“模块化自组装”DNA计算模型的研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    61672044
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    16.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    F0214.新型计算及其应用基础
  • 结题年份:
    2017
  • 批准年份:
    2016
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2017-01-01 至2017-12-31

项目摘要

The project will focus on the DNA computing model based on “multi-level modular self-assembly”. In this computing model, nano-modules are the units with composable, resoluble and replaceable abilities. Through designing the units as different functional modules, and dividing the whole problem into individual sub-units, the complex computing problem will be figured out. To realize the model, the specific nanostructures will be produced by “down to up” integrated module. In addition, the computing system will be achieved by introducing nanoparticles and high polymers. Finally, large scale computing and information processing can be carried out via Algorithm design and modular assembly. In general, this project targets to the key of computing area, and is combined with hot topic. Therefore, it is important and valuable to pay more attentions to this computing model research.
本项目拟围绕基于“多级模块自组装”技术的DNA计算模型展开多层次研究。在该计算系统的结构中,纳米模块是可组合、分解和更换的单元。通过将不同组分设定为不同的功能模块,同时把问题分解成独立、互相作用的亚单元,来实现大型的计算问题的处理。模型的具体实现是利用自组装技术,自下而上进行模块化集成,获得多种特异性结构。再利用分层多级组装的方法,引入纳米颗粒或蛋白质与高分子等结构,分步实现计算系统。再通过算法设计和模块分级集成,设计并实现大规模型逻辑计算系统和信息处理单元。从整体上看,该项目针对目前计算领域核心问题,又与前沿热点紧密结合,因此对该计算展开多角度的研究具有重要的意义和应用价值。

结项摘要

在国家自然科学基金项目:“模块化自组装”DNA计算模型的研究(编号61672044)”资助下,北京大学张成副研究员课题组在一年期项目执行期间,结合DNA自组装和纳米颗粒技术,通过设计复杂分子逻辑回路,实现了纳米尺度下信息计算和处理,取得了初步的研究成果。.研究组针对DNA分子计算的复杂性和多样性,结合纳米信息处理和纳米智能技术,引入例如DNA自组装和链置换、纳米孔和DNA/纳米颗粒等技术,对逻辑计算和纳米操控体系等领域展开研究。在项目执行的一年期间,课题组发表SCI论文3篇,包括JCR分区一区文章1篇,二区文章2篇,分别发表在本领域高水平期刊Nanoscale (IF:7.36),Information Sciences(IF:4.8)和Langmuir(IF:3.83)。同时,项目执行期间毕业研究生2人。特别是结合了DNA分子电路和纳米颗粒技术,本项目的实现了复杂纳米颗粒技术在分子计算信息处理中的应用,同时完成了生物酶介导的大规模分子电路。相信本项目的顺利实施会促进包括纳米集成、并行计算、纳电子学等研究领域共同发展。.

项目成果

期刊论文数量(2)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Programmable Regulation of DNA Conjugation to Gold Nanoparticles via Strand Displacement
通过链置换对 DNA 与金纳米粒子缀合进行可编程调节
  • DOI:
    10.1021/acs.langmuir.7b02620
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    LANGMUIR
  • 影响因子:
    3.9
  • 作者:
    Zhang Cheng;Wu Ranfeng;Li Yifan;Zhang Qiang;Yang Jing
  • 通讯作者:
    Yang Jing
Nicking enzyme-controlled toehold regulation for DNA logic circuits
DNA 逻辑电路的刻痕酶控制立足点调节。
  • DOI:
    10.1039/c7nr06484e
  • 发表时间:
    2017-12-14
  • 期刊:
    NANOSCALE
  • 影响因子:
    6.7
  • 作者:
    Pan, Linqiang;Wang, Zhiyu;Zhang, Cheng
  • 通讯作者:
    Zhang, Cheng

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  • 通讯作者:
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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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