中国蘑菇属(Agaricus)真菌系统学研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31470152
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    86.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0101.微生物多样性、分类与系统发育
  • 结题年份:
    2018
  • 批准年份:
    2014
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2015-01-01 至2018-12-31

项目摘要

Be lacking of the new edible mushroom stains, which are with Chinese proprietary intellectual property rights, is becoming a bottleneck in increasing the edible mushroom industrial efficiency and propelling edible mushroom industry sustainable development in China. The genus Agaricus includes many edible species, and which is one of most valuable groups in macrofungi on edible and medical exploitations. Based on Agaricus biodiversity researches mainly from Thailand and Southwestern China since 10 years ago by applicant, this project is proposed and it is going to reconstruct the phylogenetic topology of Agaricus based on multigene sequences using samples not only from China but also Europe, North America and tropical Asia. The research result will clarify the properly taxonomic positions of those 7 new lineages, which were revealed in previous research using ITS sequences, and establish a better taxonomic system within this genus under the well supporting by molecular phylogenetic data. A phylogeographical research will be conducted too using the worldwide sampling in order to better understand the origin, distribution, spreading map of this kind of mushrooms. On the other hand, the overall and reliable phylogenetic tree could reveal the certain species is edible or not in Agaircus, which will provide the useful information on wild Agaricus species utilization; reveal the useful diagnosis characters in morphology and tiny fragments of DNA. Those results along with the collecting of wild living stains of Agaricus would provide a fundamental basis and stores reserve for developing the new edible mushroom stains with Chinese proprietary intellectual property rights.
缺乏自主知识产权的食用菌菌株是提高我国食用菌产业效益、推动行业可持续发展的一个瓶颈。蘑菇属(Agaricus)包含大量可食用种,是最具有食药用开发价值的类群之一。 本研究在申请人近十年来对泰国、我国西南为主的蘑菇属多样性研究基础上,面向全国、涵盖欧美亚洲等区域,首次构建多基因序列为基础的世界性蘑菇属系统发育图谱。该研究结果将澄清单基因系统发育研究所发现的7个属内新支序的分类地位,重建更趋于进化本质的蘑菇属分类体系;对连贯性区域的样本开展系统地理学研究,了解该属起源、分布、传播扩散路径。 全面可靠的蘑菇属系统发育图谱可以指示出各个物种的食用性,为相关食用菌开发指明方向;分析出各个物种的稳定形态学特征和特征DNA小片段,使蘑菇属物种的鉴定简洁准确易操作,利于目标种质资源收集;而结合项目收集到的菌株,最终为开发自主知识产权的食用菌菌株提供理论基础和材料准备。

结项摘要

蘑菇属是世界性分布,并包含大量可食用种类,具有重要的食药用开发价值。在本项目的支持下:1)在全国范围内系统开展大型真菌科考, 在东北、华北、华中、华东、西南地区、华南地区、内蒙古地区、新疆和青藏高原地区共采集大型真菌标本9669份,其中蘑菇属标本近千份;分离蘑菇属野生菌株100余株。2)针对蘑菇属内11个新发现的单系进化支序的分类命名,多系类群恰当分类处理等问题,利用我国及世界范围内代表性物种的多基因序列分析,结合分子钟分析获得的演化时间,创造性以“表型特征+单系认定+演化时间”的指标来命名种上分类单元,并据此重建蘑菇属全球范围内的系统发育图谱和标准化分类体系。在本项目的支持下,澄清了蘑菇属的主要分类问题,重建了蘑菇属6个亚属22个组的标准化分类体系;发表蘑菇属新种新变种93个、新亚属和组6个、新组合4个。由于这些可靠,骨干性的分子数据的积累和公开,极大推动了其它地区如来自泰国、澳大利亚、印度,包括我国的蘑菇属真菌的新种,新资源的发现。3)以蘑菇属Minores组成员为研究材料开展了蘑菇属的生物地理学研究,结果表明蘑菇属为热带起源及从热点亚洲为重要节点的3个演化路径。4)此外以“表型特征+单系认定+演化时间”的研究模式,接合全基因组序列分析还重建了担子菌门骨干类群的系统发育图谱。本项目共发表学术论文35篇,其中SCI论文29篇,较好完成了项目预期的各项内容,推动我国对蘑菇属资源的认识和后续开发。

