复杂酶反应体系的抑制效应解析与关键路径的加速

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    20976051
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    33.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    B0812.生物化工与合成生物工程
  • 结题年份:
    2012
  • 批准年份:
    2009
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2010-01-01 至2012-12-31

项目摘要

将多种不同类型和功能的酶组合成一个能够高效完成特定目标产物合成的复杂酶反应体系是生物工程中极具挑战性的课题之一。多种酶之间复杂的相互作用、抑制效应和限制性因素的解析以及基于解析结果的过程强化是复杂酶反应体系研究面临的主要问题。本项目以DNA扩增前提材料脱氧核苷三磷酸(deoxynucleoside triphosphate, dNTP)的生物全合成反应网络为模型,对复杂酶特别是关键路径酶反应之间的相互作用、抑制效应与反应协同等因素进行动力学分析,找出特定复杂酶反应体系的限制性因素;采用基于进化树分析和分子定向修饰的非特异性酶基因替换策略对复杂酶反应体系进行简化;基于上述研究,对复杂酶反应网络进行有效的协同与优化,实现体系限制性步骤的加速。研究结果对一般性复杂酶反应体系的抑制效应机理和限制性步骤加速具有普遍意义,为该体系在大尺度生物基产品生产过程上的应用提供基础研究支持。

结项摘要

本课题以生物全合成反应网络和生物质降解酶系为模型体系,对复杂酶反应之间的抑制效应、酶相互作用、反应协同等限制性因素进行了研究,对复杂酶反应体系的关键路径酶进行了改造,降低了产物抑制并实现了限制性步骤的加速。获得了4种具有明显底物非特异性的关键路径酶:对dADP、dGDP、dCDP、dTDP四种不同底物具有活性的丙酮酸激酶;对果聚寡糖、葡萄糖寡糖两种菊糖具有明显活性的葡萄糖糖化酶;对蔗糖和果聚寡糖具有明显活性的蔗糖酶;对纤维素末端糖苷键和内部糖苷键具有明显活性的纤维素内切酶。获得了4条非特异性关键路径酶反应体系:从4种脱氧核糖二磷酸(dADP、dGDP、dCDP、dTDP)底物用丙酮酸激酶转为4中脱氧核苷三磷酸(dATP、dGTP、dCTP、dTTP);用非特异性葡萄糖糖化酶同步催化菊芋中的果聚寡糖和淀粉中的葡聚寡糖同时生成果糖和葡萄糖单糖;用酿酒酵母中的蔗糖酶催化菊芋中的果聚寡糖生成果糖并发酵生成乙醇;用纤维素内切酶降解磷酸浸泡纤维素,在末端和内部纤维素糖苷键同时作用。在微生物与酶工程国际权威学术期刊上发表本课题相关联的SCI论文16篇。

项目成果

期刊论文数量(22)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Effect of calcium carbonate in waste office paper on enzymatic hydrolysis efficiency and enhancement procedures
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  • DOI:
    10.1007/s11814-010-0365-6
  • 发表时间:
    2011-02
  • 期刊:
    Korean Journal of Chemical Engineering
  • 影响因子:
    2.7
  • 作者:
    Wang, Xiusheng;Song, Andong;Li, Liping;Li, Xiaohong;Zhang, Rui;Bao, Jie
  • 通讯作者:
    Bao, Jie
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  • DOI:
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  • 发表时间:
    2013-05-01
  • 期刊:
    BIORESOURCE TECHNOLOGY
  • 影响因子:
    11.4
  • 作者:
    Zhao, Kai;Qiao, Qingan;Bao, Jie
  • 通讯作者:
    Bao, Jie
METABOLISM Biofuel via biodetoxification
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  • DOI:
    10.1038/nchembio.355
  • 发表时间:
    2010-05-01
  • 期刊:
    NATURE CHEMICAL BIOLOGY
  • 影响因子:
    14.8
  • 作者:
    Dong, Hongwei;Bao, Jie
  • 通讯作者:
    Bao, Jie
Photo-fermentation of Rhodobacter sphaeroides for hydrogen production using lignocellulose-derived organic acids
利用木质纤维素衍生的有机酸光发酵球形红杆菌产氢
  • DOI:
    10.1016/j.procbio.2010.08.017
  • 发表时间:
    2010-12
  • 期刊:
    Process Biochemistry
  • 影响因子:
    4.4
  • 作者:
    Zhu, Zhinan;Shi, Jiping;Zhou, Zhihua;Hu, Fengxian;Bao, Jie
  • 通讯作者:
    Bao, Jie
A Simplified Filter Paper Assay Method of Cellulase Enzymes Based on HPLC Analysis
基于高效液相色谱分析的纤维素酶的简化滤纸测定方法
  • DOI:
    10.1007/s12010-012-9673-0
  • 发表时间:
    2012-04
  • 期刊:
    Applied Biochemistry and Biotechnology
  • 影响因子:
    3
  • 作者:
    Chu, Deqiang;Deng, Hongbo;Zhang, Xiaoxi;Zhang, Jian;Bao, Jie
  • 通讯作者:
    Bao, Jie

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其他文献

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木质纤维素生产手性乳酸的生物合成路径与抗逆机制研究
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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