Trbp的互作因子Prmt5对心肌中快慢肌纤维基因表达的调控效应和作用机制

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31771371
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    60.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0602.基因表达及非编码序列调控
  • 结题年份:
    2021
  • 批准年份:
    2017
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2018-01-01 至2021-12-31

项目摘要

As the engine underneath the hood of the circulatory system, the primary function of heart is “contraction”. However, our understanding on the regulatory mechanisms underlying cardiac contraction is still very limited. Our previous studies have demonstrated that the Trans-activation response (TAR) RNA-binding protein, Trbp, plays a key role(s) in regulating cardiac contraction, by promoting miR-208a biogenesis and modulating the expression of downstream fast-/slow- twitch myofiber protein-coding genes in cardiomyocytes. In our further investigation, we found that protein Arg methyl-transferase Prmt5 can interact with Trbp, and enhance the expression of its downstream miRNAs. Thus, as a binding partner of Trbp, Prmt5 may participate in regulating the expression of fast-/slow- twitch myofiber genes in cardiomyocytes, and modulating the performance of cardiac muscle. In the proposed study, we will further characterize the interaction between Prmt5 and Trbp, and study the functional consequence(s) and the molecular mechanism(s) in the heart, using genetic, biochemistry, molecular biology and -omics approaches. After completion of the study, we expect to uncover novel regulatory mechanisms underlying cardiac development and function, and contribute to deciphering the genetic networks governing cardiac contraction. Our study could also enable the discovery of new therapeutic targets and lead to new approaches to treatment of cardiac contraction disorders.
作为循环系统中的动力来源,心脏的主要功能便是舒缩。然而, 目前我们对调控心肌舒缩功能的生物学机制的了解依然非常有限。我们在前期工作中发现,转录激活反应RNA结合蛋白Trbp,通过促进下游miR-208a的生成并影响心肌中快慢肌纤维伸缩蛋白编码基因的表达,在心肌舒缩功能的调控过程中扮演了关键的角色。我们在进一步的研究中发现,蛋白精氨酸甲基转移酶Prmt5能够与Trbp相互作用,并可以促进Trbp下游miRNA的表达。因此,作为Trbp的互作蛋白,Prmt5可能也参与调控快慢肌基因表达并影响心脏功能。本课题拟通过遗传学手段, 利用生物化学、分子生物学及组学等工具,来探索Trbp与Prmt5的相互作用的在心肌组织中的功能效应以及分子机制。以期能揭示调控心肌发育及功能的新的分子机制,为重建和解析影响心肌舒缩功能的遗传网络,发现心肌舒缩功能障碍的致病因子,以及寻找心肌疾病的治疗策略提供线索。

结项摘要

PRMT5是真核细胞中主要的II型精氨酸甲基转移酶。PRMT5甲基化组蛋白和非组蛋白精氨酸对多种生物学过程的进行以及遗传物质的正常表达起着重要的调节作用。PRMT5在心肌病理过程中的效应和机制依然很不清楚,可能涉及到其不同的功能和参与的不同的信号通路。 在本项目执行过程中,我们发现PRMT5的功能可能不依赖于TRBP。利用分子生物学和生物化学的手段,我们通过鉴定和研究PRMT5的调控因子和互作蛋白,来重建PRMT5的分子网络。在邻近标记质谱蛋白组学实验中,我们找到了一系列新的PRMT5的互作蛋白。这其中包括了YTHDF2,IGF2BP1等可以识别信使RNA m6A修饰重要的“reader”蛋白。我们不仅确认了PRMT5与YTHDF2的互作,还明确了二者之间的调控关系。PRMT5可以在翻译后水平上帮助维持YTHDF2蛋白的稳定性,并且可以抑制YTHDF2下游的靶标WEE1。WEE1是CDK的抑制剂,是调节细胞增殖和生长的关键因子。我们还发现PRMT5与CCT2存在互作,并可能参与调控蛋白质的折叠。另外,结合生物信息学预测与实验验证,我们还鉴定了PRMT5上游的3个miRNA。这三个miRNA跟PRMT5在疾病样本的中表达水平呈现显著负相关。综上,我们发现了几个新的调控轴: miR-654/PRMT5, miR-627/PRMT5, miR-1306/PRMT5以及PRMT5-YTHDF2-WEE1。这些信息将为重建PRMT5的分子网络提供重要线索。

