个体水平的病毒动力学对传染病宏观疫情的影响研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    11171268
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    46.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    A0604.生物与生命科学中的数学
  • 结题年份:
    2015
  • 批准年份:
    2011
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2012-01-01 至2015-12-31

项目摘要

传统的病毒动力学模型虽能刻画药物治疗的效果、给出病毒是否消除的阈值,但忽略了药物在体内的代谢过程。 然而,药物在体内的代谢过程符合药物动力学特征,不同的给药方式(给药时间、给药剂量)和病人的依从性对体内药物浓度的有着重要的影响。本课题针对艾滋病的治疗和传播建立个体内的病毒动力学和药物动力学的复合模型,研究该一般的脉冲系统的基本再生算子,研究不同给药方式对阈值的影响。分析治疗的最佳起始时间、耐药性与治疗效果的量化关系。建立传染病传播的最优控制模型,优化组合防治措施,探明影响宏观疫情发展的主要因素。在此基础上建立基于个体的病毒动力学和基于群体的传染病宏观感染的耦合模型,研究个体的抗病毒治疗对整体疫情、群体水平的防治的影响。分析艾滋病个体的治疗数据和宏观疫情数据,确定模型参数,预测HIV病毒演化或传染病疫情的发展趋势,探讨防治措施的有效性,为公共卫生部门有效防治传染病提供定量的决策依据。

结项摘要

同一水平的模型都有成熟的结果,但是如何耦合不同水平的模型是有挑战性的问题。本项目首先建立了一般高维脉冲传染病系统的再生算子的定义和和计算方法,分析了其阈值动力学。 建立了个体内的病毒动力学与药物动力学的耦合模型,得到了决定病毒能否清除的基本再生数,探明了脉冲式的给药方案对病毒拟制的影响。建立了具有脉冲免疫效应和多菌株的HIV病毒动力学模型,探讨治疗的时间、耐药产生的机制,耐药水平对治疗效果的影响,为艾滋病病人个体的免疫治疗设计以恢复免疫重建提供了思路。 数量化控制目标和干预措施,建立了一类最优脉冲控制问题,借助变分方程给出了目标函数关于控制函数的梯度,应用基于梯度的算法得到了该脉冲系统的最优解。在传染病控制中引入了一个全新的控制 - 滑动模式控制,即当感染者的数量达到一定的阈值时启动或加强预防控制措施,得到了一类非光滑(Filippov)传染病动力学模型。 研究Filippov系统的滑动模式动力学,得到了当疾病不能消除时,感染者的数量能够稳定在期望水平的最优控制措施。建立耦合个体的病毒动力学和群体的传播动力学的桥梁,得到了基于感染年龄的PDE模型、基于个体的随机模拟模型和基于环境中自由生存的病毒/细菌的耦合模型,探讨了个体的治疗起始时刻、治疗效果与群体意义的疫情防治之间的关系,得到了当耐药后药效较好(不好)时,治疗开始的越早,实际再生数越小(大),累计发生率越低(高),累计因病死亡人数较少(多)。应用上,基于全国HIV的疫情数据库,得到了HIV感染者和艾滋病病人的空间流动网络。发展网络模型,估计系统参数,研究高危人群的流动对全国疫情的影响,进而评判防治措施的有效性,提出符合实际意义的控制方案。. 本项目达到了预期目标,在建立个体内的病毒动力学及其治疗的药物动力学的复合模型,分析一般脉冲系统的阈值动力学,耦合微观和宏观的传染病模型探明个体的抗病毒治疗对群体水平的传染病防治的影响等方面取得了实质性的进展,获得了一系列的成果,并在生物数学较高水平的国际杂志上发表。特别是在建立模型刻画国家重点关注的长潜伏期的传染病做了一系列实用性强的结论,如HIV感染者和艾滋病患者的流动模式,流动对疫情的影响对于基于地域的医疗资源的优化配置提供了思路。

项目成果

期刊论文数量(45)
专著数量(1)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
DYNAMICS OF AN INFECTIOUS DISEASES WITH MEDIA/PSYCHOLOGY INDUCED NON-SMOOTH INCIDENCE
媒体/心理导致的传染病的非平稳发病动态
  • DOI:
    10.3934/mbe.2013.10.445
  • 发表时间:
    2013-04-01
  • 期刊:
    MATHEMATICAL BIOSCIENCES AND ENGINEERING
  • 影响因子:
    2.6
  • 作者:
    Xiao, Yanni;Zhao, Tingting;Tang, Sanyi
  • 通讯作者:
    Tang, Sanyi
Modeling sexual transmission of HIV/AIDS in Jiangsu province, China
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  • DOI:
    10.1002/mma.2599
  • 发表时间:
    2013-01
  • 期刊:
    Mathematical Methods in the Applied Sciences
  • 影响因子:
    2.9
  • 作者:
    Xu Xiaxia;Xiao Yanni;Wang Ning
  • 通讯作者:
    Wang Ning
Sliding Mode Control of Outbreaks of Emerging Infectious Diseases
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  • DOI:
    10.1007/s11538-012-9758-5
  • 发表时间:
    2012-10-01
  • 期刊:
    BULLETIN OF MATHEMATICAL BIOLOGY
  • 影响因子:
    3.5
  • 作者:
    Xiao, Yanni;Xu, Xiaxia;Tang, Sanyi
  • 通讯作者:
    Tang, Sanyi
SLIDING BIFURCATIONS OF FILIPPOV TWO STAGE PEST CONTROL MODELS WITH ECONOMIC THRESHOLDS
具有经济阈值的FILIPPOV两阶段害虫防治模型的滑动分支
  • DOI:
    10.1137/110847020
  • 发表时间:
    2012-01-01
  • 期刊:
    SIAM JOURNAL ON APPLIED MATHEMATICS
  • 影响因子:
    1.9
  • 作者:
    Tang, Sanyi;Liang, Juhua;Cheke, Robert A.
  • 通讯作者:
    Cheke, Robert A.
Bifurcation analysis of a predator–prey model with anti-predator behaviour
具有反捕食者行为的捕食者-被捕食者模型的分叉分析
  • DOI:
    10.1016/j.chaos.2014.11.008
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    Chaos Solitons & Fractals
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Biao Tang;Yanni Xiao
  • 通讯作者:
    Yanni Xiao

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其他文献

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  • 通讯作者:
    肖燕妮

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融合深度学习的疫情建模与多因素共演化的动力学机制研究
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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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