青藏高原史前人类定居与迁徙模式的遗传学研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31371269
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    80.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0605.遗传与进化
  • 结题年份:
    2017
  • 批准年份:
    2013
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2014-01-01 至2017-12-31

项目摘要

Tibetan Plateau represents one of the most extremes of human settlement environment due to its high-altitude hypoxic stress. Currently there are nearly 5 million indigenous Tibetans residing on the Plateau, however, the chronological profiles such as when modern humans first permanently settled on the Tibetan Plateau and the subsequent episodes of human migrations and their demographic history, as well as the modes of diffusion of Neolithic agriculture into the Plateau remain unknown. Recently, we conducted a large scale phylogeographic analysis for 6,109 Tibetan samples from 40 geographic populations in the southern part of the Qinghai-Tibetan Plateau (QTP) using Y-chromosome and mitochondrial (mtDNA) genome markers, and this is a continuity of this project aiming to further recruit another 27 Tibetan populations from the northern QTP (i.e., Qinghai Province), and peripheral QTP areas. By systematically analyzing the phylogeographic patterns of Y-chromosomal and mtDNA haplogroups on the entire region of the QTP, we intend to identify Tibetan-specific ancient Y-chromosomal and mtDNA haplogroups, and reconstruct demographic history of modern human populations through time during the past 40,000 years ago. The objectives of this project are to tackle the following key scientific questions from genetic perspectives such as when the ancestors of modern Tibetans first permanently settled on the QTP and the pattern of human migrations and their demographic dynamics through time, as well as how the Neolithic agriculture diffused into the QTP and their impact on genetic diversity of modern Tibetan populations. The findings will be informative and have important scientific values in studies on archaeology, anthropology, origins of agriculture and pastoralism as well as mechanism of genetic adaptation to high-altitude hypoxia on the QTP.
青藏高原是人类居住的最极端环境之一,目前居住有近500万藏族居民。然而,现代人类是何时开始在青藏高原永久定居,以及随后的人群迁徙过程等史前历史还不清楚。本项目拟在我们最近对覆盖整个青藏高原南部区域(西藏全区)的40个藏族人群(n=6,109)的Y-染色体和mtDNA谱系地理学分析基础上,补充青藏高原北部区域(青海)及高原周边藏族聚居区的27个藏族人群。然后通过系统分析整个青藏高原藏族人群的Y-染色体和mtDNA单倍型类群的谱系地理学格局以及青藏高原近4万年以来的人群动态变化历史,旨在从遗传学角度回答"(1)现代人类是何时开始向青藏高原迁徙并实现永久定居的?(2)现代人类在青藏高原的迁徙历史和群体动态变化过程?(3)新石器农业在青藏高原的扩张模式及其对现代藏族人群遗传多样性格局形成的影响"等关键科学问题。研究结果对青藏高原的考古学、人类学和农牧业起源及高原适应机制等研究具有重要的科学价值。

结项摘要

本项目的研究目标是拟在前期对覆盖整个青藏高原南部区域(西藏全区)的40个藏族人群(n=6,109)的Y-染色体和mtDNA谱系地理学分析基础上,补充青藏高原北部区域(青海)及高原周边藏族聚居区的27个藏族人群。然后通过系统分析整个青藏高原藏族人群的Y-染色体和mtDNA单倍型类群的谱系地理学格局以及青藏高原近4万年以来的人群动态变化历史,最终的研究目标是从遗传学角度回答“现代人类是何时开始永久定居青藏高原及其随后的人群迁徙过程和群体动态变化历史以及新石器农业在青藏高原的扩张模式及其对现代藏族人群遗传多样性格局形成的遗传贡献”等关键科学问题,为青藏高原的考古学、人类学和农牧业起源以及高原低氧适应的分子机制等研究提供遗传学的证据。本项目按计划完成全部的研究任务,达到预期目标。补充采集了38个地理群体的7550人的血液DNA样本,包括覆盖整个青藏高原北部(青海全省)及其周边地区(四川省甘孜藏族自治州、阿坝藏族自治州)的29个藏族地理群体的6782人以及其它常居青海省的汉族、回族、蒙古族等9个地理群体的768人。建立了利用PCR扩增产物的二代测序技术获得mtDNA全长序列的技术平台,并完成对覆盖整个青藏高原地区20个代表性地理人群的1900人的mtDNA的全基因组序列数据,正在进行mtDNA序列的拼接与遗传学分析,研究结果预期在2018年内发表。另外,在“东亚人群史前定居与迁徙历史”、“东亚人群对环境因素适应性进化的分子机制”等研究中取得了一批原创性成果。发表研究论文7篇,在生命百科全书发表特邀综述文章1篇。培养博士研究生4人,承办地区学术会议1次,6人次参加国际学术会议。获西藏自治区科技奖二等奖1项(第五完成人)。

