噬菌体尾部蛋白介导噬菌体对宿主菌特异性吸附的机理研究

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基本信息

项目摘要

In recent years, the emergence of multi-drug resistant bacteria poses a severe challenge to antibiotic therapy, phage therapy is considered as an alternative way of controlling bacterial infections and contaminations. Among them, tailed phages accounted for 96% of the total phages. Phage’s host specificity depends largely on the recognition and adsorption of the phage tail to its host surface receptors, causing subsequent process, and ultimately kill the bacteria. Therefore, recognition and analysis of tail structure and tail genes function is the required step for undestanding the host specificity of bacteriophages. In this study, three completely different phages will be studied. Their morphology and molecular genetics features will be fully characterised, the receptors and the tail proteins which are responsible for receptor binding will be identified and validated using genome sequencing, construction of mutant library, protein expression and purification, surface plasmon resonance technology, construction of truncated receptor binding proteins and receptors, site-directed mutagenesis, construction of mutants and complementary strains and so on. Finally, the mechanism of phage-host interaction from the molecular level and the molecular mechanism of phage’s host specificity will be determined. This study will provide a theoretical basis for phage prevention and control of multidrug resistant bacteria. Completion of this project will also provide significant reference value to study of phage therapy for other pathogens.
近年来,多重耐药菌的不断出现对抗生素治疗提出了严峻的挑战,而噬菌体治疗是细菌预防和治疗的替代方案。其中,有尾噬菌体占噬菌体总量的96%,有尾噬菌体对细菌的吸附依赖于噬菌体尾部蛋白组成的吸附器官与宿主菌表面受体特异性识别,从而引发后续的裂解过程,最终杀死细菌。因此,对噬菌体尾部蛋白的结构和功能的认知是理解噬菌体宿主特异性的重要环节。本研究以三株完全不同的有尾噬菌体为对象,拟通过基因组学、突变文库构建、蛋白表达和纯化、表面等离子共振、基因敲除、截短体构建、定点突变等研究方法,鉴定噬菌体尾部的受体结合蛋白和宿主菌表面受体,验证受体结合蛋白与受体的相互作用,最终,阐述噬菌体尾部蛋白介导噬菌体特异性吸附的分子机制。该研究将为多重耐药菌的噬菌体治疗奠定理论基础,同时,对于其它噬菌体的裂解机制研究也具有借鉴意义。

结项摘要

抗生素耐药菌仍然是常规抗菌感染治疗的一大障碍,所以非抗生素类抗感染药的研究受到了广泛的重视,噬菌体有望成为人类制服病菌的新武器。本研究对多株有尾噬菌体的生物学特征进行了鉴定和系统描述,包括形态学特征鉴定、分类学鉴定、宿主范围、一步生长曲线、宿主范围鉴定等。对多株有尾噬菌体的基因组进行了深度解析和功能注释,对编码的尾部蛋白的基因模块进行了深入分析和比对,对噬菌体的受体结合蛋白和宿主菌表面受体进行了预测和验证,扩展了人们对噬菌体的认知,为多重耐药菌的噬菌体治疗奠定了理论基础,对于其它噬菌体的裂解机制研究也具有重要的借鉴意义。

项目成果

期刊论文数量(3)
专著数量(0)
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专利数量(0)
Characterization of Tail Sheath Protein of N4-Like Phage phiAxp-3.
N4 样噬菌体 phiAxp-3 尾鞘蛋白的表征
  • DOI:
    10.3389/fmicb.2018.00450
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    Frontiers in microbiology
  • 影响因子:
    5.2
  • 作者:
    Zhang Z;Tian C;Zhao J;Chen X;Wei X;Li H;Lin W;Feng R;Jiang A;Yang W;Yuan J;Zhao X
  • 通讯作者:
    Zhao X
Characterizing the Biology of Lytic Bacteriophage vB_EaeM_phi Eap-3 Infecting Multidrug-Resistant Enterobacter aerogenes
感染多重耐药产气肠杆菌的裂解噬菌体 vB_EaeM_phi Eap-3 的生物学特征
  • DOI:
    10.3389/fmicb.2019.00420
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    Frontiers in Microbiology
  • 影响因子:
    5.2
  • 作者:
    Zhao Jiangtao;Zhang Zheng;Tian Changyu;Chen Xiao;Hu Lingfei;Wei Xiao;Li Huan;Lin Weishi;Jiang Aimin;Feng Ruo;Yuan Jing;Yin Zhe;Zhao Xiangna
  • 通讯作者:
    Zhao Xiangna
Identification and molecular characterization of Serratia marcescens phages vB_SmaA_2050H1 and vB_SmaM_2050HW
粘质沙雷氏菌噬菌体 vB_SmaA_2050H1 和 vB_SmaM_2050HW 的鉴定和分子表征
  • DOI:
    10.1007/s00705-019-04169-1
  • 发表时间:
    2019-02
  • 期刊:
    Archives of Virology
  • 影响因子:
    2.7
  • 作者:
    Tian Changyu;Zhao Jiangtao;Zhang Zheng;Chen Xiao;Wei Xiao;Li Huan;Lin Weishi;Ke Yuehua;Hu Lingfei;Jiang Aimin;Feng Ruo;Yang Wenhui;Jing Ying;Yuan Jing;Luo Yanping;Zhao Xiangna
  • 通讯作者:
    Zhao Xiangna

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其他文献

合成噬菌体的贡献与风险
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2011
  • 期刊:
    生命科学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    赵向娜;杨瑞馥
  • 通讯作者:
    杨瑞馥

其他文献

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赵向娜的其他基金

鼠疫耶尔森氏菌噬菌体Yep-phi受体结合蛋白与受体相互作用的分子机制研究
  • 批准号:
    31200137
  • 批准年份:
    2012
  • 资助金额:
    26.0 万元
  • 项目类别:
    青年科学基金项目

相似国自然基金

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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