组蛋白乙酰转移酶在抗衰老中的作用机制研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31771519
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    57.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0705.细胞衰老、死亡及自噬
  • 结题年份:
    2021
  • 批准年份:
    2017
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2018-01-01 至2021-12-31

项目摘要

Histone acetylation is one of the major factors that regulate chromatin structure. It plays important role in gene regulation, DNA damage response etc. It participates in heterochromatin assembly, cell cycle regulation and cellular differentiation etc. The histone deacetylation families, like Sirtuins, were considered to be important factors for aging regulation. However, there were no reports about histone acetyltransferase, who catalyze histone acetylation, would regulate aging. Primarily, we found two specific inhibitors of HATs extend the replicative lifespan of yeast and human cell lines. Herein, we propose that HATs are the important factors of aging regulation and inhibit / down regulate HATs will extend replicative lifespan of yeast and human cell lines. In this project, we will employ self-developed microfluidic chip for yeast aging, use budding yeast as the main model organism, and construct the quantitative down regulated strains. We will study the role of HATs in aging and its molecular mechanisms through -omics analysis, cellular and molecular technologies and systems biology approaches etc. We also will construct the mathematical models, develop the theory of aging regulation of HATs. This study will identify new target for anti-aging drug development.
组蛋白乙酰化是调控染色体结构的主要方式之一,其在基因表达调控、DNA损伤修复、DNA复制等过程发挥重要作用,参与异染色质的组装、细胞周期控制、细胞分化等生物学过程。组蛋白去乙酰化酶家族被认为是调控细胞衰老的重要蛋白。然而,催化组蛋白乙酰化的组蛋白乙酰转移酶(HATs)和衰老之间的关系未见报道。前期工作中我们发现组蛋白乙酰转移酶的两个特异性抑制剂显著延长酵母细胞和人衰老细胞系的复制寿命。因此,我们提出“组蛋白乙酰转移酶是调控衰老过程的重要因子,敲降组蛋白乙酰转移酶可以延长细胞复制寿命”的科学假说。本项目拟采用自主研发的用于衰老研究的微流芯片技术,以芽殖酵母为主要实验模型,建立定量敲降菌株。应用组学分析、细胞和分子生物学方法、系统生物学方法等技术,研究组蛋白乙酰转移酶在衰老过程中的作用,及其上下游调控的分子机制,建立可靠的数学模型,完善乙酰化调控衰老过程的理论,为抗衰老药物的研发提供新的靶点。

结项摘要

组蛋白乙酰化是调控染色体结构的主要方式之一,其在基因表达调控、DNA损伤修复、DNA复制等过程发挥重要作用,参与异染色质的组装、细胞周期控制、细胞分化等生物学过程。衰老过程中可表现出组蛋白表达水平改变和组蛋白乙酰化水平失衡。故调节组蛋白乙酰化水平的两类关键酶组蛋白乙酰转移酶(histone acetyl transferase,HATs) 和组蛋白去乙酰化酶(histone deacetylases,HDACs)被认为是调控细胞衰老的重要蛋白。其中HATs和衰老之间的关系未见研究报道。本研究采用自主研发的衰老研究微流芯片技术(岛型芯片和U型芯片),以芽殖酵母为主要实验模型,建立定量敲降菌株;同时应用人胚肺成纤维细胞制备衰老研究模型。应用组学分析、细胞和分子生物学方法、系统生物学方法等技术,研究组蛋白乙酰转移酶在衰老过程中的作用,及其上下游调控的分子机制,建立可靠的数学模型,完善乙酰化调控衰老过程的理论,最终揭示组蛋白乙酰化转移酶对细胞寿命的调控作用机制。研究结果提示系列HAT抑制剂(没食子儿茶素没食子酸酯EGCG、漆树酸anacardic acid(AA)、大蒜素garcinol和姜黄素curcumin)或Gcn5和Ngg1突变杂合体可以显著延长酵母寿命(30%~50%),EGCG和AA可以延长衰老细胞系的分裂次数。类似的,在人类细胞系(2BS和WI-38)中,HAT抑制剂和选择性RNAi介导的Gcn5或Ngg1敲降亦可降低衰老标记物SA-β-Gal的水平并促进衰老细胞的增殖。此外,研究结果发现寿命延长与组蛋白H3而不是H4的乙酰化有关。其具体机制为H3K9和H3K18的乙酰化修饰。研究结果还发现,热量限制延长寿命的能力是Gcn5-,Ngg1-,H3K9-和H3K18-依赖性的。转录组分析结果显示,这些变化与热休克相关,与衰老的酵母和蠕虫的基因表达谱呈负相关。通过生物信息学分析,我们还发现下游受HAT调控的影响因子包括MSN2/4,RTG3,MET32/4,GCN4等;HAT抑制可激活人细胞系中的亚端粒基因。综上,抑制HAT GCN5可能是延长寿命的有效手段,本研究也为抗衰老以及改善衰老相关疾病的药物研发和治疗提供了新的靶点和视野。

