北方近岸环境中寡毛类纤毛虫的多样性与系统学

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31702009
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    25.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0402.动物系统与分类
  • 结题年份:
    2020
  • 批准年份:
    2017
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2018-01-01 至2020-12-31

项目摘要

The marine planktonic ciliates play very important roles in the transfer of energy and matter through the microbial food web by consuming a majority of the primary production. As an important component of marine microplankton, oligotrich ciliates are quite rich in species and quantity. However, due to various reasons, the study on the systematics and biodiversity of this group is still insufficient. So far, domestic related work is mainly confined to the southern tropical and subtropical waters. Study of oligotrichs in the northern coast is not enough. Many taxa are still unknown, which should be further explored. This study will focus on the oligotrich ciliates in the Chinese northern coastal environment, with the Yellow Sea and Bohai as the main sample collection sites. Meanwhile, the related literatures will be sorted out in large scale, and more detailed morphological features will be described by combining of protargol impregnation. This work will complement and refine the DNA database of oligotrich ciliates, by providing multi-gene information of some key taxa as well as secondary structures of rRNA. Finally, to further discuss the species diversity and phylogeny, their morphology, phylogenetic topology and secondary structures will be comprehensively analyzed.
海洋浮游生纤毛虫在水体微型食物网及生态系统的物质循环和能量流动中起重要的枢纽作用。作为其中重要组分的寡毛类纤毛虫,在种类数量及丰度上均相当丰富,却因多种原因,国际间对该类群的系统学及生物多样性的研究仍存在严重不足,国内工作也主要局限于南方热带-亚热带水体,北方近岸环境中的寡毛类研究不够深入,大量类群依然不明,亟待深入探索。本研究将以黄渤海为主要采集地,对我国北方近岸环境内的寡毛类纤毛虫展开调查,利用现代银染技术对该类群给出更详细的形态学描述;补充完善寡毛类DNA“分子种库”:提供重要类群的分子信息(SSU rRNA、LSU rRNA、ITS1-5.8S-ITS2等基因);预测ITS、rRNA高变区的二级结构;综合其形态学、分子系统树、二级结构等信息对该类群的多样性展开探讨及对其系统学的混乱进行厘清,为阐明该类生物的系统进化取得若干有意义的进展。

结项摘要

本项目涉及海洋水体微型食物网的重要组分——寡毛类纤毛虫的生物多样性调查及其系统学研究。该类群在国际间仍有大量未知种有待发现,因此,该类群的分类学、分子系统学、地理区系分布等亟待探讨。为此,三年来,本课题主要围绕北方近岸的各类水体开展了对寡毛类纤毛虫的形态分类、核酸测序、系统亲缘关系等方面的研究。主要成果包括:(1)共采集并鉴定40余种寡毛亚纲及环毛亚纲纤毛虫,其中有5个新种,并对十余种形态学信息不详的种类重新厘定、补充纤毛图式及统计学资料。(2)完成了50余种/种群的DNA提取工作,基于SSU rRNA基因及多基因如LSU rRNA基因信息,对多个种类的系统学进行了探讨。(3)对系统地位存有争议的Halteria属,利用转录组数据对其系统地位进行了补充研究。(4)上述工作已形成8篇研究论文,其中7篇发表在国际主流刊物上。

项目成果

期刊论文数量(8)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Morphology and molecular phylogeny of two new species of Spirostrombidium (Ciliophora, Oligotrichia), with a key to the species of Spirostrombidium
螺菌属两个新种(纤毛纲、少毛纲)的形态学和分子系统发育,以及螺菌属物种的关键
  • DOI:
    10.1080/14772000.2018.1484393
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    Systematics and Biodiversity
  • 影响因子:
    1.9
  • 作者:
    Wang Rui;Song Wen;Yi Zhenzhen;Al Rasheid Khaled A S;Hu Xiaozhong
  • 通讯作者:
    Hu Xiaozhong
Taxonomy and phylogeny of two poorly studied genera of marine oligotrich ciliates including descriptions of two new species: Cyrtostrombidium paraboreale sp. n. and Apostrombidium orientale sp. n. (Ciliophora: Spirotrichea)
两个研究不足的海洋寡毛纤毛虫属的分类学和系统发育,包括两个新物种的描述:Cyrtostrombidium paraboreale sp。
  • DOI:
    10.1016/j.ejop.2019.05.001
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    European Journal of Protistology
  • 影响因子:
    2.9
  • 作者:
    Song Wen;Xu Dapeng;Zhang Qianqian;Liu Weiwei;Warren Alan;Song Weibo
  • 通讯作者:
    Song Weibo
Redescription of fve tintinnine ciliates (Alveolata: Ciliophora: Oligotrichea) from coastal waters of Qingdao, China
中国青岛沿海水域五种丁丁纤毛虫(Alveolata:Ciliophora:Oligotrichea)的重新描述
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    Marine Life Science & Technology
  • 影响因子:
    5.7
  • 作者:
    Yang Bai;Rui Wang;Wen Song;Toshikazu Suzuki;Xiaozhong Hu
  • 通讯作者:
    Xiaozhong Hu
Further analyses on the evolutionary "key-protist" Halteria (Protista, Ciliophora) based on transcriptomic data
基于转录组数据进一步分析进化“关键原生生物”Halteria(Protista、Ciliophora)
  • DOI:
    10.1111/zsc.12380
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    Zoologica Scripta
  • 影响因子:
    2.5
  • 作者:
    Wang Chundi;Yan Ying;Chen Xiao;Al Farraj Saleh A;El Serehy Hamed A;Gao Feng
  • 通讯作者:
    Gao Feng
Morphology of Three Aloricate Choreotrich ciliates, Including Description of a New Species Parastrombidinopsis costalis sp. n. (Ciliophora, Choreotrichia), and phylogeny of the genus Parastrombidinopsis
三种有丝藻纤毛虫的形态学,包括新种 Parastrombidinopsis costalis sp 的描述。
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    ACTA PROTOZOOLOGICA
  • 影响因子:
    0.5
  • 作者:
    Wen SONG;Jiamei LI;Yaoyao HUANG;Xiaozhong HU;Weiwei LIU;Khaled A. S. AL-RASHEID;Miao MIAO
  • 通讯作者:
    Miao MIAO

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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