非甾体抗炎药物干预对巨噬细胞(RAW264.7)的脂质组学分析及生物信息学评价

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    21275036
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    78.0万
  • 负责人：
    冯毅凡
  • 依托单位：
    广东药科大学
  • 学科分类：
    B04.化学测量学
  • 结题年份：
    2016
  • 批准年份：
    2012
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2013-01-01 至2016-12-31

项目摘要

In this study, as the core technology of modern analytical techniques to explore the correlation of the endogenous lipid components in the different states of the cell changes, combined with chemometrics and bioinformatics to elucidate its.This study was used mainly on-line analysis to identify the application of chemical metrology with chromatography - spectroscopy analytical techniques ,and screening the best algorithm to deal with the experimental data; the total lipid composition of the RAW264.7 cells were identified, and under different states (normal state. inflammatory status, delivery status) the changes in the the lipid component of the cell was quantitative described for seek out the characteristic lipid components; characterize their biological significance by Bioinformatics , and predict potential targets which is cells endogenous lipid components related to the inflammatory effect ,and use these targets on the role of anti-inflammatory activity of galangal diarylheptanoids evaluation suggesting its possible anti-inflammatory mechanism..This is the first application of chromatography - spectroscopy combined technology associated with chemometric methods and bioinformatics methods to analyze the lipid components the RAW264.7 cells under different states; and propose a method which is for drug evaluation screening by chromatography - spectroscopy Analytical Chemistry techniques at the cellular level.
本研究以现代分析技术为核心技术，探讨细胞不同状态下的内源性脂质成分变化的内在相关性，结合化学计量学与生物信息学阐明其机制，并应用于药物筛选评价。.具体主要采用色谱-波谱联用分析技术，进行在线分析鉴别，应用化学计量学原理，筛选最佳算法处理实验数据；对RAW264.7细胞总脂质成分进行鉴别，并对不同状态（正常状态、炎症状态、给药状态）下该细胞脂质成分的变化进行量化描述，寻找与炎症反应有关的特征性脂质成分；采用生物信息学表征其生物学意义，预测潜在的与炎症反应相关的细胞内源性脂质成分靶点,并应用以上靶点对高良姜二苯基庚烷的抗炎活性作用进行评价，推测其可能的抗炎机理。.本研究首次应用色谱-波谱联用技术结合化学计量学方法及生物信息学方法对RAW264.7细胞不同状态下的脂质成分进行分析鉴别，提出一种基于色谱-波谱分析化学技术的细胞水平药物评价筛选方法，为系统药物研究提供理论支持。

结项摘要

本项目主要从以下几个方面开展研究，探讨非甾体抗炎药物干预RAW264.7细胞炎症模型的甘油磷脂代谢变化，以及高良姜二苯基庚烷A对炎症细胞甘油磷脂代谢的影响及其抗炎作用机制。.（1）.本课题组在研究过程中，首先优化各种相关分析条件，建立了一套稳定可靠的UPLC/Q-TOF MS分析方法，并运用此法对RAW264.7细胞膜脂质成分进行鉴定。.（2）.通过MTT实验确定非甾体抗炎药物及二苯基庚烷A的最佳给药浓度，确定炎症模型的造模条件并通过检测TNF-α的含量验证炎症模型是否成功。.（3）.RAW264.7细胞脂质成分经过 UPLC/Q-TOF MS 分析之后，产生大量的数据，本课题组建立了准确可靠的的液质数据导出方法及预处理方法（MarkerLynx）。随后，通过SIMCA-P软件、R语言以及统计学方法对导出的原始数据进行分析，筛选出潜在甘油磷脂生物标记物。.（4）.利用UPLC/Q-TOF MS分析方法以及化学计量学方法，将空白组、炎症组、非甾体抗炎药物（阿司匹林、布洛芬、吲哚美辛）给药组两两比较，筛选得到炎症组与空白组的病理标记物28个，29,23,22吲哚美辛与炎症组之间的药理标记物29个，阿司匹林与炎症组之间的药理标记物23个，布洛芬与炎症组之间的药理标记物22。并得到17个不同非甾体抗炎药物之间共有的潜在甘油磷脂生物标记物。.（5）.利用UPLC/Q-TOF MS分析方法分析空白组、炎症组、给药组在不同时间点（0.5h，4h，12h，16h，24h）的甘油磷脂代谢变化，筛选各组在各个时间点的潜在甘油磷脂生物标记物，得到不同时间点的10个生物标记物。其中PC（17:1/18:1）和PA(18:0/18:4)贯穿于炎症刺激16h-24小时过程中，可以作为细胞炎症开始消退，细胞膜上钙离子亲和力下降的给药生物标记物。这为研究炎症过程中甘油磷脂的动态变化奠定基础.（6）.应用已建立的分析方法对二苯基庚烷A干预RAW264.7细胞炎症模型的甘油磷脂代谢进行研究，寻找二苯基庚烷A在炎症过程中的脂质作用靶点。并通过生物学实验，检测二苯基庚烷A对NO、PGE2、TNF-α、IL-1β、iNOS、COX-2表达水平的影响以及其对RAW264.7细胞炎症模型NF-κB信号通路和MAPKs信号通路的影响，从而对其抗炎机制进行研究。结果显示二苯基庚烷A与炎症组之间的药理标记物共有23个

