果桑响应桑椹菌核病菌Scleromitrula shiraiana侵染的抗性机制研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31800544
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    24.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1609.森林保护学
  • 结题年份:
    2021
  • 批准年份:
    2018
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2019-01-01 至2021-12-31

项目摘要

Mulberry popcorn disease is one of the most important diseases for fruits production and become the bottleneck problem of mulberry industry development. Breeding resistant varieties is the most economical and effective means to prevent the disease. However, the research progress on molecular resistant mechanism against the disease was slow. Scleromitula shiraiana was the main isolate of popcorn disease fruits collected from Hubei and Guangdong provinces, and high resistant (Morus macroura) and high susceptible (Big 10) mulberry cultivars were screened in previous study. This research will analyze the differences of histopathology, physiology and biochemistry, and metabolites changes between high resistant and high susceptible cultivars during S.shiraiana infection process, to reveal the mechanism of different mulberry cultivars in response to pathogen infection and the change of metabolites during mulberry fruit decayed. Based on the transcriptomics and metabolomics sequencing datas, the signal pathways and genes closely related to disease resistance reaction will be predicted, and the NBS-LRR gene family associated with popcorn disease resistance will be identified and cloned, and the specific tissue expression patterns of the gene family will be analyzed. This research will provide a basis for deep analysis of mulberry and sclerotinia interactions and molecular mechanism of mulberry resistance, and provide a new way for disease control and disease resistance breeding.
桑椹菌核病是果桑上最重要病害之一,是限制果桑产业发展的瓶颈问题,培育抗病品种是防治该病最经济、有效的手段,然而针对果桑抗桑椹菌核病分子机制研究进展缓慢。申请人前期研究中发现桑椹核地杖菌Scleromitula shiraiana是湖北、广东省桑椹菌核病的主要分离物,长果桑和大10高抗和高感菌核病。本项目拟研究S.shiraiana侵染过程中,不同抗性果桑品种组织结构、生理生化及代谢产物变化,揭示果桑响应菌核病菌的侵染机制及桑椹小核果溃解的代谢产物变化;基于不同时间点转录组和代谢组,全面分析参与果桑抗病相关的信号途径和关键基因;鉴定并克隆与抗病相关的NBS-LRR类基因家族,并对其进行生物信息学及时空表达模式分析。本研究为深入分析果桑与菌核病菌互作及果桑抗病分子机制奠定基础,最终为病害防控及抗病育种提供依据。

结项摘要

桑椹菌核病是果桑最重要病害之一,是制约果桑产业发展的瓶颈问题,培育抗病品种是防治该病最经济、有效的手段,然而针对果桑抗桑椹菌核病分子机制研究进展缓慢。本研究从湖北、重庆、广东、浙江省采集病样,发现Ciboria carunculoides引起的小粒型菌核病在各产区广泛分布。从分离的病菌中选取单孢分离的桑椹缩小型菌核病菌Scleromitrula shiraiana和首次获得的可培养的桑椹小粒型菌核病菌Ciboria carunculoides进行了全基因组测序分析。成功实现了S. shiraiana菌核形成相关基因Mmk1的CRISPR/Cas9系统编辑,并根据其基因组和转录组测序结果分析了菌核形成相关MAPK基因,为后续设计阻断菌核形成的杀菌剂提供了靶标位点,为病害防控提供了新的途径。通过组织染色、石蜡切片和扫描电镜进行侵染观察发现病菌可通过气孔、表皮毛侵入桑果与已报道只通过花序侵染不同。C. carunculoides胁迫下,POD酶活呈显著增加趋势;CAT酶在感病初期变化不明显,但在发病严重时,酶活达到高峰期,在核小果形成菌核后酶活又下降;SOD酶活力呈下降趋势。用生物信息学方法,筛选获得165个桑树NB-ARC蛋白序列,构建ML系统进化树结果显示NBS-LRR类基因主要分为 2个大的聚类组。通过不同发病级别桑椹小粒型菌核病菌C. carunculoides和高感果桑(粤椹大10)的互作转录组数据及高抗果桑品种(长果桑)转录组数据,对664个共表达的差异基因进行分析,有7个抗病相关基因发现显著上调表达,7个发现显著下调表达,其GO功能富集在生物学过程方面,主要富集在有机氮化合物分解代谢过程,离子运输和碳水化合物衍生物分解代谢过程。在分子功能方面,主要富集在主要活性跨膜转运蛋白活性。KEGG富集主要涉及类单萜生物学合成、植物和病菌互作Plant-及植物MAPK信号通路三个方面。结合NBS-LRR类抗病基因分析及RT-qPCR结果,我们筛选出3个与抗病相关基因,为后续抗病基因功能验证提供了依据。

项目成果

期刊论文数量(1)
专著数量(0)
科研奖励数量(1)
会议论文数量(0)
专利数量(5)
桑椹菌核病菌实时荧光定量PCR检测体系的建立和应用
  • DOI:
    10.13802/j.cnki.zwbhxb.2021.2020247
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    植物保护学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    朱志贤;董朝霞;莫荣利;胡兴明;于 翠
  • 通讯作者:
    于 翠

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其他文献

长期偏施氮肥对桑园土壤氨氧化微生物的影响
  • DOI:
    10.11838/sfsc.1673-6257.20149
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    中国土壤与肥料
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    于翠;李欣;朱志贤;董朝霞;莫荣利;李勇;邓文;熊超;胡兴明
  • 通讯作者:
    胡兴明
X射线诊断所致受检者剂量的表征与监测方法
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    《中国辐射卫生》
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    朱志贤;郑钧正;唐文祥;韩发明;何韦川
  • 通讯作者:
    何韦川
模拟人体反散射材料试验研究
  • DOI:
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  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    《中国辐射卫生》
  • 影响因子:
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  • 作者:
    朱志贤;唐文祥;韩发明;何韦川;郑钧正
  • 通讯作者:
    郑钧正
X射线诊断所致受检者体表剂量分布特性研究
  • DOI:
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  • 发表时间:
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  • 期刊:
    《中华放射医学与防护杂志》
  • 影响因子:
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  • 作者:
    朱志贤;郑钧正;唐文祥;韩发明;何韦川
  • 通讯作者:
    何韦川
乳腺X射线摄影所致受检者乳腺平均剂量调查研究
  • DOI:
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  • 期刊:
    《中华放射医学与防护杂志》
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  • 作者:
    郑钧正;朱志贤;唐文祥;韩发明;何韦川
  • 通讯作者:
    何韦川

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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