项目成果

期刊论文数量(8)
专著数量(0)
科研奖励数量(1)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Down-Regulation of EPAS1 Transcription and Genetic Adaptation of Tibetans to High-Altitude Hypoxia
EPAS1转录下调与藏族高原缺氧的遗传适应
  • DOI:
    10.1093/molbev/msw280
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    Molecular Biology and Evolution
  • 影响因子:
    10.7
  • 作者:
    Peng Yi;Cui Chaoying;He Yaoxi;Ouzhuluobu;Zhang Hui;Yang Deying;Zhang Qu;Bianbazhuoma;Yang Lixin;He Yibo;Xiang Kun;Zhang Xiaoming;Bh;ari Sushil;Shi Peng;Yangla;Dejiquzong;Baimakangzhuo;Duojizhuoma;Pan Yongyue;Cirenyangji;Baimayangji;Gonggalanzi;Bai Caiju
  • 通讯作者:
    Bai Caiju
Y-chromosome diversity suggests southern origin and Paleolithic backwave migration of Austro-Asiatic speakers from eastern Asia to the Indian subcontinent
Y染色体多样性表明南亚语系人从东亚到印度次大陆的南方起源和旧石器时代后波迁移
  • DOI:
    10.1371/journal.ppat.1004061
  • 发表时间:
    2014-04
  • 期刊:
    Scientific Reports
  • 影响因子:
    4.6
  • 作者:
    Hall BS;Hill K;McKenna M;Ogbechi J;High S;Willis AE;Simmonds RE
  • 通讯作者:
    Simmonds RE
Prehistoric Colonization and Demographic History of Modern Humans on the Tibetan Plateau
青藏高原的史前殖民和现代人类的人口史
  • DOI:
    10.1002/9780470015902.a0025527
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    The Encyclopedia of Life Sciences (eLS), John Wiley & Sons, Ltd: Chichester.
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Qi Xuebin;Cui Chaoying;Ouzhuluobu;Wu Tianyi;Su Bing
  • 通讯作者:
    Su Bing
An Updated Phylogeny of the Human Y-Chromosome Lineage O2a-M95 with Novel SNPs
具有新 SNP 的人类 Y 染色体谱系 O2a-M95 的更新系统发育
  • DOI:
    10.1371/journal.pone.0101020
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    Plos One
  • 影响因子:
    3.7
  • 作者:
    Zhang Xiaoming;Kampuansai Jatupol;Qi Xuebin;Yan Shi;Yang Zhaohui;Serey Bun;Sovannary Tuot;Bunnath Long;Aun Hong Seang;Samnom Ham;Kutanan Wibhu;Luo Xin;Liao Shiyu;Kangwanpong Daoroong;Jin Li;Shi Hong;Su Bing
  • 通讯作者:
    Su Bing
A Genetic Mechanism for Convergent Skin Lightening during Recent Human Evolution
近代人类进化过程中趋同皮肤美白的遗传机制
  • DOI:
    10.1093/molbev/msw003
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    Molecular Biology and Evolution
  • 影响因子:
    10.7
  • 作者:
    Yang Zhaohui;Zhong Hua;Chen Jing;Zhang Xiaoming;Zhang Hui;Luo Xin;Xu Shuhua;Chen Hua;Lu Dongsheng;Han Yinglun;Li Jinkun;Fu Lijie;Qi Xuebin;Peng Yi;Xiang Kun;Lin Qiang;Guo Yan;Li Ming;Cao Xiangyu;Zhang Yanfeng;Liao Shiyu;Peng Yingmei;Zhang Lin;Guo Xiaosen
  • 通讯作者:
    Guo Xiaosen

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi || "--"}}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year || "--" }}
  • 期刊:
    {{ item.journal_name }}
  • 影响因子:
    {{ item.factor || "--"}}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

其他文献

其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi || "--" }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year || "--"}}
  • 期刊:
    {{ item.journal_name }}
  • 影响因子:
    {{ item.factor || "--" }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}
empty
内容获取失败,请点击重试
重试联系客服
title开始分析
查看分析示例
此项目为已结题,我已根据课题信息分析并撰写以下内容,帮您拓宽课题思路:

AI项目思路

AI技术路线图

祁学斌的其他基金

高原低氧环境下影响藏族人群遗传适合度的关键生理因素及其调控机制的多组学解析
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2020
  • 资助金额:
    60 万元
  • 项目类别:
    面上项目
解析藏族人群高原肺动脉高压的调控机制及其对高原低氧环境适应的遗传效应
  • 批准号:
    31671329
  • 批准年份:
    2016
  • 资助金额:
    25.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目
家养牦牛的起源、驯化与群体扩散的遗传学研究
  • 批准号:
    30870295
  • 批准年份:
    2008
  • 资助金额:
    33.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目
中国人群中乳糖酶基因的变异及其分子进化机制
  • 批准号:
    30771181
  • 批准年份:
    2007
  • 资助金额:
    8.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目

相似国自然基金

{{ item.name }}
  • 批准号:
    {{ item.ratify_no }}
  • 批准年份:
    {{ item.approval_year }}
  • 资助金额:
    {{ item.support_num }}
  • 项目类别:
    {{ item.project_type }}

相似海外基金

{{ item.name }}
{{ item.translate_name }}
  • 批准号:
    {{ item.ratify_no }}
  • 财政年份:
    {{ item.approval_year }}
  • 资助金额:
    {{ item.support_num }}
  • 项目类别:
    {{ item.project_type }}
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了

AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
关闭
close
客服二维码