TIRR识别53BP1的分子基础及其在DSB损伤修复中的作用机制研究

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基本信息

  • 批准号:
    31871318
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    60.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0602.基因表达及非编码序列调控
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2018
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2019-01-01 至2022-12-31

项目摘要

DSBs(DNA Double Strand Breaks)is the most harmful DNA damage form in eukaryotic cells. Two mechanistically distinct pathways: non-homologous end-joining (NHEJ) and homologous recombination (HR) are involved in DSB repair and genome stability maintenance. 53BP1 plays a central role in orchestrating the choice of DSB repair pathway, which promotes NHEJ-mediated DSB repair. Central to 53BP1 function is its recruitment to damaged chromatin via recognition of di-methylated lysine 20 of histone H4 (H4K20me2) by 53BP1 tandem Tudor domain. TIRR, a novel 53BP1 regulator which directly interacts with 53BP1 Tudor domain and masks the binding of H4K20me2, controls the chromatin accumulation of 53BP1. TIRR interacts with the N-terminal region of 53BP1 and plays an extra role in DSB repair process. We characterized TIRR/53BP1 complex and determined the high-resolution structure of TIRR/53BP1 Tudor complex. Here, adopting a combination of structural, biophysical, biochemical and cellular approaches, we would address the functional roles of TIRR/53BP1 interaction and reveal the mechanism of TIRR/53BP1-mediated DSB repair pathway. The knowledge we gain in this study is critical to understanding the mechanism of TIRR/53BP1-dependent DNA repair and shed a light on the discovery of novel 53BP1 inhibitor with therapeutic potential in cancer treatment.
DNA双链断裂(DNA Double-strand Breaks, DSBs)是细胞中最严重的DNA损伤。真核细胞主要通过非同源末端连接和同源重组两种修复方式修复DSBs损伤确保基因组稳定。DSBs损伤修复通路中的重要调控因子53BP1通过其Tudor结构域识别核小体组蛋白H4K20me2并将53BP1招募到染色质。TIRR是目前发现的唯一的53BP1上游调控因子,TIRR通过结合53BP1Tudor结构域抑制其识别H4K20me2,并通过与53BP1的N端区域作用进一步调控53BP1的功能。我们测定了TIRR/53BP1Tudor复合物的高精度结构,在此基础上将进一步研究TIRR/53BP1 N端区域复合物的结构并通过生化、生物物理、细胞生物学等方法揭示TIRR与53BP1相互作用的分子基础及在DNA损伤修复中的作用机制。本研究对于阐明DSBs损伤修复机制和设计新型肿瘤药物具有重要意义。

结项摘要

细胞对DNA双链断裂(DNA Double-strand Breaks, DSB)修复途径的正确选择是维持基因组稳定的关键,非同源末端连接和同源重组是真核细胞修复DSB的两种主要途径。53BP1和BARD1是DSB损伤修复途径选择的重要调控因子。一方面,53BP1的Tudor结构域识别组蛋白H4第20位赖氨酸甲基化修饰(H4K20me2),而TIRR破坏53BP1和H4K20me2的结合。另一方面,BARD1可以识别S/G2期的非甲基化修饰H4K20(H4K20me0)并破坏53BP1的结合,从而确保细胞通过同源重组方式修复DSB。本项目对TIRR和BARD1调控DSB损伤修复途径的分子机制开展了研究,通过解析TIRR/53BP1复合物的高精度结构,揭示了TIRR调控DSB损伤修复的分子机制。通过阐明BARD1识别H4K20me0以及H2A第15位赖氨酸上的泛素(H2AK15Ub)双标记的结构基础,阐明了BARD1促进同源重组的分子机制。本研究对于阐明DNA损伤修复机制、肿瘤相关突变的致病机理、以及抗肿瘤药物的设计和研发具有重要意义。

项目成果

期刊论文数量(6)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Structural insight into BRCA1-BARD1 complex recruitment to damaged chromatin
BRCA1-BARD1 复合物招募至受损染色质的结构洞察
  • DOI:
    10.2210/pdb7e8i/pdb
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    Molecular Cell
  • 影响因子:
    16
  • 作者:
    Dai Linchang;Dai Yaxin;Han Jinhua;Huang Yan;Wang Longge;Huang Jun;Zhou Zheng
  • 通讯作者:
    Zhou Zheng
Molecular basis for the selective recognition and ubiquitination of centromeric histone H3 by yeast E3 ligase Psh1
酵母E3连接酶Psh1选择性识别和泛素化着丝粒组蛋白H3的分子基础
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    Journal of Genetics and Genomics
  • 影响因子:
    5.9
  • 作者:
    Zhou Ning;Shi Liuxin;Shan Shan;Zhou Zheng
  • 通讯作者:
    Zhou Zheng
Mechanistic and structural insights into histone H2A–H2B chaperone in chromatin regulation
组蛋白 H2A–H2B 伴侣在染色质调控中的机制和结构见解
  • DOI:
    10.1042/bcj20190852
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    Biochemical Journal
  • 影响因子:
    4.1
  • 作者:
    Yan Huang;Yaxin Dai;Zheng Zhou
  • 通讯作者:
    Zheng Zhou
Structural insights into histone chaperone Chz1-mediated H2A.Z recognition and histone replacement
组蛋白伴侣 Chz1 介导的 H2A.Z 识别和组蛋白替代的结构见解
  • DOI:
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  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    PLoS Biology
  • 影响因子:
    9.8
  • 作者:
    Wang Yunyun;Liu Sheng;Sun Lu;Xu Ning;Shan Shan;Wu Fei;Liang Xiaoping;Huang Yingzi;Luk Ed;Wu Carl;Zhou Zheng
  • 通讯作者:
    Zhou Zheng
Role of a DEF/Y motif in histone H2A-H2B recognition and nucleosome editing
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  • DOI:
    10.1073/pnas.1914313117
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
  • 影响因子:
    11.1
  • 作者:
    Huang Yan;Sun Lu;Pierrakeas Leonidas;Dai Linchang;Pan Lu;Luk Ed;Zhou Zheng
  • 通讯作者:
    Zhou Zheng

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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