项目成果

期刊论文数量(33)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(3)
A preliminary DNA barcode selection for the genus Russula (Russulales, Basidiomycota)
红菇属(红菇目,担子菌门)DNA 条形码的初步选择
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    MYCOLOGY
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Guo-Jie Li;Rui-Lin Zhao;Chu-Long Zhang;Fu-cheng Lin
  • 通讯作者:
    Fu-cheng Lin
Fungal diversity notes 253-366: taxonomic and phylogenetic contributions to fungal taxa
真菌多样性注释 253-366:对真菌类群的分类学和系统发育贡献
  • DOI:
    10.1007/s13225-016-0366-9
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    Fungal Diversity
  • 影响因子:
    20.3
  • 作者:
    Li Guo Jie;Hyde Kevin D.;Zhao Rui Lin;Hongsanan Sinang;Abdel-Aziz Faten Awad;Abdel-Wahab Mohamed A.;Alvarado Pablo;Alves-Silva Genivaldo;Ammirati Joseph F.;Ariyawansa Hiran A.;Baghela Abhishek;Bahkali Ali Hassan;Beug Michael;Bhat D. Jayarama;Bojantchev Di
  • 通讯作者:
    Bojantchev Di
The ranking of fungi: a tribute to David L. Hawksworth on his 70th birthday
真菌排名:向 David L. Hawksworth 70 岁生日致敬
  • DOI:
    10.1007/s13225-017-0383-3
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    Fungal Diversity
  • 影响因子:
    20.3
  • 作者:
    Hyde Kevin D.;Xu Jian-Chu;Zhao Rui-Lin;Zhao Rui-Lin;Bahkali Ali H.;Elgorban Abdallah M.;Hyde Kevin D.;Hongsanan Sinang;Samarakoon Milan C.;Pem Dh;evi;Harishch;ra Dulanjalee;Maharachchikumbura Sajeewa S. N.;Al-Sadi Abdullah M.;Luecking Robert;Jeewon Ra
  • 通讯作者:
    Jeewon Ra
Edible species of Agaricus (Agaricaceae) from Xinjiang Province (Western China)
来自新疆省(中国西部)的食用菌(木犀科)
  • DOI:
    10.11646/phytotaxa.202.3.2
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    Phytotaxa
  • 影响因子:
    1.1
  • 作者:
    Wang Zhuo-Ren;Parra Luis A.;Callac Philippe;Zhou Jun-Liang;Fu Wen-Jin;Dui San-Han;Hyde Kevin D.;Zhao Rui-Lin
  • 通讯作者:
    Zhao Rui-Lin
Inter- and intra-specific diversity in Agaricus endoxanthus and allied species reveals a new taxon, A. punjabensis
内黄蘑菇和近缘物种的种间和种内多样性揭示了一个新的分类群:旁遮普蘑菇
  • DOI:
    10.11646/phytotaxa.252.1.1
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    Phytotaxa
  • 影响因子:
    1.1
  • 作者:
    Chen Jie;Parra Luis A.;De Kesel Andre;Khalid Abdul N.;Qasim Tayyaba;Ashraf Aisha;Bahkali Ali H.;Hyde Kevin D.;Zhao Ruilin;Callac Philippe
  • 通讯作者:
    Callac Philippe

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其他文献

昆明美人蕉黑斑病菌——链格孢Alternaria alternata
  • DOI:
    10.1021/acs.biochem.8b00119
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
    菌物学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    傅本重;王政又;伍建榕;赵瑞琳;张俊忠;韩长志
  • 通讯作者:
    韩长志
卵孢侧耳野生菌株人工栽培及营养成分分析
  • DOI:
    10.13346/j.mycosystema.170126
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    菌物学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    王慧君;李国杰;赵瑞琳
  • 通讯作者:
    赵瑞琳
易门野生食用菌资源与农户收入相关性调查
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    中国食用菌
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    徐梦琳;瞿永超;贺茂强;张颖;赵瑞琳
  • 通讯作者:
    赵瑞琳

其他文献

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赵瑞琳的其他基金

双孢蘑菇的起源分化及驯化相关性状的基因组学研究
  • 批准号:
    31961143010
  • 批准年份:
    2019
  • 资助金额:
    60 万元
  • 项目类别:
    面上项目
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  • 批准号:
  • 批准年份:
    2019
  • 资助金额:
    200 万元
  • 项目类别:

相似国自然基金

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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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