T细胞活化过程中cd28/ctla4/icos基因簇附近活性调控元件的鉴定

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    31071123
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    34.0万
  • 负责人：
    许雪青
  • 依托单位：
    中国人民解放军第三军医大学
  • 学科分类：
    C0601.遗传物质结构与功能
  • 结题年份：
    2013
  • 批准年份：
    2010
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2011-01-01 至2013-12-31

项目摘要

鉴定活性调控元件(active regulatory elements)是全面了解表达调控网络的关键步骤，也是功能基因组学的重要研究内容。CD28家族的CD28、CTLA4、ICOS是免疫应答启动和效应中的最重要共刺激分子。位于同一"基因荒漠"内的这三个相邻基因受到精细调控，有着各自的表达特点，其在T细胞活化过程中的有序表达对免疫功能的发挥至关重要。但该区域的调控元件未曾得到系统的研究。调控元件在发挥功能时所处的染色质区域变得松散可及，形成DNA酶超敏感位点（DH位点）。后者对应于染色质上的开放结构，是活性调控元件的重要标志。本研究通过分析T细胞活化前后cd28基因簇附近的DH位点来寻找活化前后的活性调控元件，然后结合报告基因、EMSA以及染色体免疫共沉淀等技术来研究这些调控元件的功能。结果将有助于深入了解这三个基因的转录调控机制，也是对这一重要免疫相关区域较全面的基因组注释。

结项摘要

鉴定基因组中存在的调控元件是全面了解表达调控网络的关键步骤，也是功能基因组学的重要研究内容。目前仍有大量功能基因附近的调控元件未能得到系统完整的鉴定分析。CD28基因家族的CD28，CTLA4，ICOS是免疫应答启动和效应中的最重要共刺激分子。位于染色体同一“基因荒漠”内的这三个相邻基因受到精细调控，有着各自的表达模式特点，其在T细胞活化过程中的正确有序表达对正常免疫功能的发挥至关重要。但该区域中存在的调控元件未曾得到系统全面的研究。在本研究中，我们以cd4+T细胞为研究对象，通过分析T细胞活化前后cd28基因簇区域存在的DH位点来寻找活化前后不同的活性转录调控元件。结果发现CD4+ T 细胞活化前后 cd28/ctla4/icos 基因簇区域所处 1M 基因荒漠内存在的 DH 位点13个，利用报告基因实验发现其中影响基因表达的位点5个位点。其中4个能促进基因表达，1个能抑制基因表达。进一步发现与T细胞活化前后相关的位点2个。我们的研究是对 cd28/ctla4/icos 基因簇区域非编码区域功能元件的较全面注释，这些DNA功能元件的鉴定有望为深入研究疾病环境下cd28/ctla4/icos异常活化表达机制提供线索。

项目成果

期刊论文数量（2）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
利用开放染色质结构鉴定T细胞活化前后cd28/ctla4/icos基因簇区域差异调控元件
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2011
  • 期刊：
    中国的遗传学研究——遗传学进步推动中国西部经济与社会发展——2011年中国遗传学会大会论文摘要汇编
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    白云;许雪青
  • 通讯作者：
    许雪青

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其他文献

Bax基因P53结合位点多态性与食管鳞癌易感性的关联研究
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    第三军医大学学报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    刘波涛;Xu Xueqing;Xiong Gang;Guo Hong;Guan Xingying;Bai Yun;王凯;许雪青;熊刚;郭洪;官兴颖;白云;Liu Botao;Wang Kai
  • 通讯作者：
    Wang Kai
肺癌细胞中NF-κB2基因表达及启动子区域甲基化状态分析
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2014
  • 期刊：
    免疫学杂志
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    蒋文斌;李时飞;王丰;许雪青;杨绍俊;贾双荣;李发科;商亚;陈鸣
  • 通讯作者：
    陈鸣

其他文献

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cd28/ctla4/icos基因簇内功能性SNP的鉴定
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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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