青藏高原及邻近地区河谷植物小蓝雪花的谱系地理学研究

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31460050
  • 项目类别:
    地区科学基金项目
  • 资助金额:
    50.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0201.植物分类学
  • 结题年份:
    2018
  • 批准年份:
    2014
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2015-01-01 至2018-12-31

项目摘要

The uplift of QTP and the followed geographical barriers formation, drainage system change, and the climate changes during the Quaternary ice ages, had dramastically affected the speciation, divergence, immigration and distribution of plants on the QTP and in adjacent regions. Ceratostigam minus (Plumbaginaceae) is a riparian shrub widely distributed on the QTP, Himmalaya-Hengduan Mountains and Yunnan-Guizhou Plateau. In this study, we will investigate populations and collect the plant material covering its whole distribution. The phylogeograpical analysis on population genetic structure, spatial pattern of haplotypes, and time of lineage divergence will be conducted by using chloroplast non-coding spacers, nulclear genes and AFLP markers. The route and direction of immigration and expansion, possible refugia on the QTP and or HHM of this species in the glacial and interglacial phases during the Quaternary ice age will be traced. Also, the effect of historic events such as geographical barriers formation and drainage system change following the QTP uplift on the population genetic structure and extant spatial distribution will be postulated. Results of this study will supply proofs for elucidating the correlation between plant distribution and historical geography, climate change, etc. on the QTP and in adjacent regions.
青藏高原隆升与伴之而来的生物地理屏障形成、水系变迁及第四纪冰期作用深刻影响着高原及其邻近地区植物的物种形成、分化、迁移与分布。小蓝雪花是一种广泛分布于青藏高原、喜马拉雅-横断山及云贵高原中部河谷地带的灌木。本项目拟采集涵盖小蓝雪花整个分布区的居群材料,利用叶绿体和核DNA片断及AFLP分子标记对其进行谱系地理学研究。通过分析其遗传结构、单倍型的空间分布格局和谱系分化时间,追溯其在第四纪冰期-间冰期因气候变迁引起的迁移、扩散的方向和路线及其在青藏高原、喜马拉雅-横断山区的避难所的时空分布,揭示生物地理屏障的形成和水系变迁等历史事件对其遗传结构及现代分布格局的影响,进而为理解青藏高原及其邻近区域的物种分布格局与历史地质、气候变迁之间的关系提供新的证据。

结项摘要

小蓝雪花是白花丹科蓝雪花属植物,主要沿雅鲁藏布江、怒江、澜沧江、南盘江、长江上游支流(包括雅砻江、大渡河、岷江等)等河流的河谷分布。项目通过叶绿体DNA片段、核DNA的ITS序列及AFLP的谱系地理学的研究,从居群水平揭示小蓝雪花的遗传多样性、遗传结构、地理起源与分化,探讨小蓝雪花的谱系地理结构、遗传多样性分布格局,进而揭示其在青藏高原隆升、河流袭夺及第四纪冰期作用下的分布与演化历史。.结果表明,小蓝雪花在物种水平上的单倍型多样性(Hd)和遗传多样性(HT)均较高(Hd = 0.825, HT = 0.847);同时,小蓝雪花具有较高的居群间遗传分化系数(GST=0.920)。系统发育分析发现小蓝雪花的分布与河流分布有很大关系,雅鲁藏布江、澜沧江、南盘江、长江支流(金沙江、雅砻江、大渡河、岷江)等流域居群均拥有特有的单倍型。青藏高原-横断山区的高山和河流相间分布对居群间的地理隔离作用为谱系间变异的积累提供了必要的条件,进而形成了高的单倍型多态性。嵌套分支分析发现影响小蓝雪花地理结构的主要因素有异域片段化和隔离作用下受限制的基因流。小蓝雪花在冰期的分布模式是多个原位生物避难所模式。 .分歧时间分析表明雅鲁藏布江流域居群与其它河流居群的分歧时间在7.5Ma BP左右,而乃东、加察至朗县、林芝这三个居群与雅鲁藏布江其它居群的分歧时间在3.89Ma BP,青藏高原在8Ma BP,3.6Ma BP发生过剧烈的隆升,这些结果表明小蓝雪花两次种内分化均与青藏高原的隆升有一定关系。.AFLP分析后发现小蓝雪花具有两个不同的基因池,如雅鲁藏布江、澜沧江、南盘江流域河谷分布居群拥有同一个基因池,长江水系及怒江水系的居群共有一个基因池。河流袭夺不是形成小蓝雪现存遗传结构的主要原因。第四纪气候震荡在横断山区引起物种南北迁移可能是形成现存遗传结构的重要原因。横断山中部地区是小蓝雪花重要的避难所,同时避难所可能不止一个,而是存在多个。同时,不同水系居群间在地理过渡地带存在着历史的基因交流。

