HLA基因多态性介导的高危型EB病毒慢性感染及其交互作用与鼻咽癌发病关系的前瞻性流行病学研究

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基本信息

  • 批准号:
    81872700
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    58.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H3010.非传染病流行病学
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2018
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2019-01-01 至2022-12-31

项目摘要

Genetic and environmental factors are causally related to nasopharyngeal carcinoma(NPC).We have identified that Human leukocyte antigen (HLA) polymorphisms, EBV chronic activation and high-risk EBV subtype (RPMS1 G>A variation) were the risk factors of NPC and also found that HLA genotype had related with different EBV subtype infections. Thus, we put forward the hypothesis that high-risk HLA genotype may interact and mediate EBV chronic infection and EBV high-risk subtype infection, and HLA high-risk genotypes collaborate with EBV to induce the occurrence of NPC. However, the hypothesis still has not been confirmed due to lack of epidemiological evidences. Based on the established NPC screening cohort (60000 participants) and the EBV different reactivation cohort (1800 participants), we plan to carry out a multi-phase study to explore the synergy function for NPC between HLA genetic and EBV infection. Genotyping of HLA SNPS and EBV high-risk SNP in saliva are tested using the Agena Bioscience Mass Array platform, EBV DNA and genome expression in the local nasopharynx are detected with real-time PCR and gene expression profile chip, respectively. Causal mediation analysis methods are used to perform joint interaction and mediation analysis of the effects of HLA genetic variants and EBV high-risk SNP or EBV chronic infection on NPC. Specifically, we decompose the total effect of each HLA genetic variant in the possible presence of the EBV genetic variant and EBV chronic infection on NPC into four components, with which the host variant may interact. With the longitudinal data analysis model, the affection for EBV high-risk subtype infection of nasopharyngeal mucosal and genome expression will be analyzed. This study will provide the prospective evidence for revealing the genetic-variant-by-EBV interaction and EBV mediation of genetic effects on NPC risk and help to illustrate the EBV high-risk subtype natural infection history and carcinogenic mechanism.
遗传和环境因素在鼻咽癌(NPC)发病中起重要作用。我们已证实人类白细胞抗原(HLA)基因多态性、EBV慢性激活和EBV高危亚型(RPMS1基因G>A突变)感染是其危险因素。还发现二者间存在相关关系。因此提出HLA介导EBV慢性感染和选择感染高危型EBV两条通路而致癌,并产生交互作用。但该假说尚缺乏流行病学证据。在前期建立6万NPC筛查及0.18万 EBV不同再激活人群队列基础上,拟开展多阶段研究。质谱技术检测白细胞HLA易感基因位点和唾液EBV亚型,定量PCR和基因表达谱芯片检测鼻咽脱落细胞EBVDNA和基因组表达。结合病因中介模型分析HLA-EBV协同作用的超额发病风险并分解其中的交互和中介作用大小。运用纵向数据模型分析EBV高危型在鼻咽粘膜癌变前感染规律及其对基因组影响。本研究为阐明基因-病毒交互作用与NPC发病关系提供前瞻性证据,有助揭示EBV高危亚型感染自然史及其致癌机制。

