基于特征性Tp0136基因序列的神经梅毒诊断方法的建立及其应用

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81802089
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    22.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H2605.分子生物学检验
  • 结题年份:
    2021
  • 批准年份:
    2018
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2019-01-01 至2021-12-31

项目摘要

Neurosyphilis has been recognized as a severe disease and difficult to manage, and up to now, laboratory indicator with high specificity for diagnosing neurosyphilis is still unavailable. The enhanced CDC molecular subtyping system is capable of detecting the dominant subtype of Treponema pallidum (Tp) in patients with neurosyphilis. However, employing this method is insufficient to differentiate the neurosyphilis and non-neurosyphilis. The product of Tp0136 is a part of outmembrane protein of Tp, it involves with the adhesion during infection process and it is highly variable in nucleotide sequence. Its variation may lead to the immune evasion, and consequently elevates the risk of developing neurosyphilis. Our pilot study revealed the genetic differences between Tp0136 sequence deprived from neurosyphilis and primary stage syphilis patients, indicating the solid potential for Tp0136 served as molecular biomarker for diagnosing neurosyphilis. The present study attempts to compare the Tp0136 sequence deprived from different types of syphilis patient and different molecular subtypes of Tp, and obtain the specific variations (multiple variations assumed) associated with neurosyphilis by employing bioinformatics; The animal experiment would be conducted to further validate the neuroinvasion caused by the Tp with specific Tp0136 variations, and select five biomarkers for the diagnosis of neurosyphilis. Multi-target real-time PCR system for detecting the specific Tp0136 variations would be established and applied in clinical samples for evaluation. The implementation of present study would improve the early diagnosis of neurosyphilis, and possesses critical value for the prevention and management of syphilis.
神经梅毒的破坏性大、防治困难,缺乏特异的实验室诊断指标。增强分子分型方法可以发现神经梅毒优势亚型,但不足以完全区分神经梅毒和非神经梅毒。Tp0136基因所编码的外膜蛋白在感染过程中参与黏附,且具高度变异性,其变异可能造成免疫逃逸发生神经梅毒;本研究预实验显示神经梅毒和一期梅毒患者Tp0136基因存在异质性,是潜在的神经梅毒诊断指标。本研究拟采用高通量测序比较不同类型梅毒患者、不同分子型别梅毒螺旋体的Tp0136基因序列差异,获得神经梅毒特征性Tp0136变异序列;然后采用生物信息学技术初筛神经梅毒诊断靶标(理论上有多个);采用动物实验验证具有特征性分子靶标的Tp株的致神经梅毒作用,明确可用于诊断的分子靶标(5个以内);构建多靶实时荧光定量PCR用于神经梅毒的早期诊断,并开展临床评估。该课题的实施将有助于神经梅毒的早期诊断,对梅毒的防治具有重要的临床价值。

结项摘要

神经梅毒是一种破坏力强、难以防治的疾病,目前尚无特异性的指标用于诊断神经梅毒。有鉴于我国梅毒患病率逐年上升,神经梅毒的患病率也随之增高,因此开展关于神经梅毒诊断以及发病机制的研究具有重要公共卫生意义。本研究通过非靶向代谢组学方法检测了神经梅毒患者、梅毒非神经梅毒患者以及无梅毒感染者的脑脊液,并通过多种统计学方法鉴定出几种具有差异的代谢物,其中部分代谢物在神经梅毒患者脑脊液中显著增高,具有作为诊断标志物的潜质。此外,本研究还通过检测梅毒患者和健康对照的血液代谢物,寻找血液的差异代谢物和进行KEGG分析,鉴定的差异代谢物和代谢途径可为研究梅毒螺旋体的代谢特征提供研究基础。Tp0136是梅毒螺旋体的外膜蛋白之一,其可在梅毒螺旋体对宿主细胞的黏附过程中发挥重要作用。本研究通过将tp0136重组蛋白与HMEC-1细胞共培养,细胞迁移实验显示其迁移活性与tp0136蛋白具有剂量-反应关系,5ug/mL tp0136浓度下细胞覆盖面积为95.7%,与之相似的是,HMEC-1细胞的CCL2 mRNA和蛋白水平也和tp0136蛋白具有剂量-反应关系。通过加入CCL2单克隆抗体和CCR2阻滞剂,发现细胞的迁移活性受到显著抑制。上述结果表明,tp0136蛋白可通过上调CCL2进而促进细胞迁移,其在梅毒螺旋体感染导致的上皮细胞损伤中具有重要作用。

