重要森林植物冷杉属的系统发育和生物地理研究——兼论中国冷杉的分类、分布与亲缘关系

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31570545
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    64.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1608.森林信息学与森林经理学
  • 结题年份:
    2019
  • 批准年份:
    2015
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2016-01-01 至2019-12-31

项目摘要

Abies is disjunctly distributed in temperate North Hemisphere with its diversification center in China. Species often form pure forest or mixed with Picea in high mountains in SW China along the east border of Qinghai-Xizang Plateau. Fir species are ecologically and economically important plants and are dominant in Taiga and mountain conifer forests which maintain water and soil, protect the ecological environment and conserve the biodiversity. The infrageneric classification and phylogeny of Abies have not been completely resolved because the complicated morphological variations and insufficient samples and molecular markers in phylogenetic analyses. Our previous research identified several major clades, generally corresponding to the recognized taxonomic sections based on morphological characters and distribution, however, the relationships of the basal clades and monophyly of some closely related groups remain largely unresolved. We will sequence the chloroplast genome, develop suitable mitochondria and single-copy or low-copy nuclear markers and apply morphological statistics, molecular systematics and biogeographical analyses with the aims to: (1) resolve the basal phylogenetic relationship and propose a complete new classification system based on phylogeny and morphology; (2) validate the hybridization hypothesis on the origin of sect. Balsamea; (3) make comprehensive species delimitation of the Himalayan species and revise the taxonomy of Chinese species; (4) explore the origin and spatio-temporal evolution of the genus Abies, and the correlation with geologic history and climatic change. This work will benefit the sustainable utilization of the nature resources of Chinese Abies and its conservation.
冷杉属植物是北温带重要的森林树种,中国为其多样性中心。在青藏高原东部的高海拔地区形成大面积的纯林直达林线,或与云杉伴生形成的暗针叶林约占全国林分蓄积量的四分之一,是极重要的水土涵养林和经济林,有着不可替代的生态屏障作用。该属植物形态变异复杂,受取样和分子标记的限制,其基部的分支和近缘组之间缺少分辨、属下分类系统和中国物种的分类一直存在争议。本立项拟在前期工作的基础上,利用叶绿体全基因组序列,线粒体和单(低)拷贝核基因的DNA标记,应用形态学、分子系统学和生物地理学的分析方法,解决该属基部的系统发育关系,并修订属下分类系统;揭示section Balsamea的杂交起源;在对喜马拉雅地区疑难类群进行物种划分的基础上,澄清中国冷杉属植物的分类、分布和亲缘关系;综合分析多学科证据,阐明冷杉属的起源、时空演化及与地质历史和气候变化的关系。本研究将为保护和利用我国冷杉森林植物资源提供理论基础。

结项摘要

冷杉属植物是北温带重要的森林树种,中国为其多样性中心。在青藏高原东部的高海拔地区形成大面积的纯林直达林线,或与云杉伴生形成的暗针叶林约占全国林分蓄积量的四分之一,是极重要的水土涵养林和经济林,有着不可替代的生态屏障作用。该属植物形态变异复杂,受取样和分子标记的限制,其基部的分支和近缘组之间缺少分辨、属下分类系统和中国物种的分类一直存在争议。本项目利用叶绿体全基因组序列,线粒体和单(低)拷贝核基因的DNA标记,应用形态学、分子系统学和生物地理学的分析方法,解决该属基部的系统发育关系,并修订属下分类系统;在对喜马拉雅地区疑难类群进行物种划分的基础上,澄清中国冷杉属植物的分类、分布和亲缘关系;综合分析多学科证据,阐明冷杉属的起源、时空演化及与地质历史和气候变化的关系。我们的研究结果提供了冷杉属可靠的系统框架,并对冷杉属的属下分类进行了修订,分成七个组;并通过形态和分子证据证明了冷杉属为北美西部起源;以亚洲分布的冷杉为研究对象验证了“海拔迁移”学说,并对喜马拉雅地区分布的两个冷杉复合体的开展了物种划分研究,提出了新的分类观点。本项目的实施增进了我们对北半球重要森林植物类群的起源和多样化机制的理解,冷杉属多样性中心虽然在东亚,但是却起源于北美。“海拔迁移”学说的验证为我国冷杉属珍稀濒危物种的迁地保护提供了理论基础。

项目成果

期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
New infrageneric classification of Abies in light of molecular phylogeny and high diversity in western North America
根据北美西部的分子系统发育和高度多样性对冷杉进行新的属下分类
  • DOI:
    10.1111/jse.12458
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    Journal of Systematics and Evolution
  • 影响因子:
    3.7
  • 作者:
    Qiao-Ping Xiang;Ran Wei;Yan-Mei Zhu;AJ Harris;Xian-Chun Zhang
  • 通讯作者:
    Xian-Chun Zhang
Species delimitation and phylogeography of Abies delavayi
德拉瓦伊冷杉的物种界定和系统发育地理学
  • DOI:
    10.1111/jse.12500
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    Journal of Systematics
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Yi-Zhen Shao;Yun Chen;Xian‐Chun Zhang;Qiao-Ping Xiang
  • 通讯作者:
    Qiao-Ping Xiang
The complete chloroplast genome of the Abies yuanbaoshanensis, an endangered Pinaceae species in Southern China
华南濒危松科物种元宝山冷杉叶绿体全基因组
  • DOI:
    10.1080/23802359.2019.1674210
  • 发表时间:
    2019-10-07
  • 期刊:
    Mitochondrial DNA Part B
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Yang J;Ding T;Jiang RH;Wang YR;Qiao-Ping X
  • 通讯作者:
    Qiao-Ping X

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Elevation Shift in Abies Mill. (Pinaceae) of Subtropical and Temperate China and Vietnam—Corroborative Evidence from Cytoplasmic DNA and Ecological Niche Modeling
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    2017
  • 期刊:
    Frontiers In Plant Science
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
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  • 通讯作者:
    Loc Ke Phan
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  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
    向巧萍
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    2017
  • 期刊:
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  • 影响因子:
    3.3
  • 作者:
    卫然;严岳鸿;AJ Harris;Jong-Soo Kang;沈慧;向巧萍;张宪春
  • 通讯作者:
    张宪春

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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