HDAC8基因新突变的功能及其对Cornelia de Lange综合征患者骨形成的影响及其机制研究

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基本信息

  • 批准号:
    81800780
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    21.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H0712.骨转换、骨代谢异常及钙磷代谢异常
  • 结题年份:
    2021
  • 批准年份:
    2018
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2019-01-01 至2021-12-31

项目摘要

The HDAC8 gene mutations have been reported to be associated with the occurrence of Cornelia de Lange syndrome (CdLS), but the molecular mechanism has not been elucidated. We recently adopted whole-exome sequencing and Sanger sequencing technologies to analyze genetic mutations in two CdLS patients from different families, and found that the two patients carried an unreported missense mutation (c.806T>G, p.I269R and c.113G>A, p.A38V) of HDAC8 gene, respectively. The prediction results based on bioinformatics software indicated that the two genetic mutations had pathogenicity. The result of functional study of HDAC8 c.806T>G mutation showed that the genetic mutation significantly reduced the enzymatic activity of HDAC8 protein. The project will continue to study the function of the other new mutation, and construct an induced pluripotent stem cell (iPSC) model of CdLS to explore the effect and influence mechanism of the genetic mutations on bone formation. The study will not only provide strong evidence for genetic diagnosis of the present patients, but also be helpful to elucidate the pathogenesis of CdLS, which provides a theoretical basis for the future treatment.
已有研究表明HDAC8基因突变与Cornelia de Lange综合征(CdLS)的发病有关,但其分子机制尚不清楚。课题组先前采用全外显子组测序和Sanger测序技术对两例来源于不同家系的CdLS患者进行基因检测,发现患者HDAC8基因分别存在一个未被报道的错义突变c.806T>G(p.I269R)和c.113G>A(p.A38V),生物信息学软件预测结果提示其具有致病性。针对HDAC8基因c.806T>G(p.I269R)突变的功能研究结果表明该突变能够显著降低HDAC8蛋白的酶活性。本课题将继续研究另一个新突变的功能,同时构建iPSC疾病模型,探索突变对CdLS患者骨形成的影响及其机制,这不仅能为患者的遗传学病因确诊提供有力证据,还有助于阐明CdLS的发病机制,为以后的治疗提供理论基础。

结项摘要

Cornelia de Lange综合征(CdLS)是一组罕见的累及多器官系统的临床及遗传异质性疾病。已有研究表明NIPBL、SMC1A、SMC3、RAD21和HDAC8基因突变与CdLS的发病有关。我们先前采用DNA测序技术对两个身材矮小的CdLS患者进行检测,发现患者HDAC8基因分别存在一个未被报道的错义突变c.806T>G(p.I269R)和c.113C>T(p.A38V),同时多个生物信息学软件预测结果提示其具有致病性。为了证实预测结果,我们进行了重组质粒构建、酶活性测定、CRISPR-Cas9等实验,发现HDAC8基因c.113C>T(p.A38V)突变对HDAC8的酶活性无影响;而c.806T>G(p.I269R)突变能使HDAC8的酶活性下降88.3%。虽然后续研究没有发现c.806T>G(p.I269R)突变能够影响骨的形成,但是我们通过生物信息学方法获得多个与CdLS有关的基因和信号通路。这些结果将有助于阐明CdLS的发病机制,为以后的治疗提供理论基础。此外,我们还发现4个与颅骨锁骨发育不良(CCD)有关的新致病变异以及RUNX2基因Gly223Val突变的功能。这些结果不仅丰富了CCD的致病变异谱,还有助于CCD的诊断和遗传咨询。另外,通过荟萃分析发现HULC基因上的rs7763881遗传多态与肝细胞癌、结直肠癌和食管癌的发病风险有关。这些结果将有助于个体肿瘤易感性的预测。

项目成果

期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
基于生物信息学方法分析Cornelia de Lange综合征中失调的基因
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    科学大众
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    陆迪明;赵奕宁;李溱;何咏菁;高学仁
  • 通讯作者:
    高学仁
Association between HULC rs7763881 and cancer risk: an updated Meta-analysis
HULC rs7763881 与癌症风险之间的关联:更新的荟萃分析
  • DOI:
    10.1080/15257770.2021.2008433
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    Nucleosides, nucleotides & nucleic acids
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Xueren Gao;Jiaxin Yang;Dongbo Wang;Qinghang Zeng;Fangting Li;Sasha Zhou;Xue Zhang;Chen Fan;Ziyan Gao;Yining Zhao
  • 通讯作者:
    Yining Zhao
Identification of RUNX2 variants associated with cleidocranial dysplasia
鉴定与锁骨颅骨发育不良相关的 RUNX2 变异
  • DOI:
    10.1186/s41065-019-0107-7
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    Hereditas
  • 影响因子:
    2.7
  • 作者:
    Xueren Gao;Kunxia Li;Yanjie Fan;Yu Sun;Xiaomei Luo;Lili Wang;Huili Liu;Zhuwen Gong;Jianguo Wang;Yu Wang;Xuefan Gu;Yongguo Yu
  • 通讯作者:
    Yongguo Yu

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其他文献

Serum 25-hydroxyvitamin D status in pregnant women with chronic hepatitis B virus infection
慢性乙型肝炎病毒感染孕妇血清25-羟基维生素D状态
  • DOI:
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  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    JOURNAL OF INFECTION IN DEVELOPING COUNTRIES
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    高学仁;王翠敏;王文俊;韩国荣;张建琼
  • 通讯作者:
    张建琼
FEN1-69G>A and 4150G>T polymorphisms and cancer risk in Chinese population
FEN1-69G>A和4150G>T多态性与中国人群癌症风险
  • DOI:
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  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    SCIENTIFIC REPORTS
  • 影响因子:
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  • 作者:
    高学仁;韩国荣
  • 通讯作者:
    韩国荣

其他文献

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
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          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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