甘蓝骨干亲本01-20-2的遗传构成及其育种效应分析

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31272180
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    80.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1506.蔬菜与瓜果生长发育
  • 结题年份:
    2016
  • 批准年份:
    2012
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2013-01-01 至2016-12-31

项目摘要

Aiming at the situation that there is no research on genetic basis and breeding effect of cabbage founder parents, 01-20-2 (founder parent) and its seven sister lines (non-founder parents), derived progenies (10 lines and 8 major varieties) of 01-20-2, DH population produced by microspore culture from the hybrid of founder parent 01-20-2 and inbred line 96-100 are used as materials on the basis of pedigree analysis. The investigation of important agronomic traits in two years under three different ecological conditions could interpret the mophorlogical characteristics inherited from founder parent 01-20-2. The SSR and InDel markers are used to screen the whole genome to clarify the distribution and transfer rule of specific chromosome loci for founder parent 01-20-2. The constructed high density linkage map and association analysis could clarify the relationship between specific loci of founder parent and important agronomic traits, elucidate the breeding effect of specific loci, discover specific chromosome loci and regions which played key role in cabbage breeding. According to above results, the fully clarified forming mechanism of founder parent 01-20-2 will provide theoretical guide for the creation of new founder parents. This project belongs to an integrated cross-disciplinary research to connect the germplasm resources, basic research and conventional breeding. Its implementation is of great significance to improve cabbage breeding theory and breeding efficiency.
针对国内外尚未研究甘蓝骨干亲本遗传构成、育种效应的现状,在甘蓝品种系谱分析的基础上,以从"北京早熟"系选获得的骨干亲本01-20-2及其7个姊妹系(非骨干亲本)、骨干亲本的10个衍生系和8个主要衍生品种、由骨干亲本和自交系96-100配制的杂交种经小孢子培养获得的DH群体为材料,通过两年三个生态条件的重要农艺性状调查,解析骨干亲本传递的表型特征;利用SSR和InDel标记进行全基因组扫描,阐明骨干亲本01-20-2特异位点在染色体上的分布和传递规律;构建高密度遗传连锁图谱并通过关联分析,阐明骨干亲本特异位点与重要农艺性状间的关系及其育种效应,挖掘在育种中发挥关键作用的特异位点和染色体区段;综合上述结果,全面解析骨干亲本01-20-2的形成机制,为选育新型骨干亲本提供理论指导。本研究属于连接种质资源、基础研究和常规育种的一个综合交叉学科,其结果对于提升甘蓝育种理论和育种效率具有重要意义。

结项摘要

针对国内外尚未研究甘蓝骨干亲本遗传构成、育种效应的现状,本项目在甘蓝品种系谱分析的基础上,以从“北京早熟”系选获得的骨干亲本01-20-2 及其7 个姊妹系(非骨干亲本)、骨干亲本的10 个衍生系和8 个主要衍生品种、由骨干亲本和自交系96-100 配制的杂交种经小孢子培养获得的DH 群体为材料,通过两年三个生态条件的重要农艺性状调查,解析骨干亲本传递的表型特征;利用SSR 和InDel 标记进行全基因组扫描,阐明骨干亲本01-20-2 特异位点在染色体上的分布和传递规律;构建高密度遗传连锁图谱并通过关联分析,阐明骨干亲本特异位点与重要农艺性状间的关系及其育种效应,挖掘在育种中发挥关键作用的特异位点和染色体区段。经过四年的研究,明确了骨干亲本的衍生品种数达27个;利用骨干亲本及自交系96-100的DH群体,构建了包含413个标记的遗传连锁图谱,检测到与33个农艺性状相关的QTL171个。与姊妹系比较,发现骨干亲本01-20-2具有6个特异染色体位点,这些位点与外叶颜色、叶球颜色、株幅、外叶长、株型、紧实度、品质性状等重要农艺性状关联。尤为突出的是,Chr.3上Indel64位点和Chr.9上Indel353位点其遗传效应分别与株型和外叶色、品质有关,并且具有明显的不同性状聚集和染色体区段效应,是骨干亲本01-20-2重要的特异位点。项目发表论文9篇,其中SCI收录7篇,培养硕士博士研究生3名。上述研究结果将为指导新骨干亲本的育成提供重要参考依据,对提高甘蓝育种效率具有重要意义。

项目成果

期刊论文数量(9)
专著数量(0)
科研奖励数量(1)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Inheritance and InDel markers closely linked to petal color gene (cpc-1) in Brassica oleracea
与甘蓝花瓣颜色基因(cpc-1)密切相关的遗传和插入缺失标记
  • DOI:
    10.1007/s11032-015-0354-x
  • 发表时间:
    2015-08-01
  • 期刊:
    MOLECULAR BREEDING
  • 影响因子:
    3.1
  • 作者:
    Han, Feng-qing;Yang, Chong;Zhang, Yang-yong
  • 通讯作者:
    Zhang, Yang-yong
中国甘蓝育成品种系谱分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    园艺学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    张扬勇;刘玉梅;孙培田;吕红豪
  • 通讯作者:
    吕红豪
中国50个甘蓝代表品种EST-SSR指纹图谱的构建
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    中国农业科学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    杨丽梅;刘玉梅;吕红豪;方智远
  • 通讯作者:
    方智远
Linkage map construction using InDel and SSR markers and QTL analysis of heading traits in Brassica oleracea var. capitata L.
利用InDel和SSR标记构建甘蓝连锁图谱及抽穗性状QTL分析。
  • DOI:
    10.1007/s11032-014-0019-1
  • 发表时间:
    2014-06-01
  • 期刊:
    MOLECULAR BREEDING
  • 影响因子:
    3.1
  • 作者:
    Lv, Honghao;Wang, Qingbiao;Liu, Bo
  • 通讯作者:
    Liu, Bo
Whole-Genome Mapping Reveals Novel QTL Clusters Associated with Main Agronomic Traits of Cabbage (Brassica oleracea var. capitata L.).
全基因组作图揭示了与卷心菜(Brassica oleracea var.capitala L.)主要农艺性状相关的新QTL簇
  • DOI:
    10.3389/fpls.2016.00989
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    Frontiers in plant science
  • 影响因子:
    5.6
  • 作者:
    Lv H;Wang Q;Liu X;Han F;Fang Z;Yang L;Zhuang M;Liu Y;Li Z;Zhang Y
  • 通讯作者:
    Zhang Y

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结球甘蓝自交系YL-1的高效遗传转化体系的建立及应用
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  • 发表时间:
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  • 发表时间:
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  • 期刊:
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
    张扬勇

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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