DNA步行者传感器构建及其在病毒高灵敏检测中的应用

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    21675119
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    65.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    B0403.谱学方法与理论
  • 结题年份:
    2020
  • 批准年份:
    2016
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2017-01-01 至2020-12-31

项目摘要

DNA walker is a new concept to be applied in the design of the novel sensors based on the DNA walking on the surface of micro- & nano- particles. There are many challenges in the study of DNA walker. This project intends to adopt different particles and catalytic assembly technology to develop new sensors based on DNA walker. The DNA catalytic chains are designed with one or two catalytic domains to investigate their effect on the catalytic hairpin assembly and DNA walking for the developing of high sensitive DNA walker sensors. DNA walker can be combined with fluorescence resonance energy transfer (FRET) by using the target DNA as the catalytic chain and the hairpin initiating the walking of target DNA. A novel DNA walking FRET will be developed for the sensitive analysis of nucleic acid based on the molecular beacons opened on the nanoparticle surface. Combinding the binding induced strand displacement reaction or aptamer technology with DNA walker, a sensitive and selective method will be developed for the detection of proteins and applied in the monitoring of flu virus and enterovirus. This will promote the study of virus in the rapid diagnosis and early warning,which is of great significance.
基于DNA链在微纳球表面移动(行走)的原理设计构建新型传感器,是一种新技术,面临诸多挑战。本项目拟采用不同基质和不同粒径的微纳球为载体,结合催化发卡组装技术,构建基于DNA步行者的新型传感器。将DNA催化链分别设计成一个或两个催化中心,考察影响催化发卡组装及DNA行走的主要因素,并比较它们在微纳球表面及微纳球间的行走特性,构建快速、高灵敏DNA步行者传感器;将DNA行走技术引入荧光共振能量转移(FRET),利用启动发卡让靶分子/催化链在微纳球表面行走,并使载体表面多个分子信标同时发光,构建DNA行走FRET新型传感器,进一步提高检测灵敏度;与链置换反应或适配子技术结合,建立高灵敏及高选择性蛋白质检测新方法;以流感病毒和肠道病毒为研究对象,建立基于DNA步行者的病毒高灵敏检测及病毒感染早期预警新方法。这将使病毒分析检测研究更加深入,对于传染性疾病快速诊断及预警具有重要意义。

结项摘要

DNA步行者传感器是近年来发展起来的一种新技术。基于此,我们分别采用磁性微球、纳米金和量子点等载体,结合催化发卡自组装、杂交链式反应、无酶发夹DNA级联放大等技术,构建了多个检测核酸、蛋白及病毒的单足及双足DNA 步行者传感器;并分别与荧光共振能量转移、荧光猝灭恢复等技术结合,建立了检测病毒核酸、蛋白及病毒颗粒的新方法。将基于纳米金的DNA步行者传感器与滚环扩增及DNA级联放大技术结合,实现了HIV核酸的高灵敏检测,检测下限为1.46 fM;分别基于核酸杂交链式反应(HCR)和滚环扩增(RCA)技术,建立了均相检测肠道病毒的新方法;基于杂交链式反应的化学发光步行者传感器,检测凝血酶的检出限为9.7 fM;构建了量子点信标及细胞内单条病毒RNA 的检测方法,并采用量子点信标标记了HIV子代病毒RNA,实现了单颗粒病毒脱壳过程的动态示踪(JACS封面文章)。.本项目在J Am Chem Soc, Anal Chem,Biosens Bioelectron,Chem Commun,Nanoscale等刊物发表学术论文20篇,获授权发明专利4项,参加国际国内重要学术会议26人次,作特邀报告10次;共培养研究生9名,其中博士研究生5名,硕士研究生4名;获湖北省归国华侨联谊会科技奖励三等奖1项;量子点成果转让给企业,转让费140万元。 .DNA步行者传感器具有灵敏度高、选择性好、设计灵活等优点,在病毒检测方面具有明显的优势;以量子点为载体构建量子点信标,不仅实现了量子点表面DNA数的调控,为量子点等纳米材料组装奠定了坚实的基础,同时所构建的量子点信标还具有高亮度、抗光漂、吸收光谱宽、发射光谱可调等优点,为病毒核酸、病毒蛋白及颗粒检测提供了新方法,部分成果在“核酸适配体在新冠疫情中的应用网络学术研讨会”和“首届核酸检测产业链巅峰论坛暨第九届荧光 PCR 与分子诊断研讨会”进行了交流。