项目成果

期刊论文数量（12）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
基于UHPLC-QTOF/MS技术RAW264.7巨噬细胞甘油磷脂成分的快速表征
  • DOI：
    10.16438/j.0513-4870.2016-0224
  • 发表时间：
    2016-03
  • 期刊：
    药学学报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    佘玉奇;肖雪蓉;吴 霞;冯毅凡
  • 通讯作者：
    冯毅凡
Dynamic analysis of phospholipid metabolism of mouse macrophages treated with common non-steroidal anti-inflammatory drugs
常用非甾体类抗炎药处理小鼠巨噬细胞磷脂代谢的动态分析
  • DOI：
    10.1007/s11010-015-2578-9
  • 发表时间：
    2015
  • 期刊：
    Molecular and Cellular Biochemistry
  • 影响因子：
    4.3
  • 作者：
    Haibo Peng;Xia Wu;Lifang Zhao;Yifan Feng
  • 通讯作者：
    Yifan Feng
Fragmentation patterns of five types of phospholipids by ultra-high-performance liquid chromatography electrospray ionization quadrupole time-of-flight tandem mass spectrometry
超高效液相色谱-电喷雾电离四极杆-飞行时间串联质谱法测定五种磷脂的裂解模式
  • DOI：
    10.1039/c5ay00776c
  • 发表时间：
    2016-01-01
  • 期刊：
    ANALYTICAL METHODS
  • 影响因子：
    3.1
  • 作者：
    Pi, Juanjuan;Wu, Xia;Feng, Yifan
  • 通讯作者：
    Feng, Yifan
二苯基庚烷A干预RAW264.7细胞炎症模型甘油磷脂的UPLC-Q/TOF MS分析
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2016
  • 期刊：
    分析测试学报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    佘玉奇;张国改;吴 霞;冯毅凡
  • 通讯作者：
    冯毅凡
An analysis on the suppression of NO and PGE2 by diphenylheptane A and its effect on glycerophospholipids of lipopolysaccharide-induced RAW264.7 cells with UPLC/ESI-QTOF-MS
UPLC/ESI-QTOF-MS分析二苯庚烷A对NO和PGE2的抑制及其对脂多糖诱导的RAW264.7细胞甘油磷脂的影响
  • DOI：
    10.1007/s00216-016-9383-5
  • 发表时间：
    2016-05-01
  • 期刊：
    ANALYTICAL AND BIOANALYTICAL CHEMISTRY
  • 影响因子：
    4.3
  • 作者：
    She，Yuqi;Zheng，Qifan;Feng，Yifan
  • 通讯作者：
    Feng，Yifan

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其他文献

云南重楼中三萜皂苷类化合物抑制鼻咽癌细胞活性的三维定量构效关系研究
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云南重楼中2个脂肪酸的分离鉴定及其抑制鼻咽癌细胞活性研究
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  • 作者：
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  • 通讯作者：
    李药兰
广陈皮水提物的化学成分分析
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  • 通讯作者：
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UPLC-Q-TOF-MS对桑白皮总黄酮提取物的快速分析
  • DOI：
    10.13422/j.cnki.syfjx.2017060078
  • 发表时间：
    2017
  • 期刊：
    中国实验方剂学杂志
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    丁嘉华;冯毅凡;李卫民;高英
  • 通讯作者：
    高英

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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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