入侵种南美蟛蜞菊与本土种蟛蜞菊杂种区的适应性渐渗研究

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项目介绍
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基本信息

  • 批准号:
    31670384
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    55.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0301.生态学理论与方法
  • 结题年份:
    2020
  • 批准年份:
    2016
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2017-01-01 至2020-12-31

项目摘要

Being the most common consequences of natural hybridization, introgression was the stimulus of rapid adaptive evolution for many invasive species. However, not all the introgressions were adaptive, one pending issue for introgressive hybridizations, was what proportions of the gene flow mediated by introgressive hybridization between species were adaptive. In this study, we investigated the hybrid zones between an in-vasive plant Sphagneticola trilobata and its native congener S. calendulacea. Using genome scanning of SNPs with RAD-seqs among the introgressors and its parents, we parsed the patterns of the introgressed loci using both heterogeneity test of allele fre-quencies and the genomic cline mode , and some outliers with potential adaptive sig-nificances were screened out and validated and annotated by RNA-seq under cold stress. At the same time, according to our preliminary experimental evidences for the occurrence of cold tolerant phenotypes alike the S. trilobata, some adaptive intro-gressors with ascertained loci of cold tolerances were transplanted in the field at the cold marginal areas, and trait performances with cold tolerance were compared, to-gether with evidences of fitness; both genetic and phenotype evidences will provide compelling evidences whether adaptive introgression of cold tolerance occurred. This project will broaden our understanding the evolutionary significances of introgressive hybridization, also provide accurate forewarning information of the invasion potential.
遗传渐渗(introgression)是自然杂交最常见形式,也是部分入侵种产生快速适应性进化的重要机制。然而,物种间的渐渗并非都是适应性的,渐渗杂交中一个关键问题是, 物种间渐渗介导的基因流多大程度上是适应性的?本项目以入侵种南美蟛蜞菊与本土种形成的杂种区(hybrid zone)为研究对象,通过高通量测序技术RAD-seqs扫描亲本物种及其渐渗居群基因组水平的SNPs,采用等位基因频率异质性检验和基因组渐变模型分析渐渗位点的分布样式,鉴定渐渗居群基因组上的离群位点(outlier loci)并通过人工模拟低温胁迫获得表达水平的证据;结合野外同质园实验,比较亲本与渐渗个体在居群水平上的低温适应性性状及适合度,检验热带分布入侵种南美蟛蜞菊与耐低温蟛蜞菊杂种区是否发生了低温适应性渐渗。本项目将深化我们对渐渗杂交进化适应性规律的理解,提供南美蟛蜞菊入侵潜能的预警信息。

结项摘要

遗传渐渗(introgression)是自然杂交最常见形式,也是部分入侵种产生快速适应性进化的重要机制。然而,物种间的渐渗并非都是适应性的,渐渗杂交中一个关键问题是, 物种间渐渗介导的基因流多大程度上是适应性的?本项目以入侵种南美蟛蜞菊与本土种形成的杂种区(hybrid zone)为研究对象,通过高通量测序技术RAD-seqs对来自佛山的杂种区扫描亲本物种及其渐渗居群基因组水平的SNPs,采用等位基因频率异质性检验和基因组渐变模型分析渐渗位点的分布样式,基于632个诊断性位点和2845个随机位点鉴定渐渗居群基因组上的63个离群位点(outlier loci),其中2个位点Loc 653、Loc 1054分别与与CBF代谢通路上两个关键因子AT1G19670 (chlorophyllase 1)、 AT5G58620 (zinc finger (CCCH-type) family protein)同源;人工模拟低温胁迫,显示渐渗个体低温耐受性与本土种接近,但未显示出超亲性状,差异表达分析显示包括上述两个位点在内的众多位点在亲本间呈现显著差异,渐渗亲本与本土种的表达更为相似;我们的研究结果显示,南美蟛蜞菊在与本土种的渐渗杂交中,出现了对低温适应性性状的渐渗,在自然选择作用下,在向高纬度扩张过程中,这些渐渗个体具有适合度优势,具有入侵的潜能,因此有必要对北部边缘分布的杂种区进行动态监测,防止新的入侵种的产生。本研究还发现,入侵种与本土种杂交的另外一个后果是本土种的快速遗传湮灭,这是一个亟待关注的保护生物学问题。

项目成果

期刊论文数量(2)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
The complete chloroplast genome sequence of Sphagneticola trilobata (Asteraceae).
Sphagneticola trilobata(菊科)的完整叶绿体基因组序列
  • DOI:
    10.1080/23802359.2018.1483767
  • 发表时间:
    2018-07-03
  • 期刊:
    Mitochondrial DNA. Part B, Resources
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Zhou Y;Ng WL;Zhou R;Wu W
  • 通讯作者:
    Wu W
Characterization of the complete chloroplast genome sequence of Sphagneticola calendulacea (Asteraceae).
金盏泥炭藓(菊科)完整叶绿体基因组序列的表征
  • DOI:
    10.1080/23802359.2018.1511846
  • 发表时间:
    2018-10-27
  • 期刊:
    Mitochondrial DNA. Part B, Resources
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Ng WL;Zhou Y;Zhou R;Wu W
  • 通讯作者:
    Wu W

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其他文献

Experimental realization of deterministic entanglement transformations of bipartite pure states
二分纯态确定性纠缠变换的实验实现
  • DOI:
    10.1016/j.optcom.2009.02.032
  • 发表时间:
    2009-05
  • 期刊:
    Optics Communications
  • 影响因子:
    2.4
  • 作者:
    李承祖;刘伟涛;陈平形;吴伟;韩阳
  • 通讯作者:
    韩阳
Deterministic remote preparation of pure and mixed polarization states
纯偏振态和混合偏振态的确定性远程制备
  • DOI:
    10.1103/physreva.81.042301
  • 发表时间:
    2009-09
  • 期刊:
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  • 影响因子:
    2.9
  • 作者:
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  • 通讯作者:
    陈平形
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  • DOI:
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  • 发表时间:
    2008-03
  • 期刊:
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  • 影响因子:
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
    欧保全
考虑砂土颗粒形状的细观组构定量描述
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    2016
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  • 作者:
    李学丰;王奇;刘金峰;吴伟;孟凡超
  • 通讯作者:
    孟凡超
甜菜碱及其盐酸盐对籼米蒸煮及α-方便米饭的影响
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  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
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    --
  • 作者:
    王晓映;林亲录;吴跃;杨涛;吴伟;肖华西;丁玉琴
  • 通讯作者:
    丁玉琴

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
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