单颗粒冷冻电子显微学研究重要蛋白质复合体的结构与功能

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31230016
  • 项目类别:
    重点项目
  • 资助金额:
    287.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0501.结构生物学
  • 结题年份:
    2017
  • 批准年份:
    2012
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2013-01-01 至2017-12-31

项目摘要

Proteins often need to form large complexes to accomplish the complicated biological functions. The structural and functional studies of protein complexes are at the forefront of current biology. As a fast-developing technology, cryo-electron microscopy has become acknowledged to be an indispensable tool in the study of protein complexes. In this project, we are aiming to elucidate the structures and functions of the most important protein complexes in cellular events by using cryo-electron microscopy in combination with techniques in biochemistry, biophysics and molecular biology. The specific aims are: 1) study the structure of 20S particle, which has an essential role in intracellular vesicle fusion events, in order to elucidate the molecular mechanism underlying disassembly of the SNARE complex by NSF, a member of AAA+ ATPase family; 2) study the structures of two bacterial HtrA proteases, DegP and DegQ, in complex with their substrates, in order to elucidate the structural basis and regulation mechanism underlying the proteolytic function and chaperone activity of HtrA proteins.
生命体中的蛋白质往往需要形成大的复合物以完成复杂的生物学功能。对蛋白质复合体结构与功能的研究是当今生物学研究的热点和前沿。迅速发展的冷冻电子显微学已经成为公认的研究蛋白质复合体的重要方法。本项目旨在运用冷冻电子显微学,并结合生物化学、生物物理学和分子生物学的方法,研究生命过程中重要的蛋白质复合体的结构与功能。研究内容包括两个方面:一,通过研究囊泡转运系统中重要的蛋白质机器20S复合体的结构,揭示AAA型ATPase酶家族蛋白成员NSF解开SNARE复合体的分子机制。二,通过研究HtrA蛋白酶家族成员DegP和DegQ与其底物结合的复合体的结构,揭示其行使蛋白酶和分子伴侣功能的结构基础及调节机制。

结项摘要

生命体中的蛋白质往往需要形成大的复合物以完成复杂的生物学功能。对蛋白质复合体结构与功能的研究是当今生物学研究的热点和前沿。迅速发展的冷冻电子显微学已经成为公认的研究蛋白质复合体的重要方法。本项目主要运用冷冻电子显微学技术,并结合生物化学、生物物理学和分子生物学的方法,研究囊泡转运系统中重要的蛋白质机器20S复合体的结构与功能,揭示AAA型ATPase酶家族蛋白成员NSF解开SNARE复合体的分子机制,以及HtrA蛋白酶家族成员形成的复合体的结构,揭示其行使蛋白酶功能的结构基础及分子机制。利用冷冻电镜技术,我们获得了20S中SNAP-SNARE装配体的结构,发现了四个α-SNAP围绕着左手环绕的SNARE螺旋束形成筒状右手环绕,进一步结构分析发现了一个新的蛋白间相互作用的位点,并且验证了这个位点对于SNARE的解聚的重要性,根据这些结果我们提出了NSF解聚SNARE的全新工作模型。我们还解析得到了HtrA家族成员Nma111p的3.4埃的结构,并通过结构分析和大量的生化实验阐明了Nma111p蛋白C端部分的作用,以及Nma111p蛋白结构的动态性对其功能的影响。这些研究对于揭示这些蛋白质复合体在发挥生物学功能时的分子机制具有非常重要的意义。

项目成果

期刊论文数量(10)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Structural and biochemical basis for induced self-propagation of NLRC4
NLRC4诱导自我繁殖的结构和生化基础
  • DOI:
    10.1126/science.aac5489
  • 发表时间:
    2015-10-23
  • 期刊:
    SCIENCE
  • 影响因子:
    56.9
  • 作者:
    Hu, Zehan;Zhou, Qiang;Chai, Jijie
  • 通讯作者:
    Chai, Jijie
Structure of phycobilisome from the red alga Griffithsia pacifica
红藻 Griffithsia pacifica 藻胆体的结构
  • DOI:
    10.1038/nature24278
  • 发表时间:
    2017-11-02
  • 期刊:
    NATURE
  • 影响因子:
    64.8
  • 作者:
    Zhang, Jun;Ma, Jianfei;Sui, Sen-Fang
  • 通讯作者:
    Sui, Sen-Fang
The role of the N-D1 linker of the N-ethylmaleimide-sensitive factor in the SNARE disassembly.
N-乙基马来酰亚胺敏感因子的 N-D1 连接子在 SNARE 拆卸中的作用
  • DOI:
    10.1371/journal.pone.0064346
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    PloS one
  • 影响因子:
    3.7
  • 作者:
    Liu CC;Sun S;Sui SF
  • 通讯作者:
    Sui SF
Structural basis for specific flagellin recognition by the NLR protein NAIP5.
NLR 蛋白 NAIP5 特异性鞭毛蛋白识别的结构基础
  • DOI:
    10.1038/cr.2017.148
  • 发表时间:
    2018-01
  • 期刊:
    Cell research
  • 影响因子:
    44.1
  • 作者:
    Yang X;Yang F;Wang W;Lin G;Hu Z;Han Z;Qi Y;Zhang L;Wang J;Sui SF;Chai J
  • 通讯作者:
    Chai J
Bunyamwera virus possesses a distinct nucleocapsid protein to facilitate genome encapsidation
布尼亚姆维拉病毒具有独特的核衣壳蛋白,可促进基因组衣壳化
  • DOI:
    10.1073/pnas.1222552110
  • 发表时间:
    2013-05-28
  • 期刊:
    PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA
  • 影响因子:
    11.1
  • 作者:
    Li, Baobin;Wang, Quan;Lou, Zhiyong
  • 通讯作者:
    Lou, Zhiyong

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生物三维电子显微学进入全新高速
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  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    隋森芳
  • 通讯作者:
    隋森芳
X-F. Xia, F Wang, M. Yang, S-F
X-F。
  • DOI:
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  • 发表时间:
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  • 作者:
    隋森芳
  • 通讯作者:
    隋森芳

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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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