项目成果

期刊论文数量(11)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
哈巴雪山自然保护区野生观赏植物调查研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    中国野生植物资源
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    周玉泉;张绍辉;茶雪梅;曹文娟;孙文光;李志敏;张永洪
  • 通讯作者:
    张永洪
Yalongjiang River Has Had an Important Role in the Dispersal and Divergence of Rosa soulieana in the Hengduan Mountains of China.
雅砻江对我国横断山蔷薇的扩散和分流发挥了重要作用
  • DOI:
    10.1371/journal.pone.0158586
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    PloS one
  • 影响因子:
    3.7
  • 作者:
    Jian H;Zhang Y;Qiu X;Yan H;Wang Q;Zhang H;Sun H
  • 通讯作者:
    Sun H
Conservation implications of population genetic structure in a threatened orchid Cypripedium tibeticum
受威胁兰花西藏杓兰种群遗传结构的保护意义
  • DOI:
    10.1016/j.pld.2018.12.002
  • 发表时间:
    2019-02-01
  • 期刊:
    PLANT DIVERSITY
  • 影响因子:
    4.8
  • 作者:
    Guo, Jian-Ling;Cao, Wen-Juan;Volis, Sergei
  • 通讯作者:
    Volis, Sergei
濒危特有水生植物波叶海菜花的遗传多样性研究(英文)
  • DOI:
    10.13478/j.cnki.jasyu.2016.02.009
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    延边大学农学学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    李一贤;余艳红;张晓芸;郭建玲;孙文光;张永洪
  • 通讯作者:
    张永洪
Genetic diversity of Meconopsis integrifolia (Maxim.) Franch. in the East Himalaya-Hengduan Mountains inferred from fluorescent amplified fragment length polymorphism analysis
绿绒蒿 (Meconopsis integrifolia (Maxim.) Franch) 的遗传多样性。
  • DOI:
    10.1016/j.bse.2016.08.007
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    Biochemical Systematics and Ecology
  • 影响因子:
    1.6
  • 作者:
    Guo Jian-Ling;Zhang Xiao-Yun;Zhang Jian-Wen;Li Zhi-Min;Sun Wen-Guang;Zhang Yong-Hong
  • 通讯作者:
    Zhang Yong-Hong

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其他文献

糖芥属紫花糖芥(Erysimum funiculosum )的核型报道
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    云南师范大学学报(自然科学版)
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    陈光富;张永增;李志敏;张永洪
  • 通讯作者:
    张永洪
中国西南地区3种蝇子草属植物的核型报道
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    云南农业大学学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    王海霞;胡伸萌;底远哲;张永洪;李志敏
  • 通讯作者:
    李志敏
哈巴雪山自然保护区种子植物区系特征研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    西部林业科学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    张绍辉;陆丽珍;蒋鑫;张永洪
  • 通讯作者:
    张永洪

其他文献

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张永洪的其他基金

瑞香属和荛花属(瑞香科)的分类与系统学研究
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    31760048
  • 批准年份:
    2017
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    37.0 万元
  • 项目类别:
    地区科学基金项目
瑞香狼毒的谱系地理结构及其对历史气候条件的遗传响应
  • 批准号:
    31160045
  • 批准年份:
    2011
  • 资助金额:
    50.0 万元
  • 项目类别:
    地区科学基金项目

相似国自然基金

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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