基于量子点/NBD荧光比率的高灵敏、高通量功能寡糖筛选和构效关系评估体系构建及其应用

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31201384
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    25.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C2002.食品生物化学
  • 结题年份:
    2015
  • 批准年份:
    2012
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2013-01-01 至2015-12-31

项目摘要

Achieving high-throughput screening of the functional oligosaccharides and assessment of their structure-activity relationship are the most important and difficult in the oligosaccharides industry. There is still no effective method to address these problems. In this proposal, a high-throughput analysis of oligosaccharides- protein relationship by the proposed glycolipid sugar chips was used to solve this dilemma. Since the amount of the oligosaccharides on the chip cannot be determined and the sensitivity of AlexFluo 647 towards a target protein is low, we introduce the chemical NBD fluorescent label to the oligosaccharide probes from gluco-oligosaccharides library and CR3 target protein. A soft determination was achieved through fluorescence intensity assay. Due to 100 times higher sensitivity than AlexFluo 647, quantum dots are used to achieve a better detection of the CR3 target protein. Finally, a system for high sensitivity and high-throughput screening of functional oligosaccharides and structure-activity relationship evaluation was established through analyzing the ratio of quantum dot and NBD fluorescence intensity. In addition, the structure-activity relation between CR3 and gluco-oligosaccharides was assessed. This study will play an important role in accelerating the screening and development of functional oligosaccharides and enhancing the level of R&D in China in the field of functional oligosaccharides.
如何实现功能寡糖的高通量筛选及构效关系评估一直是整个寡糖产业链的核心和难题,目前尚无有效方法。为解决该问题,本课题拟以申请人已掌握的高通量分析"糖- 蛋白"作用关系的拟糖脂糖芯片体系为基础,针对目前因无法实现芯片上糖探针的实时测定以及AF647 做为靶蛋白检测标记时灵敏度相对较低,而使得糖芯片尚不能用于"糖-蛋白"构效关系评估的缺陷,利用已有的葡聚寡糖库和CR3 靶标蛋白,首先将灵敏的NBD荧光标记引入到葡聚寡糖探针,通过分析荧光强度实现芯片上寡糖探针的软测定;然后用检测灵敏度比AF647 高100 倍的量子点作为检测标记来实现CR3 蛋白的高灵敏实时检测;最后通过分析量子点/NBD 荧光值比率从而建立高灵敏、高通量的功能寡糖筛选和构效关系评估体系,同时实现CR3 与葡聚寡糖之间的构效关系评估。本研究对加快我国功能糖的筛选与开发、提升我国在功能寡糖领域的研发水平将起重要促进作用。

