结合多组学数据的人类膳食选择行为遗传学研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31900407
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    19.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0604.表型、行为与疾病的遗传学基础
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2019
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2020-01-01 至2022-12-31

项目摘要

Food choice is one of basic types of human choice behavior. Early studies have indicated that it was affected by both genetic and environmental factors, and both factors were in general equally important for this human behavior. Previous population genetics studies could not investigate the food choice behavior from a perspective of human genome. In this study, we aimed to investigate the distribution of DNA variants which covered the whole human genome in different groups of food choice core phenotypes based on data comprised of 500K individuals from UK Biobank and from Chinese populations collected in our previous research. We will examine the genetic background of three core phenotypes of human food choice behavior including nutrients contributions to human energy, food fiber intake and veganism from three levels including single gene, biomedical pathways comprised of multiple genes and gene-gene interaction networks. The genetic basis of these core phenotypes of food choice will be compared. Our research will offer theoretical basis for screening food preference populations and formulating personalized nutritional plans, and in turn, will finally be helpful to reduce the nutrition related chronic disease in human populations. In addition our study will also provide novel insights for the future study of nutrition genomics. Last but not least, this study will offer valuable experiences for some other human choice behavior study including mate choice and career choice.
膳食选择是人类对食物的选择行为,遗传与环境对该行为的影响程度大致相当。既往的群体遗传学研究无法从全基因组的角度完整考察和揭示人类膳食选择行为的遗传学影响因素。本课题基于既有的英国生物库50万人群数据及前期收集的中国人群数据与研究材料,通过考察覆盖人类基因组的约9600万个遗传位点在不同膳食选择核心表型群体中的分布,结合生物信息数据库的多组学数据,从单基因、多基因代谢和生化通路以及基因-基因交互网络的层面对营养素供能比、膳食纤维摄入以及素食选择这三大膳食选择核心表型的遗传基础进行系统性研究,揭示不同层次遗传因素对人类膳食选择行为的影响,比较不同膳食选择核心表型遗传基础的异同。本课题可为寻找特定膳食偏好群体,制定个性化的膳食和营养方案,降低人群营养代谢疾病的发病风险提供理论依据,为未来的营养基因组学研究提供新的思路和启发,还可为配偶选择、职业选择等其他人类选择行为的遗传基础研究提供经验。

结项摘要

膳食选择是人类对食物的选择行为,既往研究表明该行为与包括甲基苯丙胺滥用在内的毒品、尼古丁及酒精依赖行为均受人脑“奖赏通路”机制的调控。本项目从中国人群体的角度项目组收集具有代表性的中国人群样本,筛选具有一定指标性的遗传学位点,通过膳食量表调查问卷及多态性遗传位点分型实验获取相关数据,构建基于中国人群的膳食选择信息库。本研究所构建的基于中国人群的膳食选择研究信息库可为日后针对中国人群的膳食选择行为学研究提供必要的数据支持和研究基础。同时项目组基于中国人群,采用飞行时间质谱的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)基因分型方法,开展针对甲基苯丙胺滥用与组蛋白去乙酰化酶3(Histone deacetylases 3, HDAC3)以及腺苷A2A受体基因(Adenosine A2A receptor,ADORA2A)基因多态性的遗传学关联研究。研究结果显示HDAC3以及ADORA2A基因多态性位点均与甲基苯丙胺滥用行为显著相,且这些关联性位点均具备一定的生物学功能,可能影响HDAC3以及ADORA2A基因在mRNA以及蛋白质层面的表达和翻译。此外,ADORA2A基因多态性位点rs5751876与甲基苯丙胺滥用者的渴望评分存在一定的关联。这些研究发现可以日后深层次阐明甲基苯丙胺滥用的病因遗传学及脑内“奖赏通路”的相关机制提供必要的数据支持。此外,项目组还发现ADORA2A基因的相关多态性位点与甲基苯丙胺滥用者的渴望评分存在显著相关,可为日后健康人群筛查候选位点及生物标志物的转化应用提供新的思路。

项目成果

期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
The Vulnerability to Methamphetamine Dependence and Genetics: A Case-Control Study Focusing on Genetic Polymorphisms at Chromosomal Region 5q31.3
甲基苯丙胺依赖和遗传学的脆弱性:关注染色体区域 5q31.3 遗传多态性的病例对照研究
  • DOI:
    10.3389/fpsyt.2022.870322
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    Frontiers in Psychiatry
  • 影响因子:
    4.7
  • 作者:
    Xiao, Jing;Ma, Yitian;Wang, Xiaochen;Wang, Changqing;Li, Miao;Liu, Haobiao;Han, Wei;Wang, Huiying;Zhang, Wenpei;Wei, Hang;Zhao, Longrui;Zhang, Tianxiao;Lin, Huali;Guan, Fanglin
  • 通讯作者:
    Guan, Fanglin
Evaluation of Adenosine A2A receptor gene polymorphisms as risk factors of methamphetamine use disorder susceptibility and predictors of craving degree
腺苷A2A受体基因多态性作为甲基苯丙胺使用障碍易感性危险因素和渴望程度预测因子的评价
  • DOI:
    10.1016/j.psychres.2022.114790
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    Psychiatry Research-neuroimaging
  • 影响因子:
    2.3
  • 作者:
    Huiying Wang;Yitian Ma;Xiaochen Wang;Wenpei Zhang;Wei Han;Haobiao Liu;Miao Li;Jing Xiao;Hang Wei;Changqing Wang;Shria Sindhwani;Tianxiao Zhang;Fanglin Guan;John P. Rice
  • 通讯作者:
    John P. Rice
Prioritization of risk genes for Alzheimer's disease: an analysis framework using spatial and temporal gene expression data in the human brain based on support vector machine
阿尔茨海默病风险基因的优先排序:基于支持向量机的人脑时空基因表达数据的分析框架
  • DOI:
    10.1101/2023.02.06.23285522
  • 发表时间:
    2023
  • 期刊:
    medRxiv
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Wang, Shiyu;Fang, Xixian;Wen, Xiang;Yang, Congying;Yang, Ying;Zhang, Tianxiao
  • 通讯作者:
    Zhang, Tianxiao

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其他文献

北京汉族人群MAFB基因SNPs等位基因及单体型频率研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    现代口腔医学杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    张博;张天啸;张小龙;王红
  • 通讯作者:
    王红

其他文献

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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