通过温度调控解析黄素氧化还原蛋白体系非平衡态电子转移机理

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    21903052
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    24.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    B0306.光化学与光谱学
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2019
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2020-01-01 至2022-12-31

项目摘要

Understanding the mechanism of biological photo-induced electron transfer is key to realizing the transformation from solar energy to chemical energy. In some proteins, photo-induced electron transfer is coupled with dielectric relaxation of the solvent molecules in the reaction site and such dynamical effects have been described by Sumi-Marcus two-dimensional model. Recent years have observed that the short-range electron transfer occurs in the ultrafast time region (<1ps) in flavodoxin with oxidized flavin, which corresponds to the frozen region in the Sumi-Marcus two-dimensional model. With the approach of temperature modulation, we propose to combine molecular biology and ultrafast spectroscopy to elucidate the mechanism of ultrafast electron transfer in the frozen region. Experimental results from different species will be compared and interpreted according to the X-ray crystal structures. This proposal is aimed to understand how protein machines effectively utilize solar energy from the molecular level and to shed light on designing more advanced artificial systems in the future.
理解生物体系光致电子转移机理对于人们将光能有效转化为化学能有重要意义。在蛋白质中,光致电子转移反应与反应位点溶剂分子涨落弛豫可能会产生一定的耦合,这种动力学效应一般用Sumi-Marcus二维理论模型进行描述。近年来在氧化态的黄素氧化还原蛋白中发现超快时间尺度(<1ps)的电子转移反应,此时体系对应着Sumi-Marcus二维理论模型中的冷冻区,但实验得到的反应物衰减动力学与现有的Sumi-Marcus二维理论模型存在矛盾的地方。我们计划使用温度调控的手段,结合分子生物学和超快光谱学技术,解析黄素氧化还原蛋白体系冷冻区超快时间尺度的电子转移反应机理。本项目的开展致力于从分子层面上理解蛋白机器如何有效利用光能,对于未来设计合成更高效的人工体系具有启发意义。

结项摘要

蛋白质内的光致电子转移与溶液相的电子转移有所不同,由于蛋白框架的限制,使得电子的给体和受体之间的距离可以限制在10埃以内,因此电子转移的速率也随距离的减少而加快,进入皮秒甚至是百飞秒的范畴之内。此时所表现的非平衡态电子转移过程已经不能用经典的Marcus理论进行描述,也是本项目聚焦研究的科学问题。通过三年的研究,我们在两个重要体系中有所进展。第一个体系为黄素氧化还原蛋白(flavodoxin),我们使用超快光谱成功测量得到在该体系中的电荷分离过程为100-200飞秒,而电荷复合过程为1-2皮秒。有趣的是,由于电荷分离和复合过程比振动弛豫时间(3-6皮秒)要快,所以该体系可以清晰地观察到振动弛豫的过程,体现了蛋白超快非平衡态电子转移和一般溶液态电子转移的差异。第二个体系为蓝光受体BLUF域,通过将电子给体Tyr设计突变成Trp,我们成功地将该体系的电子转移过程和质子转移过程进行了解耦合。我们使用超快光谱成功测量得到该体系的电荷分离过程为2.2皮秒,而电荷复合过程为48皮秒。更重要的是,我们的工作揭示了该体系内存在着双向的质子摇摆现象,并测得正向和反向质子转移的速率分别为51和52皮秒。通过本项目,课题组还进行了温度调控装置的开发,后续可以用于其它蛋白体系中超快电子转移过程和电子耦合质子转移过程的温控研究。

项目成果

期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Direct Observation of Ultrafast Proton Rocking in the BLUF Domain
直接观察 BLUF 域中的超快质子摇摆
  • DOI:
    10.1002/anie.202114423
  • 发表时间:
    2022-01-20
  • 期刊:
    ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION
  • 影响因子:
    16.6
  • 作者:
    Kang, Xiu-Wen;Chen, Zijing;Zhong, Dongping
  • 通讯作者:
    Zhong, Dongping
The nature of proton-coupled electron transfer in a blue light using flavin domain.
使用黄素域在蓝光下质子耦合电子转移的性质
  • DOI:
    10.1073/pnas.2203996119
  • 发表时间:
    2022-06-28
  • 期刊:
    Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
  • 影响因子:
    11.1
  • 作者:
  • 通讯作者:
Ultrafast nonequilibrium dynamics of short-range protein electron transfer in flavodoxin
黄素氧还蛋白短程蛋白质电子转移的超快非平衡动力学
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    Phys. Chem. Chem. Phys.
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Jie Yang;Yifei Zhang;Ting-Fang He;Yangyi Lu;Lijuan Wang;Bei Ding;Dongping Zhong
  • 通讯作者:
    Dongping Zhong

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其他文献

基于Q学习和规划的传感器节点任务调度算法
  • DOI:
    10.16451/j.cnki.issn1003-6059.201611008
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    模式识别与人工智能
  • 影响因子:
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  • 作者:
    魏振春;徐祥伟;冯琳;丁蓓
  • 通讯作者:
    丁蓓
依据CT总碘摄取量预测胃癌新辅助化疗的反应
  • DOI:
    10.16139/j.1007-9610.2019.01.008
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    外科理论与实践
  • 影响因子:
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  • 作者:
    张阳;张欢;丁蓓;袁菲;马乾辰;王柏松;严福华;杜联军
  • 通讯作者:
    杜联军
基于遗传算法的最小成本配送策略研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    合肥工业大学学报(自然科学版)
  • 影响因子:
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  • 作者:
    丁蓓;魏振春;孙仁浩
  • 通讯作者:
    孙仁浩

其他文献

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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