项目成果

期刊论文数量(4)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Analysis of serum metabolite profiles in syphilis patients by untargeted metabolomics
非靶向代谢组学分析梅毒患者血清代谢物谱
  • DOI:
    10.1111/jdv.15530
  • 发表时间:
    2019-07-01
  • 期刊:
    JOURNAL OF THE EUROPEAN ACADEMY OF DERMATOLOGY AND VENEREOLOGY
  • 影响因子:
    9.2
  • 作者:
    Liu, L-L;Lin, Y.;Yang, T-C
  • 通讯作者:
    Yang, T-C
Metabolite Profiles of the Cerebrospinal Fluid in Neurosyphilis Patients Determined by Untargeted Metabolomics Analysis
通过非靶向代谢组学分析确定神经梅毒患者脑脊液的代谢谱
  • DOI:
    10.3389/fnins.2019.00150
  • 发表时间:
    2019-02-26
  • 期刊:
    FRONTIERS IN NEUROSCIENCE
  • 影响因子:
    4.3
  • 作者:
    Liu, Li-Li;Lin, Yong;Yang, Tian-Ci
  • 通讯作者:
    Yang, Tian-Ci
Recombinant Treponema pallidum protein Tp0136 promotes fibroblast migration by modulating MCP-1/CCR2 through TLR4
重组梅毒螺旋体蛋白 Tp0136 通过 TLR4 调节 MCP-1/CCR2 促进成纤维细胞迁移
  • DOI:
    10.1111/jdv.16162
  • 发表时间:
    2020-01-19
  • 期刊:
    JOURNAL OF THE EUROPEAN ACADEMY OF DERMATOLOGY AND VENEREOLOGY
  • 影响因子:
    9.2
  • 作者:
    Luo, X.;Gao, Z-X;Yang, T-C
  • 通讯作者:
    Yang, T-C

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其他文献

开放式创新生态系统演化的微观机理及价值
  • DOI:
    10.13581/j.cnki.rdm.20190052
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    研究与发展管理
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    林勇;张昊
  • 通讯作者:
    张昊
综合统计外部环境的分析与判断
  • DOI:
    10.13546/j.cnki.tjyjc.2016.02.004
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    统计与决策
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    --
  • 作者:
    林勇;李依霏
  • 通讯作者:
    李依霏
Capillary morphogenesis protein 2 is a novel prognostic biomarker and plays oncogenic roles in glioma
毛细血管形态发生蛋白 2 是一种新型预后生物标志物,在神经胶质瘤中发挥致癌作用
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    10.1002/path.5062
  • 发表时间:
    2018-06
  • 期刊:
    Journal of Pathology
  • 影响因子:
    7.3
  • 作者:
    谈娟;刘媚;张俊英;姚月良;王艳霞;林勇;宋康;谭娇;吴晋蓉;崔有宏;王岩;卞修武
  • 通讯作者:
    卞修武
用P-G-D图表研究中国光气候状况
  • DOI:
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  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    土木建筑与环境工程
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  • 作者:
    何荥;林勇
  • 通讯作者:
    林勇
Emergency supplies scheduling model for single demand point and its constrained multi-objective particle swarm optimization algorithm
单需求点应急物资调度模型及其约束多目标粒子群优化算法
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    Biotechnology: An India Journal
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    林勇;姜大立;张立;汪贻生
  • 通讯作者:
    汪贻生

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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