大肠杆菌借助SecY蛋白转位通道非特异性跨内膜运输糖的研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    21776010
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    64.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    B0812.生物化工与合成生物工程
  • 结题年份:
    2021
  • 批准年份:
    2017
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2018-01-01 至2021-12-31

项目摘要

The main purpose of this project is to realize the non-specific transport of sugars across the inner membrane of Escherichia coli. This research includes the following key contents: Release of the SecY protein translocation channel from fully preventing the permeation of the water-soluble substances by rational mutation of its plug and pore ring residues, thus weakening the diffusion barrier of sugars across the inner membrane. Using of the mutant SecY channel, the SARS shell protein SCVE and the sugar kinase to construct a simple-diffusion transmembrane system and a phosphorylation supplementary system. The replacement of the transport system of xylose, arabinose, lactose or cellobiose with the simple-diffusion system will be tried, and the combination of the simple-diffusion system and the phosphorylation supplementary system will be employed to replace the transport system of glucose, fructose or mannose. The recombinant strains with new sugar transport systems will be used to produce xylitol in a mixed-sugar fermentation process. Moreover, the principles for designing, constructing and co-working of the simple-diffusion system and the phosphorylation supplementary system will be intensively studied. The realization mechanism of overcoming the substrate specificity, saturation phenomenon, inhibitor sensitivity, and inducer exclusion by using the simple-diffusion system will also be discussed. This project is expected to provide a new sugar transport strategy for E. coli, and the results will help to further expand the application prospect of E. coli in metabolic engineering and synthetic biology.
本项目以大肠杆菌非特异性跨内膜转运糖分子为目的,研究内容包括:利用栓塞结构域和氨基酸孔环的理性突变,解除SecY蛋白转位通道对水溶性物质的严格密封,削弱细胞内膜对糖分子的屏障作用;结合突变型SecY通道、SARS病毒外壳蛋白SCVE和糖类激酶,构建简单扩散跨膜系统及磷酸化辅助系统;以简单扩散跨膜系统替代木糖、阿拉伯糖、乳糖和纤维二糖转运系统;结合简单扩散跨膜系统和磷酸化辅助系统替代葡萄糖、果糖和甘露糖转运系统;尝试新型糖运输系统在混糖发酵制备木糖醇中的应用。此外,拟探讨简单扩散跨膜系统的设计、构建原理以及简单扩散跨膜系统和磷酸化辅助系统的适配机制,阐明简单扩散跨膜系统克服底物狭窄、“饱和现象”、抑制物敏感和“诱导物排斥”的实现机理和调控策略。本项目有望为大肠杆菌提供新的糖转运策略,研究成果有助于进一步拓展大肠杆菌在代谢工程和合成生物学中的应用前景。

结项摘要

糖特异性转运蛋白在糖代谢的初始阶段,即糖通过质膜进入细胞质的过程中,起决定性作用。细菌中的SecY复合物(SecYEG)是负责蛋白质易位的膜通道。本项目的研究表明,透化的SecY通道可以被用作大肠杆菌的非特异性糖转运蛋白。删除栓塞结构域的SecY允许葡萄糖、果糖、甘露糖、木糖和阿拉伯糖通过,并且通过额外的孔环突变能够促进乳糖转运,表明利用透化后的SecY通道转运糖类分子与糖的立体特异性无关。重组大肠杆菌在多种单糖上表现出快速生长特性,并有助于消除运输饱和,提高糖耐受性,减少竞争性抑制和解除碳分解代谢物抑制效应,这些现象在天然的糖转运系统中无法避免。项目组在产木糖醇的大肠杆菌JM109 (DE3)中引入了SecY (ΔP)作为木糖摄取的通道。发现SecY (ΔP)通道除了可以快速运输木糖外,它还不受 XylB 催化形成的木糖醇磷酸的抑制干扰,解决了XylFGH和XylE转运蛋白运输木糖产木糖醇的技术瓶颈。更重要的是,在SecY (ΔP)通道和碳分解代谢物抑制效应的协同作用下,大肠杆菌可以响应葡萄糖浓度自动控制木糖流向戊糖磷酸 (PP) 途径和木糖醇合成途径的通量,从而确保重组细胞能够充分利用碳源,并尽可能提高木糖醇的得率。此外,本项目提出了一种通过重组大肠杆菌JM109 (DE3)发酵,高效生产D-阿洛酮糖的方法。该菌株共表达了SecY (ΔP)通道和D-阿洛酮糖3-差向异构酶(DPEase),确保了D-果糖能够以其非磷酸化形式转运,继而被细胞转化为D-阿洛酮糖。通过补料分批发酵,D-阿洛酮糖的产量达到≈23.3 g/L。

项目成果

期刊论文数量(4)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(4)
Engineering Escherichia coli for D‑Allulose Production from D‑Fructose by Fermentation
工程大肠杆菌用于通过发酵从 D-果糖生产 D-阿洛酮糖
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    Journal of Agricultural and Food Chemistry
  • 影响因子:
    6.1
  • 作者:
    Qiang Guo;Ling-Jie Zheng;Xuan Luo;Xin-Quan Gao;Chen-Yang Liu;Li Deng;Li-Hai Fan;Hui-Dong Zheng
  • 通讯作者:
    Hui-Dong Zheng
Intelligent self-control of carbon metabolic flux in SecY-engineered Escherichia coli for xylitol biosynthesis from xylose-glucose mixtures
SecY工程大肠杆菌中碳代谢通量的智能自控用于从木糖-葡萄糖混合物生物合成木糖醇
  • DOI:
    10.1002/bit.28002
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    Biotechnology and Bioengineering
  • 影响因子:
    3.8
  • 作者:
    Qiang Guo;Irfan Ullah;Ling‐Jie Zheng;Xin‐Quan Gao;Chen‐Yang Liu;Hui‐Dong Zheng;Li‐Hai Fan;Li Deng
  • 通讯作者:
    Li Deng
Reprogramming of sugar transport pathways in Escherichia coli using a permeabilized SecY protein-translocation channel
使用透化 SecY 蛋白易位通道重编程大肠杆菌中的糖转运途径
  • DOI:
    10.1063/5.0028557
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    Biotechnology and Bioengineering
  • 影响因子:
    3.8
  • 作者:
    Guo Qiang;Mei Sen;Xie Chong;Mi Hao;Jiang Yang;Zhang Shi-Ding;Tan Tian-Wei;Fan Li-Hai
  • 通讯作者:
    Fan Li-Hai
Biosynthesis of D-glucaric acid from sucrose with routed carbon distribution in metabolically engineered Escherichia coli
在代谢工程大肠杆菌中利用路由碳分布从蔗糖生物合成 D-葡萄糖酸
  • DOI:
    10.1016/j.ymben.2018.04.020
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    Metabolic Engineering
  • 影响因子:
    8.4
  • 作者:
    Qu Ya-Nan;Yan Hao-Jie;Guo Qiang;Li Jia-Long;Ruan Yu-Cheng;Yue Xiu-Zheng;Zheng Wen-Xin;Tan Tian-Wei;Fan Li-Hai
  • 通讯作者:
    Fan Li-Hai

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    --
  • 作者:
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  • 通讯作者:
    谭天伟
基于纤维小体展示技术的酿酒酵母纤维素乙醇研究进展
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    中国科学:化学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    范立海;谭天伟
  • 通讯作者:
    谭天伟

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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