结项摘要

功能寡糖已经成为全球特膳食品产业中的一个新的重要功能因子。但是寡糖构效关系的不明已令功能糖的研究进入瓶颈阶段,因此如何有效的实现功能寡糖的高通量筛选与构效关系评估已经成为为整个寡糖链产业的核心与重点。针对该问题,本研究项目紧紧围绕寡糖的结构和功能关系开展工作: (1) 建立基于ESI-CID-MSMS的技术体系用于葡聚寡糖的结构解析的技术与方法;(2)以从天然源微生物多糖为糖原,获得聚合度不同的寡糖,通过MALDI-MS和ESI-CID-MS/MS获得序列清晰的寡糖探针;(3)基于糖芯片技术进行葡聚寡糖与DC-SIGN,DC-SIGNR以及MBP蛋白之间构效关系分析,并在AO-NGLs技术体系的基础上开发出NGLs上带有标记的新型荧光探针合成体系,并将该技术体系用于分离纯化所获得的寡糖的衍生化,然后用量子点标记蛋白来检测实现寡糖的构效关系评估。在基于质谱技术对葡聚寡糖结构分析时发现:在单个糖单元内出现m/z 42/30/30/42/18差值的为糖单元之间通过1,3-键型连接寡糖,而以差值m/z 162出现的则为葡萄糖糖单元之间通过1,6-键型连接的寡糖;单个糖单元内出现m/z 42/42/77的为葡萄糖单元之间通过1,2-键型连接;尤其是发现了在还原端出现差值m/z 162的为末端为果糖单元的寡糖,其可以作为还原端果糖是否除去的标志。发展出了有效提高β1,3-葡聚糖发酵法生产产量的方法,并对从香菇中分离的子实体多糖中的α1,3-葡聚糖和β1,3/1,6-葡聚糖以及β1,3-葡聚糖进行酸解获得了α1,3-葡聚寡糖(DP2-13)和β1,3-葡聚寡糖(DP2-13)以及β1,3/1,6-葡聚寡糖的制备工作(DP2-13),对来源于藻类和布鲁氏菌的α1,2-葡聚寡糖和环形β1,2-葡聚糖进行水解,获得了聚合度不同的系列α1,2-葡聚寡糖(DP 2-9)和β1,2-葡聚寡糖(DP 2-13)。在基于糖芯片技术进行寡糖结构与功能关系分析工作中发现:DC-SIGN和DC-SIGNR均可以识别聚合度大于3的β-1,2-葡聚寡糖。在新型荧光标记探针的合成开发中,已经完成了整个探针的合成工作,但是由于缺少有效的纯化技术,尚无法得到高纯度的探针,我们计划与大连物化所合作,通过HPLC 技术来解决这个问题。本项目研究工作为进一步完善该系统并应用于糖的结构与功效评估奠定了基础。

项目成果

期刊论文数量(24)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(1)
专利数量(0)
Improved curdlan fermentation process based on optimization of dissolved oxygen combined with pH control and metabolic characterization of Agrobacterium sp ATCC 31749
基于溶解氧优化结合 pH 控制和农杆菌 ATCC 31749 代谢表征的改进凝胶多糖发酵工艺
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
    Applied Microbiology and Biotechnology
  • 影响因子:
    5
  • 作者:
    Wu; Jian-Rong;English; Nike;Yu; Xiao-Bin;Lin; Chi-Chung
  • 通讯作者:
    Chi-Chung
Fermentation Process Modeling with Levenberg-Marquardt Algorithm and Runge-Kutta Method on Ethanol Production by Saccharomyces cerevisiae
采用 Levenberg-Marquardt 算法和 Runge-Kutta 方法对酿酒酵母乙醇生产的发酵过程进行建模
  • DOI:
    10.1155/2014/289492
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    Mathematical Problems in Engineering
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Zhang; Hong-Tao;Lin; Chi-Chung;Jiang; Lihua;Xu; Baoguo
  • 通讯作者:
    Baoguo
系列食品微生物多糖的高黏度发酵关键技术
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    食品科学技术学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    古立谦;朱莉;吴剑荣;张洪涛
  • 通讯作者:
    张洪涛
Model-based estimation of optimal dissolved oxygen profile in Agrobacterium sp. fed-batch fermentation for improvement of curdlan production under nitrogen-limited condition
基于模型的农杆菌最佳溶解氧分布估计。
  • DOI:
    10.1016/j.bej.2015.06.012
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    Biochemical Engineering Journal
  • 影响因子:
    3.9
  • 作者:
    Liu; Dengfeng;Zhan; Xiao-Bei;Ding; Jian;Lin; Chi-Chung
  • 通讯作者:
    Chi-Chung
Recent advances in curdlan biosynthesis, biotechnological production, and applications
凝胶多糖生物合成、生物技术生产和应用的最新进展
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
    Applied Microbiology and Biotechnology
  • 影响因子:
    5
  • 作者:
    Zhan; Xiao-Bei;Lin; Chi-Chung;Zhang; Hong-Tao
  • 通讯作者:
    Hong-Tao

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    --
  • 发表时间:
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  • 作者:
    张洪涛
  • 通讯作者:
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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