项目成果

期刊论文数量(5)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
LRTM1 promotes the differentiation of myoblast cells by negatively regulating the FGFR1 signaling pathway
LRTM1通过负向调节FGFR1信号通路促进成肌细胞分化
  • DOI:
    10.1016/j.yexcr.2020.112237
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    Experimental Cell Research
  • 影响因子:
    3.7
  • 作者:
    Hao-Ke Li;Yong Zhou;Jian Ding;Lei Xiong;Ying-Xu Shi;Yan-Ji He;Dan Yang;Zhong-Liang Deng;Mao Nie;Yan-Fei Gao
  • 通讯作者:
    Yan-Fei Gao
miRNA-208a in cardiac hypertrophy and remodeling
miRNA-208a 在心脏肥大和重构中的作用
  • DOI:
    10.3389/fcvm.2021.773314
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    Frontiers in Cardiovascular Medicine
  • 影响因子:
    3.6
  • 作者:
    Xing-huai Huang;Jia-Lu Li;Xin-Yue Li;Shu-Xia Wang;Zhi-Han Jiao;Si-Qi Li;Jun Liu;Jian Ding
  • 通讯作者:
    Jian Ding
Mitochondria regulate cardiac contraction through ATP-dependent and independent mechanisms
线粒体通过 ATP 依赖性和独立机制调节心脏收缩
  • DOI:
    doi:10.1080/10715762.2018.1453137
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    Free Radical Research
  • 影响因子:
    3.3
  • 作者:
    Kexin Wang;Yang Xu;Qiong Sun;Jiangang Long;Jiankang Liu;Jian Ding
  • 通讯作者:
    Jian Ding
Roles and clinical applications of exosomes in cardiovascular disease
外泌体在心血管疾病中的作用及临床应用
  • DOI:
    10.1155/2020/5424281
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    BioMed Research International
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Dong Guo;Yuerong Xu;Jian Ding;Jiaying Dong;Ning Jia;Yan Li;Mingming Zhang
  • 通讯作者:
    Mingming Zhang
Causal Associations Between Blood Lipids and COVID-19 Risk: A Two-Sample Mendelian Randomization Study
血脂与 COVID-19 风险之间的因果关系:双样本孟德尔随机研究
  • DOI:
    10.1161/atvbaha.121.316324
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    ARTERIOSCLEROSIS THROMBOSIS AND VASCULAR BIOLOGY
  • 影响因子:
    8.7
  • 作者:
    Zhang Kun;Dong Shan-Shan;Guo Yan;Tang Shi-Hao;Wu Hao;Yao Shi;Wang Peng-Fe;Xue Han-Zhong;Huang Wei;Ding Jian;Yang Tie-Lin
  • 通讯作者:
    Yang Tie-Lin

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其他文献

基于面板声功率贡献量分析的齿轮箱噪声控制方法研究
  • DOI:
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  • 发表时间:
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    --
  • 作者:
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  • 通讯作者:
    郭骋
高效液相色谱-串联质谱法同时测定沙棘中的11种黄酮类物质
  • DOI:
    10.13526/j.issn.1006-6144.2019.03.009
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    分析科学学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    蔡爽;阮成江;杜维;丁健;韩平;王海明
  • 通讯作者:
    王海明
典型工业发酵过程环境变化下的细胞自适应行为与系统优化
  • DOI:
    10.13345/j.cjb.190207
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    生物工程学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    丁健;罗洪镇;史仲平
  • 通讯作者:
    史仲平
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  • DOI:
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  • 发表时间:
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  • 作者:
    李宏坤;郭骋;房世利;丁健
  • 通讯作者:
    丁健
风化基座的双层夷平结构及其意义——以粤北坪石盆地第6级河流阶地为例
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    山地学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    丁健;佘建伟;刘昆;焦树林;高全洲;王振刚
  • 通讯作者:
    王振刚

其他文献

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丁健的其他基金

PET117蛋白与细胞核-线粒体基因表达协调
  • 批准号:
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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