基于单颗粒示踪技术的膜受体蛋白与配体分子相互作用的原位动态分析

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    21874039
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    64.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    B0404.化学与生物传感
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2018
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2019-01-01 至2022-12-31

项目摘要

Receptor-ligand interaction is the biological foundation of various physiological processes such as the materials exchange and signal transduction between cell and extracellular microenvironment. However, the in-situ and real-time investigation of receptor-ligand interactions in living cell remain a great challenge due to the fast dynamics, reversibility and heterogeneity. In the project, with functionalized gold nanoparticle as a probe, we attempt to construct a robust single-particle tracking technique, enabling us to extract the receptor-ligand interaction dynamics as well as the corresponding bioaffinity constant at the nonequilibrium state from the transient mobility analysis with the aid of pattern recognition and reaction kinetics studies. With this elegant strategy, both the mechanism and efficiency of aptamers when used as diagnostic probes and antagonists will be investigated. We anticipated this project could provide a new avenue for exploiting and evaluating the aptamer-based drugs in the future.
细胞膜受体蛋白与配体分子之间的相互作用(Receptor-Ligand Interaction)是细胞与胞外微环境之间进行物质交换、信息交流等生命活动的生物学基础。然而,这一作用过程具有作用时间短、过程可逆以及差异性大等特点,使得在活细胞水平上对单个受体与配体分子的相互作用进行原位动态分析面临着巨大的挑战。本项目计划以功能化金纳米粒子为探针,结合化学计量学模式识别方法和反应动力学原理,构建适用于受体与配体相互作用过程原位动态分析的单颗粒示踪技术,实现活细胞水平上受体蛋白与配体分子结合动力学过程的分析以及非平衡状态下生物亲和常数的测量。利用这一方法,研究以膜蛋白质为靶标的核酸适配体作(Aptamer)为诊疗探针识别分子与类‘拮抗药物’的作用机制与效率,为核酸类新型药物的开发和药效评估等基础应用研究提供新的方法。

结项摘要

细胞膜受体蛋白与配体分子之间的相互作用是细胞与胞外微环境之间进行物质交换、信息交流等生命活动的生物学基础,是细胞信号传导动态调控的关键。然而,在活细胞水平上研究膜受体蛋白与配体动态相互作用仍然面临着瞬态信息准确获取难度大、动力学过程难以量化等挑战。本项目以配体功能化修饰的纳米颗粒为探针,开发了适用于受体蛋白与配体互作分析的数据挖掘显微示踪技术。利用该方法,实现了整联蛋白与配体相互作用的动态分析,并从动力学与热力学视角考察了变构调节效应与机制的深入解析。此外,还开展了受体蛋白识别作用调控与蛋白激活成簇等过程的动态分析。这一方法的开发和应用研究,为受体蛋白与配体动态互作与调控机制的深入研究提供了新的分析工具。

项目成果

期刊论文数量(7)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Probing Dynamic Features of Phagosome Maturation in Macrophage using Au@MnOx@SiO2 Nanoparticles as pH-Sensitive Plasmonic Nanoprobes
使用 Au@MnOx@SiO2 纳米粒子作为 pH 敏感等离子体纳米探针探测巨噬细胞中吞噬体成熟的动态特征
  • DOI:
    10.1002/asia.202100031
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    Chemistry – An Asian Journal
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Jinhui shang;Qian Yang;Wenjun Fan;Yancao Chen;Decui Tang;Haowei Guo;Bin Xiong;Shuangyan Huang;Xiao-Bing Zhang
  • 通讯作者:
    Xiao-Bing Zhang
Single-Particle Mobility Analysis Enables Ratiometric Detection of Cancer Markers under Darkfield Tracking Microscopy
单粒子迁移率分析能够在暗场跟踪显微镜下按比例检测癌症标记物
  • DOI:
    10.1021/acs.analchem.9b05512
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    Analytical Chemistry
  • 影响因子:
    7.4
  • 作者:
    Chen Yancao;Tian Yueyue;Yang Qian;Shang Jinhui;Tang Decui;Xiong Bin;Zhang Xiao-Bing
  • 通讯作者:
    Zhang Xiao-Bing
Plasmonic Imaging of Dynamic Interactions between Membrane Receptor Clusters beyond the Diffraction Limit in Live Cells
活细胞中超出衍射极限的膜受体簇之间动态相互作用的等离子体成像
  • DOI:
    10.1021/acs.analchem.1c03843
  • 发表时间:
    2021-12-14
  • 期刊:
    ANALYTICAL CHEMISTRY
  • 影响因子:
    7.4
  • 作者:
    Yang,Qian;Shang,Jinhui;Zhang,Xiaobing
  • 通讯作者:
    Zhang,Xiaobing
A surface-engineered NIR light-responsive actuator for controllable modulation of collective cell migration
表面工程近红外光响应致动器,用于可控调节集体细胞迁移
  • DOI:
    10.1039/c9tb01038f
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    Journal of Materials Chemistry B
  • 影响因子:
    7
  • 作者:
    Liu Jiayu;Shang Jinhui;Chen Yancao;Tian Yueyue;Yang Qian;Chen Mei;Xiong Bin;Zhang Xiao Bing
  • 通讯作者:
    Zhang Xiao Bing
Peroxidase-like Au@Pt nanozyme as an integrated nanosensor for Ag+ detection by LSPR spectroscopy
类过氧化物酶 Au@Pt 纳米酶作为集成纳米传感器,用于通过 LSPR 光谱检测 Ag
  • DOI:
    10.1016/j.talanta.2020.121627
  • 发表时间:
    2021-01-01
  • 期刊:
    TALANTA
  • 影响因子:
    6.1
  • 作者:
    Tian, Yueyue;Chen, Yancao;Zhang, Xiao-Bing
  • 通讯作者:
    Zhang, Xiao-Bing

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  • 通讯作者:
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  • 作者:
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
    熊斌

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熊斌的其他基金

机器学习辅助单颗粒成像用于病毒S蛋白与宿主细胞特异性作用的定量分析
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相似国自然基金

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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