应用时间系列代谢组学研究肝细胞肝癌患者手术前后血清代谢物变化及潜在标志物识别

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81860527
  • 项目类别:
    地区科学基金项目
  • 资助金额:
    34.8万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H1813.肿瘤诊断
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2018
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2019-01-01 至2022-12-31

项目摘要

Although alpha-fetoprotein (AFP) has widely been used for HCC diagnosis, it is not perfect because of its high false positive and false negative ratio. Therefore, it is imperative to develop more sensitive and specific markers for HCC diagnosis.Time-series metabolomics studies can provide insight into the dynamics of disease development and facilitate the discovery of prospective biomarkers. In previous research,we observed that some metabolites in serum were significantly reduced after the operation of HCC patients. We hypothesized that these significantly reduced metabolites were closely related to the occurrence and development of HCC. In this time-series metabolomics study, we are going to analyze and evaluate the dynamic metabolic changes and discover biomarker candidates. The metabolites are going to be identified as the potential biomarkers for HCC. The diagnostic model of HCC will try to establish. The associations among the metabolite and HCC development and operation should be explored. The efficacy of the diagnostic model for HCC is to be evaluated. The results of this study provided a new perspective to explore the relationship between the metabolic pathways and HCC development of potential biomarkers, and understand the mechanism and discover probable biomarkers of HCC。
尽管AFP广泛应用于HCC诊断,由于高的假阳性、假阴性而不完美,迫切需要发展更灵敏、特异诊断HCC的标志物。时间系列的代谢组学研究能够更好理解疾病的发展和促进标志物的发现。前期研究中,我们观察到的血清中某些代谢物在HCC患者术后显著减少。我们推测术后这些明显降低的代谢物与HCC发生、发展密切相关。本项目采用UPLC-MC技术对HCC、肝血管瘤术前、术后的代谢物水平进行动态研究。筛选出术前明显高于健康人、术后显著降低的特征代谢物作为诊断HCC潜在标志物,对潜在标志物进行鉴定。建立诊断HCC与健康人的识别模式,探索潜在标志物与HCC发生、切除之间的联系,临床样本评估识别模式临床应用价值,研究结果对于探讨潜在标志物涉及其代谢通路及与HCC的关系,阐明HCC发生发展的分子机制和为发现HCC诊断可能的标志物提供思路。

结项摘要

肝细胞癌(HCC)是一种复杂的异质性疾病。HCC患者通常有多种合并症。因此,代谢组学研究中解释观察到的代谢变化具有挑战性。首先,利用来自21例HCC患者的术前和术后(约44天)配对血清,采用超高压液相色谱串联四极杆飞行时间质谱进行代谢组学研究,以确定代谢谱的整体变化,筛选并鉴定适用于诊断HCC的候选生物标志物。然后,采用绝对定量方法对所选代谢物进行靶向分析,筛选HCC诊断的生物标志物。在验证集样本中还进一步评估了生物标志物诊断另外五种实体肿瘤的能力。最后,对研究结果进行拓展,采用相对定量的方法对血清中含量丰富的69种酰基肉碱代谢特征在验证集样本进行探索。结果表明,10种血清酰基肉碱(C6-C14)是对癌细胞清除反应最显著的代谢物。其中,辛酰基- l-肉碱、癸酰基- l-肉碱、3-羟基癸酰基肉碱、反式-2-十烯酰基- l-肉碱水平能准确区分HCC患者与正常人(AUC分别为0.944、0.955、0.910、0.897)。4种酰基肉碱诊断能力在验证集样本中得到进一步证实。4种酰基肉碱对小HCC的诊断性显著能优于AFP。此外,他们还能够准确区胃癌、结直肠癌、肺癌、胆管癌和混合肝癌与健康对照。拓展研究结果显示,16种酰基肉碱(C8-C14)对6种实体肿瘤具有较高的诊断能力(AUC>0.90)。因此,16种酰基肉碱 (C8-C14)可能是诊断6种实体瘤的潜在生物标志物。尤其是酰基肉碱10:2 isomer2和酰基肉碱12:2 isomer2在识别6种实体肿瘤与健康对照中曲线下面积均大于0.95。实验数据还显示,6个实体瘤中43种酰基肉碱 (C8-C18)水平发生显著变化(P<0.05),其中31种血清酰基肉碱(C8-C16)水平发生最显著变化(P<0.001)。因此,我们推测这6种实体肿瘤共享相同的脂肪酸能量代谢通路,这为癌症治疗提供了共同的靶点。 该项目从HCC术前术后显著降低的代谢物中筛选出对包括HCC在内的6种实体肿瘤有较高诊断价值的18种酰基肉碱,这些酰基肉碱共享过氧化物酶体和线粒体脂肪酸氧化代谢通路,为开发实体肿瘤早期诊断标志物及阐明实体肿瘤的发生、发展分子机制提供依据,具有重要理论意义和潜在的临床应用价值。

项目成果

期刊论文数量(1)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
基于液质联用的人血清代谢组学样品前处理方法研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    中国癌症防治杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    李倩倩;任冠华;叶春华;吴龙俊宇;黎远冬;张春燕
  • 通讯作者:
    张春燕

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其他文献

南宁市售瓶装水中微囊藻毒素调查及初步健康风险评价
  • DOI:
    10.16190/j.cnki.45-1211/r.2018.06.033
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    广西医科大学学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    肖潺潺;梅凡彪;方向;陈茂剑;利基林;黄天壬;黎远冬;邓伟
  • 通讯作者:
    邓伟
南宁市水源水和饮用水微囊藻毒素LR浓度调查及初步健康风险评价
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    广西医学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    肖潺潺;陈茂剑;梅凡彪;方向;利基林;黄天壬;黎远冬;邓伟
  • 通讯作者:
    邓伟
高效液相色谱法同时测定水源水中三种微囊藻毒素
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    中国癌症防治杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    肖潺潺;方向;梅凡彪;陈茂剑;曾洁;吴玲红;利基林;黄天壬;黎远冬;邓伟
  • 通讯作者:
    邓伟

其他文献

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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