利用TCRβ CDR3组库分析筛选SLE患者T细胞治疗精准靶标

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81760300
  • 项目类别:
    地区科学基金项目
  • 资助金额:
    34.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H1107.自身免疫性疾病
  • 结题年份:
    2021
  • 批准年份:
    2017
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2018-01-01 至2021-12-31

项目摘要

Currently, the main problem of SLE targeted therapy is the lack of specificity which is unable to distinguish between autoreactive lymphocyte and normal lymphocyte. How to improve precision of the target treatment becomes an important problem in treatment of SLE. In recent years, Immune Repertoire had been widely used in the development of vaccine and medicine and in the discovery of biomarkers. In our previous studies, we analyzed the changes of TCRβ CDR3 repertoire and BCR-H CDR3 repertoire from two cases of SLE patients after high dose of glucocorticoid treatment. These results suggested that only few T cells might involve in the pathogenesis of SLE, while B cell was not suitable as an accurate target due to the presence of high frequency mutation. Therefore, this project proposed a key scientific problem: how to determine the markers and characteristic CDR3 of these few T cells that involved in the pathogenesis of SLE? In order to solve the problem, this project had designed three research contents, including the analysis of homology and heterogeneity of TCRβ repertoire of Th subsets between peripheral blood and renal biopsy, screening public CDR3 from Th subsets between peripheral blood and renal biopsy and analysis of correlation between TCRβ repertoire of peripheral Th subsets and clinically relevant index scores and serological detection. The implement of this project will provide important basis data and new idea for precise targeted therapy of T cell in SLE.
当前,SLE的靶向治疗药物面临的主要问题是特异性不强,即无法区分自身反应淋巴细胞和正常淋巴细胞,如何改善靶向治疗精准度成为SLE治疗的重要问题。近年来,免疫组库被广泛应用于疫苗和医药研发、生物标志物发现。本项目在前期研究中分析了两例SLE患者TCRβ CDR3库和BCR-H CDR3库在大剂量糖皮质激素治疗后的变化,提示仅少数T细胞群体参与了SLE的发病,而B细胞由于存在高频突变不适于作为精准靶标。因此,本项目提出一个关键科学问题:如何确定参与SLE发病的少数T细胞标志物和特征性CDR3?本项目拟通过三个方面内容以解决该问题,包括分析外周血和肾活检组织Th亚群TCRβ库的同源性与异质性、筛选外周血Th亚群与肾活检组织Th亚群公共CDR3和分析外周血各Th亚群TCRβ库与其临床相关评分指数及血清学检测的相关性。本项目的开展将为SLE的T细胞精准靶向治疗策略提供重要数据和新思路。

结项摘要

当前,SLE的靶向治疗药物面临的主要问题是特异性不强,即无法区分自身反应淋巴细胞和正常淋巴细胞,如何改善靶向治疗精准度成为SLE治疗的重要问题。近年来,免疫组库被广泛应用于疫苗和医药研发、生物标志物发现。本项目在前期研究中分析了两例SLE患者TCRβ CDR3库和BCR-H CDR3库在大剂量糖皮质激素治疗后的变化,提示仅少数T细胞群体参与了SLE的发病,而B细胞由于存在高频突变不适于作为精准靶标, 因此,本项目拟利用TCRβ CDR3库测序分析去筛选SLE治疗的精准靶标。经实验方案调整后,我们通过Illumina NovaSeq测序和分析活动期与缓解期SLE患者的TCRαβ CDR3库,发现SLE患者TCRα和TCRβ CDR3库的多样性均低于对照组,且SLE组CDR3的克隆分布呈现高频克隆的频率明显多于对照组,这些差异主要源自基因重排或和核苷酸缺失的差异。通过对共有CDR3分析, 我们筛到了一些TCRα、TCRβ CDR3克隆,可推荐用于潜在的SLE的精准治疗靶标。此外,我们通过转录组分析发现,SLE发病相关活化的T细胞的亚群主要为Th17、Th1、Th2,因此,我们也推荐通过刺激Treg增殖而抑制这些炎症反应亚群活化治疗方案。

项目成果

期刊论文数量(4)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Compositional characteristics of human peripheral TRBV pseudogene rearrangements.
人外周TRBV假基因重排的组成特征
  • DOI:
    10.1038/s41598-018-24367-2
  • 发表时间:
    2018-04-12
  • 期刊:
    Scientific reports
  • 影响因子:
    4.6
  • 作者:
    Shi B;Ma L;He X;Wu P;Wang P;Wang X;Ma R;Yao X
  • 通讯作者:
    Yao X
The Usage of Human IGHJ Genes Follows a Particular Non-random Selection: The Recombination Signal Sequence May Affect the Usage of Human IGHJ Genes.
人类IGHJ基因的使用遵循特定的非随机选择:重组信号序列可能影响人类IGHJ基因的使用
  • DOI:
    10.3389/fgene.2020.524413
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    Frontiers in genetics
  • 影响因子:
    3.7
  • 作者:
    Shi B;Dong X;Ma Q;Sun S;Ma L;Yu J;Wang X;Pan J;He X;Su D;Yao X
  • 通讯作者:
    Yao X
人免疫球蛋白重链可变区基因的特征分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    聊城大学学报(自然科学版)
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    石彬;马嘉欣;涂文静;吴皓明;陈先恋
  • 通讯作者:
    陈先恋
γδ T细胞及其受体多样性的研究进展
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    细胞与分子免疫学杂志
  • 影响因子:
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  • 作者:
    丁柳;石彬;白冰
  • 通讯作者:
    白冰

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其他文献

HBsAb滴度高于10000mU/ml外周血BCR CDR3受体库的组成及特征分析
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  • 通讯作者:
    石彬
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
    李巧玲
功能性核酸增强Hemin催化活性用于乳制品中四环素检测研究
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    10.13982/j.mfst.1673-9078.2017.7.044
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  • 期刊:
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    --
  • 作者:
    张少妮;陈宝;石彬;阎改萍
  • 通讯作者:
    阎改萍

其他文献

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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