项目成果

期刊论文数量(8)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(3)
Berberine ameliorates cellular senescence and extends the lifespan of mice via regulating p16 and cyclin protein expression
小檗碱通过调节 p16 和细胞周期蛋白表达改善细胞衰老并延长小鼠寿命
  • DOI:
    10.1111/acel.13060
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    Aging Cell
  • 影响因子:
    7.8
  • 作者:
    Dang Yao;An Yongpan;He Jinzhao;Huang Boyue;Zhu Jie;Gao Miaomiao;Zhang Shun;Wang Xin;Yang Baoxue;Xie Zhengwei
  • 通讯作者:
    Xie Zhengwei
Prognostic model of patients with liver cancer based on tumor stem cell content and immune process.
基于肿瘤干细胞含量和免疫过程的肝癌患者预后模型
  • DOI:
    10.18632/aging.103832.
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    Aging
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Weikaixin Kong;Miaomiao Gao;Yuchen Jin;Weiran Huang;Zhuo Huang;Zhengwei Xie
  • 通讯作者:
    Zhengwei Xie
Expression and Prognostic Characteristics of Ferroptosis-Related Genes in Colon Cancer
结肠癌铁死亡相关基因的表达及预后特征
  • DOI:
    10.3390/ijms22115652
  • 发表时间:
    2021-05-26
  • 期刊:
    International Journal of Molecular Sciences
  • 影响因子:
    5.6
  • 作者:
    Zhu J;Kong W;Xie Z
  • 通讯作者:
    Xie Z
Identification of Key Genes Related to Lung Squamous Cell Carcinoma Using Bioinformatics Analysis
利用生物信息学分析鉴定与肺鳞状细胞癌相关的关键基因
  • DOI:
    10.1088/1367-2630/14/3/033019
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    International Journal of Molecular Sciences
  • 影响因子:
    5.6
  • 作者:
    Gao Miaomiao;Kong Weikaixin;Huang Zhuo;Xie Zhengwei
  • 通讯作者:
    Xie Zhengwei
Prediction of drug efficacy from transcriptional profiles with deep learning
通过深度学习从转录谱预测药物疗效
  • DOI:
    10.1038/s41587-021-00946-z
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    Nature Biotechnology
  • 影响因子:
    46.9
  • 作者:
    Zhu Jie;Wang Jingxiang;Wang Xin;Gao Mingjing;Guo Bingbing;Gao Miaomiao;Liu Jiarui;Yu Yanqiu;Wang Liang;Kong Weikaixin;An Yongpan;Liu Zurui;Sun Xinpei;Huang Zhuo;Zhou Hong;Zhang Ning;Zheng Ruimao;Xie Zhengwei
  • 通讯作者:
    Xie Zhengwei

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代谢网络中的噪声效应
  • DOI:
    10.1088/1674-1056/18/12/069
  • 发表时间:
    2009-12-01
  • 期刊:
    Bioinformatics
  • 影响因子:
    5.8
  • 作者:
    李政言;谢正伟;陈同;欧阳颀
  • 通讯作者:
    欧阳颀

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PAK1调节线粒体功能从而延长寿命的作用及其机制
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  • 批准年份:
    2021
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    58 万元
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    面上项目

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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