Kdm2b基因与毗邻长非编码RNA调控大脑皮层发育的研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31471361
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    82.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1204.组织器官发育及体外构建
  • 结题年份:
    2018
  • 批准年份:
    2014
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2015-01-01 至2018-12-31

项目摘要

Kdm2b, a component of Polycomb repressive complex, plays essential roles in self-renewal and differentiation of embryonic and adult stem cells, reprogramming of somatic cell and tumorigenesis. Long non-coding RNAs are recently found to be key regulators in a variety of developmental and pathogenetic processes. We recently found that the long transcript of Kdm2b and its neighboring long non-coding RNA are specifically expressed in the intermediate neural progenitor cells and newborn neurons, and perturbations of their expression in vivo and in vitro significantly affect neuronal differentiation and migration, indicating their roles in cell-fate transitions of neural progenitor cells in cortical development. In this project, we will study their roles in cell-fate specification of neural progenitor cells using comprehensive cell biology, biochemical, embryonic and genetic means. Kdm2b knock-in mouse lines will be established to study its detail expression pattern and map the cell-fate lineage during cortical development. In utero electroporation, gene-ablation mouse model and in vitro culture of neural progenitor cells will be used to study whether the two molecules are indeed essential for cortical development. Furthermore, we will study whether the transcriptions of lncRNA-M14 and different isoforms of Kdm2b are mutually regulated; and the underlying epigenetic mechanisms that they utilize to regulate chromatin modification and gene expressions. This study will expand our knowledge regarding epigenetic regulation in organogenesis and regeneration, and may therefore have potential clinical implications.
多梳抑制复合物组分Kdm2b在胚胎和成体干细胞自我更新和分化、体细胞重编程以及肿瘤发生中起核心作用。长非编码RNA也在器官发育、多种生理和病理过程发挥重要的基因调控功能。我们的前期研究发现Kdm2b的长编码产物和其毗邻长非编码RNA特异表达于胚胎期小鼠大脑皮层的中间神经前体细胞与新生神经元,体内和体外实验证明干预它们的表达能显著影响神经元的分化和迁移,提示这两个分子在皮层发育中发挥关键的命运决定功能。本研究将应用遗传学示踪方法,阐明这两个分子在小鼠皮层发育中的表达情况和子代细胞的命运;应用小鼠胚胎子宫内电转、基因剔除小鼠和神经前体细胞体外分化平台研究这两个分子在神经前体细胞命运决定和皮层发育中的作用;还将研究Kdm2b不同转录产物与毗邻长非编码RNA间的表达调控关系,以及它们影响细胞命运决定的表观遗传学机制。上述研究能加深对表观遗传调控机制在器官发育和再生过程中的认识。

结项摘要

多梳抑制复合物组分Kdm2b在胚胎和成体干细胞自我更新和分化、体细胞重编程以及肿瘤发生中起核心作用。长非编码RNA也在器官发育、多种生理和病理过程发挥重要的基因调控功能。我们的前期研究发现Kdm2b的长编码产物和其毗邻长非编码RNA-LncKdm2b特异表达于胚胎期小鼠大脑皮层的中间神经前体细胞与新生神经元,体内和体外实验证明干预它们的表达能显著影响神经元的分化和迁移,提示这两个分子在皮层发育中发挥关键的命运决定功能。组织原位杂交发现LncKdm2b在皮层投射神经元的早期分化过程中瞬时表达。LncKdm2b通过顺式调节控制基因Kdm2b的转录,LncKdm2b具有内在激活功能,并通过与蛋白质hnRNPAB结合促进Kdm2b基因启动子区域形成允许转录的染色质环境。谱系追踪和表型分析实验表明,LncKdm2b和Kdm2b在皮层投射神经元正确分化和迁移过程中发挥至关重要的作用。此外,KDM2B依赖于其富含亮氨酸的重复序列(LRR)发挥作用,但与多梳抑制复合物PRC1相关的功能无关。这些发现揭示了一种依赖于lncRNA的皮层神经元分化调控机制,加深了对表观遗传调控机制特别是lncRNA在器官发育和再生过程中的认识。主要研究成果曾在Neuron和Cell Stem Cell送外审(peer review);现在eLife修回,获得了较为正面的评价,即将发表的可能性很大。在本项目的部分资助下,本课题组还发表SCI研究论文4篇,还有一篇研究论文在FASEB Journal修回。培养了数名研究生。多次参加国际和国内会议并做报告。

项目成果

期刊论文数量(4)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Paired related homeobox 1 transactivates dopamine D2 receptor to maintain propagation and tumorigenicity of glioma-initiating cells
配对相关同源盒 1 反式激活多巴胺 D2 受体以维持神经胶质瘤起始细胞的增殖和致瘤性
  • DOI:
    10.1093/jmcb/mjx017
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    Journal of Molecular Cell Biology
  • 影响因子:
    5.5
  • 作者:
    Li Yamu;Wang Wen;Wang Fangyu;Wu Qiushuang;Li Wei;Zhong Xiaoling;Tian Kuan;Liu Ying;Li Shu;Zhou Yan;Zeng Tao;Gao Liang;Zeng Tao;Liu Ying;Li Shu;Jiang Xiaobing;Du Guangwei;Zhou Y
  • 通讯作者:
    Zhou Y
Combination of the Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats (CRISPR)-Associated 9 Technique With the PiggyBac Transposon System for Mouse In Utero Electroporation To Study Cortical Development
将成簇规则间隔短回文重复序列 (CRISPR) 相关的 9 技术与 PiggyBac 转座子系统相结合,用于小鼠子宫内电穿孔研究皮质发育
  • DOI:
    10.1002/jnr.23776
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    Journal of Neuroscience Research
  • 影响因子:
    4.2
  • 作者:
    Cheng Man;Mu Lili;Wang Fangyu;Li Wei;Zhong Xiaoling;Liu Xuan;Shen Wenchen;Liu Ying;Zhou Yan;Jin Xubin;Liu Y;Zhou Y
  • 通讯作者:
    Zhou Y
Mechanisms of Long Non-Coding RNAs in the Assembly and Plasticity of Neural Circuitry
长非编码RNA在神经回路组装和可塑性中的机制
  • DOI:
    10.3389/fncir.2017.00076
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    Frontiers in Neural Circuits
  • 影响因子:
    3.5
  • 作者:
    Wang A;Wang J;Liu Y;Zhou Y
  • 通讯作者:
    Zhou Y
HMGA2 sustains self-renewal and invasiveness of glioma-initiating cells
HMGA2 维持神经胶质瘤起始细胞的自我更新和侵袭
  • DOI:
    10.18632/oncotarget.9744
  • 发表时间:
    2016-07-12
  • 期刊:
    Oncotarget
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Zhong X;Liu X;Li Y;Cheng M;Wang W;Tian K;Mu L;Zeng T;Liu Y;Jiang X;Yu L;Gao L;Zhou Y
  • 通讯作者:
    Zhou Y

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其他文献

长非编码RNA-Tug1在大脑皮层发育过程中的初步研究
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    --
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    --
  • 作者:
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  • 通讯作者:
    周严
C/C++程序静态内存泄漏警报自动确认方法
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    软件学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    李筱;周严;李孟宸;陈园军;Xu Guoqing;王林章;李宣东
  • 通讯作者:
    李宣东

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发育中大脑皮层中间前体细胞的命运决定
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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