作,特别是与哈萨克斯坦科学院建立深度合作关系,我们系统性地分析了中国西北68个古代样本(以洋海遗址为主)以及中国西北和周边国家的一万多个相关现代人群样本,建立Y染色体深度测序数据库。通过比较突厥和周边族群,揭示了各成分融入突厥的时间序列和基因流路线。研究发现,突厥语族群体是一个群体遗传结构高度混合、遗传地理分布极其不均匀的群体,在遗传结构上缺乏一致性。突厥语族中最早的成分是大约14000年前中亚远古成分和西伯利亚扩散成分,并促成美洲人群起源。从约6000年前开始受到来自东北的原始蒙古语族通古斯语族群体的影响,约4000年前开始受到大量汉藏语系族群的影响。本研究将对丝绸之路人群起源和东西方融合、环境适应和流行病病因等问题也具参考价值。

项目成果

期刊论文数量(20)
专著数量(2)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Whole sequence analysis indicates a recent southern origin of Mongolian Y-chromosome C2c1a1a1-M407
全序列分析表明蒙古Y染色体C2c1a1a1-M407最近起源于南方
  • DOI:
    10.1007/s00438-017-1403-4
  • 发表时间:
    2018-06-01
  • 期刊:
    MOLECULAR GENETICS AND GENOMICS
  • 影响因子:
    3.1
  • 作者:
    Huang, Yun-Zhi;Wei, Lan-Hai;Li, Hui
  • 通讯作者:
    Li, Hui
Uniparental Genetic Analyses Reveal the Major Origin of Fujian Tanka from Ancient Indigenous Daic Populations
单亲遗传分析揭示了福建疍家的主要起源于古代土著傣族群体
  • DOI:
    10.13110/humanbiology.91.4.05
  • 发表时间:
    2020-08
  • 期刊:
    Human Biology
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    XiaoQin Luo;PanXin Du;LingXiang Wang;BoYan Zhou;YuChun Li;HongXiang Zheng;LanHai Wei;JunJian Liu;Chang Sun;HaiLiang Meng;JingZe Tan;WenJing Su;ShaoQing Wen;Hui Li
  • 通讯作者:
    Hui Li
Reconstruction of Y-chromosome phylogeny reveals two neolithic expansions of Tibeto-Burman populations
Y染色体系统发育的重建揭示了藏缅人口的两次新石器时代扩张
  • DOI:
    10.1007/s00438-018-1461-2
  • 发表时间:
    2018-10-01
  • 期刊:
    MOLECULAR GENETICS AND GENOMICS
  • 影响因子:
    3.1
  • 作者:
    Wang, Ling-Xiang;Lu, Yan;Li, Hui
  • 通讯作者:
    Li, Hui
Paternal gene pool of Malays in Southeast Asia and its applications for the early expansion of Austronesians
东南亚马来人父系基因库及其在南岛人早期扩张中的应用
  • DOI:
    10.1002/ajhb.23486
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    American Journal of Human Biology
  • 影响因子:
    2.9
  • 作者:
    Sun Jin;Wei Lan-Hai;Wang Ling-Xiang;Huang Yun-Zhi;Yan Shi;Cheng Hui-Zhen;Ong Rick Twee-Hee;Saw Woei-Yuh;Fan Zhi-Quan;Deng Xiao-Hua;Lu Yan;Zhang Chao;Xu Shu-Hua;Jin Li;Teo Yik-Ying;Li Hui
  • 通讯作者:
    Li Hui
A Genome-Wide Association Study of Basal Transepidermal Water Loss Finds that Variants at 9q34.3 Are Associated with Skin Barrier Function
基础经表皮失水的全基因组关联研究发现 9q34.3 的变异与皮肤屏障功能相关
  • DOI:
    10.1016/j.jid.2016.11.030
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    Journal of Investigative Dermatology
  • 影响因子:
    6.5
  • 作者:
    Zhang Manfei;Li Bingjie;Wu Sijie;Tan Jingze;Yang Yajun;Marini Aless;ra;Vierkotter Andrea;Zhang Juan;Li Hui;Schikowski Tamara;Jin Li;Krutmann Jean;Wang Sijia
  • 通讯作者:
    Wang Sijia

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  • 发表时间:
    2017
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  • 作者:
    李辉;刘哲;罗至利;孙国栋;俞鹏飞
  • 通讯作者:
    俞鹏飞

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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