项目成果

期刊论文数量(20)
专著数量(0)
科研奖励数量(1)
会议论文数量(0)
专利数量(4)
In situ synthesis of photoluminescence-quenching nanopaper for rapid and robust detection of pathogens and proteins
原位合成光致发光猝灭纳米纸,用于快速、稳健地检测病原体和蛋白质
  • DOI:
    10.1039/c8cc09991j
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    Chemical Communications
  • 影响因子:
    4.9
  • 作者:
    Liu Yucheng;Mao Guobin;Wang Wang;Tian Songbai;Ji Xinghu;Liu Meng;He Zhike
  • 通讯作者:
    He Zhike
A digital quantification method for the detection of biomarkers on a microfluidic array chip
微流控阵列芯片上生物标志物检测的数字定量方法
  • DOI:
    10.1016/j.snb.2019.126851
  • 发表时间:
    2019-11
  • 期刊:
    Sensors and Actuators B: Chemical
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Tian Songbai;Yang Hai;Zhang Zhen;Du Mingyuan;Mao Guobin;Ji Xinghu;He Zhike
  • 通讯作者:
    He Zhike
Target-Induced Cascade Amplification for Homogeneous Virus Detection
用于同质病毒检测的靶标诱导级联扩增
  • DOI:
    10.1021/acs.analchem.9b03805
  • 发表时间:
    2019-12-03
  • 期刊:
    ANALYTICAL CHEMISTRY
  • 影响因子:
    7.4
  • 作者:
    Du, Mingyuan;Mao, Guobin;He, Zhike
  • 通讯作者:
    He, Zhike
Rational construction of a DNA nanomachine for HIV nucleic acid ultrasensitive sensing
合理构建用于 HIV 核酸超灵敏传感的 DNA 纳米机器
  • DOI:
    10.1039/c8nr05206a
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    Nanoscale
  • 影响因子:
    6.7
  • 作者:
    Zheng Jiao;Ji Xinghu;Du Mingyuan;Tian Songbai;He Zhike
  • 通讯作者:
    He Zhike
DNA-templated quantum dots and their applications in biosensors, bioimaging, and therapy.
DNA 模板量子点及其在生物传感器、生物成像和治疗中的应用。
  • DOI:
    10.1039/c9tb01870k
  • 发表时间:
    2019-11
  • 期刊:
    Journal of Materials Chemistry B
  • 影响因子:
    7
  • 作者:
    Yang Yeling;Mao Guobin;Ji Xinghu;He Zhike
  • 通讯作者:
    He Zhike

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其他文献

Resonance Light Scattering Method for the Determinaiton of Lysozyme Using CdSe Quantum Dots as Probe
CdSe量子点探针共振光散射法测定溶菌酶
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    --
  • 发表时间:
    2009
  • 期刊:
    Chemical Journal of Chinese Universities-Chinese
  • 影响因子:
    1
  • 作者:
    何治柯;刘义;黄珊;肖琦
  • 通讯作者:
    肖琦
纸基微孔阵列芯片比色法检测乳酸脱氢酶
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    分析化学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    张慧妍;张珍;吉邢虎;何治柯
  • 通讯作者:
    何治柯

其他文献

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何治柯的其他基金

酶促量子点邻近标记及其在病毒检测中的应用
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2021
  • 资助金额:
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基于光学天线和量子点信标的冠状病毒核酸单分子检测研究
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    90717111
  • 批准年份:
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    50.0 万元
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新型阳离子荧光聚合物合成及核酸单分子检测新方法研究
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  • 资助金额:
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    面上项目
多元光学编码检测核酸新原理及新方法研究
  • 批准号:
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  • 资助金额:
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  • 资助金额:
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相似国自然基金

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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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