结项摘要

本研究首先开展了基于鼻咽癌高发区的病例对照设计,利用多重扩增子捕获技术检测已报道的鼻咽癌易感基因,多因素分析发现位于HLA-DQA1基因3’非翻译区的rs1064994和HCG9基因区域的rs5009448碱基变异与鼻咽癌发病风险相关。并在一个EBV不同再激活水平的人群队列中发现此两个易感位点与EBV再激活水平降低相关,得出此两个易感基因通过介导EB病毒再激活水平降低鼻咽癌发病风险的结论。进而通过中介效应分析发现,位点rs1064994对鼻咽癌的总超额相对风险度为-0.61,其中基因-病毒交互效应为-0.20,占比33.34%;中介效应为-0.26,占比42.48%。rs5009448对鼻咽癌的总超额相对风险度为-0.29,基因病毒交互效应为-0.17,占比57.86%,二者的中介效应为-0.07,占比25.26%。在不同再激活水平的队列人群中,利用飞行质谱方法检测唾液标本中的EB病毒亚型,EB病毒的高危亚型(BALF2基因162215 C>A,162476 T>C和163364C>T)与EB病毒的再激活水平无显著关联。对两阶段病例对照研究的关联分析和检测EB病毒高危亚型的人群中基因关联分析进行meta分析发现,位点rs3095341,rs4122190,rs9366775和rs4999716是潜在的鼻咽癌与高危EB病毒亚型共同差异位点。最终,对不同EB病毒再激活水平的队列人群进行随访,发现不同EB病毒再激活水平的人群中EB病毒DNA含量存在着显著的差异,证实EB病毒的再激活导致鼻咽原发部位EB病毒负荷增加及感染上皮细胞机会增加的病因学结论。本研究为阐明基因-病毒交互作用与鼻咽癌发病关系提供前瞻性证据,分析了基因-病毒交互作用和中介效应的大小,为鼻咽癌的防治提供了重要的流行病学证据和病因学证据。整个项目在SCI杂志发表论文11篇,申请专利2项,培养研究生4名。

项目成果

期刊论文数量(11)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(2)
Adiponectin suppresses tumor growth of nasopharyngeal carcinoma through activating AMPK signaling pathway.
脂联素通过激活AMPK信号通路抑制鼻咽癌肿瘤生长
  • DOI:
    10.1186/s12967-022-03283-0
  • 发表时间:
    2022-02-14
  • 期刊:
    Journal of translational medicine
  • 影响因子:
    7.4
  • 作者:
    Zhang Z;Du J;Shi H;Wang S;Yan Y;Xu Q;Zhou S;Zhao Z;Mu Y;Qian C;Zhao AZ;Cao S;Li F
  • 通讯作者:
    Li F
Prospective assessment of a nasopharyngeal carcinoma risk score in a population undergoing screening
接受筛查人群鼻咽癌风险评分的前瞻性评估
  • DOI:
    10.1002/ijc.33424
  • 发表时间:
    2020-12-24
  • 期刊:
    INTERNATIONAL JOURNAL OF CANCER
  • 影响因子:
    6.4
  • 作者:
    Chen,Geng-Hang;Liu,Zhiwei;Cao,Su-Mei
  • 通讯作者:
    Cao,Su-Mei
Plasma Epstein-Barr virus DNA and risk of nasopharyngeal carcinoma in a prospective seropositive population.
血浆 Epstein-Barr 病毒 DNA 与前瞻性血清阳性人群中鼻咽癌的风险
  • DOI:
    10.1186/s12885-021-08408-0
  • 发表时间:
    2021-06-01
  • 期刊:
    BMC cancer
  • 影响因子:
    3.8
  • 作者:
    Chen WJ;Xu WN;Wang HY;Chen XX;Li XQ;Xie SH;Lin DF;Cao SM
  • 通讯作者:
    Cao SM
Association Between Traditional Herbal Diet and Nasopharyngeal Carcinoma Risk: A Prospective Cohort Study in Southern China.
传统草药饮食与鼻咽癌风险之间的关联:中国南方的一项前瞻性队列研究
  • DOI:
    10.3389/fonc.2021.715242
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    Frontiers in oncology
  • 影响因子:
    4.7
  • 作者:
    Lyu YH;Lin CY;Xie SH;Li T;Liu Q;Ling W;Lu YQ;Cao SM;Lin AH
  • 通讯作者:
    Lin AH
Smoking can increase nasopharyngeal carcinoma risk by repeatedly reactivating Epstein-Barr Virus: An analysis of a prospective study in southern China
吸烟可通过反复激活EB病毒增加鼻咽癌风险:对中国南方一项前瞻性研究的分析
  • DOI:
    10.1002/cam4.2083
  • 发表时间:
    2019-05-01
  • 期刊:
    CANCER MEDICINE
  • 影响因子:
    4
  • 作者:
    Hu, Ting;Lin, Chu-Yang;Cao, Su-Mei
  • 通讯作者:
    Cao, Su-Mei

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  • 通讯作者:
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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