柑桔类病毒互作以及寄主响应的分子机理研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31501611
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    18.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1401.植物病理学
  • 结题年份:
    2018
  • 批准年份:
    2015
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2016-01-01 至2018-12-31

项目摘要

Citrus viroid is one of the most important citrus pathogen in the world. The previous study showed that certain exocortis-like diseases in China were caused by some combination of citrus viroids except CEVd. Typical synergism between citrus viroids from Apscaviroid genus and antagonism between CBCVd and CEVd were also observed. In this study, viroid titer changes after complex infection will be tested through viroid infection clone and real-time RT-PCR. In addition, with the analysis of deep sequencing data of small RNA, we will verify whether the endogenous small RNA would be induced or depressed by viroid infection. Finally, the function of these small RNAs will be validated by citrus microarray and molecular hybridization. All of these will help us to explain the molecular mechanism of interaction between citrus viroids and establish the theoretical and technical foundation of citrus viroid pathogenesis, as well as providing new ideas for controlling of exocortis or other viroid diseases.
柑桔类病毒是在世界范围内广泛发生并可造成严重经济损失的柑桔病原物。前期研究发现在中国的柑桔产区,部分与裂皮病相类似的病害是由非CEVd的多种柑桔类病毒复合侵染造成的;苹果锈果类病毒属内的柑桔类病毒具有典型的协生作用;CBCVd对CEVd存在拮抗作用。本课题拟通过类病毒侵染性克隆的构建和实时荧光定量RT-PCR等技术,监控柑桔类病毒单独/复合侵染后积累量的变化。借助于小RNA深度测序及分析,明确柑桔类病毒单独/复合侵染后是否诱导/抑制柑桔内源小RNA通路。通过柑桔基因芯片、分子杂交等技术分析寄主基因表达差异,解释这些小RNA的功能。最终从基因沉默理论水平上解析柑桔类病毒之间拮抗作用和协生作用的分子机理。本项目的开展可为预防柑桔类病毒病害在我国发生流行提供理论依据和技术支撑,并可望为柑桔裂皮病及其它类病毒病害的防控提供新的思路。

结项摘要

柑桔类病毒是在世界范围内广泛发生并可造成严重经济损失的柑桔病原物。前期研究发现在中国柑桔产区,柑桔树皮裂纹类病毒(CBCVd)对柑桔裂皮类病毒(CEVd) 在田间存在拮抗作用。本课题通过CEVd和CBCVd侵染性克隆的构建和实时荧光定量PCR等技术,监控二者单独/复合侵染后积累量的变化,发现CBCVd的侵染能抑制CEVd复制积累。借助于小RNA深度测序及分析,发现CEVd和CBCVd来源的sRNA在序列同源区域显著富集。通过CEVd接种香橼3个月后转录组分析,发现寄主共有1023个基因的表达明显变化,其中基因沉默、水杨酸、基础防御等通路基因表达量上调,光合作用通路基因的表达量下降。以上结果从基因沉默理论水平解析了柑桔类病毒之间拮抗作用的分子机理。本项目的开展可为预防柑桔类病毒病害在我国发生流行提供理论依据和技术支撑,并可望为柑桔裂皮病及其它类病毒病害的防控提供新的思路。

项目成果

期刊论文数量(9)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(1)
Complete genome sequences of four isolates of Citrus leaf blotch virus from citrus in China
中国柑橘四种柑橘叶斑病病毒分离株的全基因组序列
  • DOI:
    10.1016/s2095-3119(17)61860-4
  • 发表时间:
    2018-03
  • 期刊:
    Journal of Integrative Agriculture
  • 影响因子:
    4.8
  • 作者:
    Ping Li;Min Li;Song Zhang;Jun Wang;Fangyun Yang;Mengji Cao;Changyong Zhou
  • 通讯作者:
    Changyong Zhou
Molecular characterization and phylogenetic analysis of Citrus viroid VI variants from citrus in China
中国柑橘类病毒VI变种的分子特征和系统发育分析
  • DOI:
    10.1007/s10658-017-1236-3
  • 发表时间:
    2017-05
  • 期刊:
    European Journal of Plant Pathology
  • 影响因子:
    1.8
  • 作者:
    Cao Mengji;Wu Qiong;Yang Fangyun;Wang Xuefeng;Li Ruhui;Zhou Changyong;Li Zhongan
  • 通讯作者:
    Li Zhongan
Transcriptome sequencing reveals novel Citrus bark cracking viroid (CBCVd) variants from citrus and their molecular characterization.
转录组测序揭示了柑橘类新的柑橘树皮裂裂类病毒 (CBCVd) 变体及其分子特征。
  • DOI:
    10.1371/journal.pone.0198022
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    PloS one
  • 影响因子:
    3.7
  • 作者:
    Wang Y;Atta S;Wang X;Yang F;Zhou C;Cao M
  • 通讯作者:
    Cao M
Discovery of a novel geminivirus associated with camellia chlorotic dwarf disease.
发现与茶花褪绿矮化病相关的新型双生病毒。
  • DOI:
    10.1007/s00705-018-3780-3
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    Archives of Virology
  • 影响因子:
    2.7
  • 作者:
    Zhang Song;Shen Pan;Li Min;Tian Xin;Zhou Changyong;Cao Mengji
  • 通讯作者:
    Cao Mengji
Identification and Characterization of Wheat Yellow Striate Virus, a Novel Leafhopper-Transmitted Nucleorhabdovirus Infecting Wheat.
小麦黄纹病毒的鉴定和特征,一种新型叶蝉传播的核弹状病毒感染小麦。
  • DOI:
    10.3389/fmicb.2018.00468
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    Frontiers in microbiology
  • 影响因子:
    5.2
  • 作者:
    Liu Y;Du Z;Wang H;Zhang S;Cao M;Wang X
  • 通讯作者:
    Wang X

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曹孟籍的其他基金

柑橘类病毒CBCVd诱发寄主基因沉默拮抗CEVd的分子机制研究
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2020
  • 资助金额:
    58 万元
  • 项目类别:
    面上项目

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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