基于“多维组合衍生化”和“同步选择性提取”的宽覆盖靶向代谢组学LC/MS分析新方法研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81773682
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    60.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H3410.药物分析
  • 结题年份:
    2021
  • 批准年份:
    2017
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2018-01-01 至2021-12-31

项目摘要

A key step in metabolomics is to perform accurate quantification of the metabolomes in comparative samples with high coverage. In order to break through the common technical barriers such as narrow coverage, poor selectivity, low sensitivity and response discrimination etc in mass spectrometry based non-targeted metabolomics,in this project, multi-dimensional derivatization and synchronous selective-extraction were used in combination with LC-MS to develop high coverage targeted metabolomics approach. It involves the optimization of derivatization reagents, preparation of magnetic mesoporous silica gel nanoparticles, tandem derivatization, parallel derivatization and screening of diagnostic ion for endogenous metabolites identification. Consequently, a high coverage and highly sensitive LC/MS method covering 3-5 classes of metabolites, 6-8 metabolic pathways, nearly 500 kinds of non-lipid metabolites would be established and validated integrating absolute and relative quantification. The developed noval LC/MS method would be applied to screen out biomarker for the molecular classification of children bronchiolitis. The predictable success of this research project will rich and perfect the theory and method of metabolomics.
本项目聚焦于代谢组学“数据采集”关键步骤,针对目前基于LC/MS的代谢组学分析方法存在的覆盖窄、选择性差、灵敏度低、响应歧视等瓶颈问题,从“多维”和“同步”两个角度出发,探索发展基于“多维组合衍生化”和“同步选择性提取”的宽覆盖、高灵敏的靶向代谢组学LC/MS新方法和技术体系:包括配对衍生化试剂结构优化、磁性介孔硅胶纳米探针制备、串联衍生化策略、并联衍生化策略、基于同源离子识别和质谱诊断离子的类成分鉴定等。建立整合“已知物质绝对定量”与“未知物质半定量”组合检测的、能覆盖3-5类代谢物、6-8个代谢途径、近500种非脂类代谢物的高灵敏宽覆盖LC/MS定量分析新方法,并实际应用于儿童毛细支气管炎分子分型研究,从代谢调控角度比较不同亚型患儿雾化吸入药物治疗的反应差异性。本课题的开展将推动代谢组分析向“高精准、宽覆盖”方向发展,所建立的技术体系和分析方法将为药物体内效应分子研究提供有力支撑。

结项摘要

本项目聚焦于代谢组学“数据采集”关键步骤,针对目前基于LC/MS的代谢组学分析方法存在的覆盖窄、选择性差、灵敏度低、响应歧视等瓶颈问题,聚焦于“多维”和“同步” 两个角度,探索发展基于“多维组合衍生化”和“同步选择性提取”的宽覆盖、高灵敏的靶向代谢组学LC/MS新方法和技术体系,包括:建立覆盖短、中、长链FFA的高灵敏LC-MS/MS分析方法,弥补了现有方法覆盖范围窄、灵敏度有限、专属性不强等缺陷,为开发宽覆盖目标代谢组学分析方法提供了新思路;提出配对衍生化策略,既能有效避免生物分析中同位素标记内标不易得的难题,又能为每个待测物提供结构类似的一一对应内标,为内源性物质分析方法建立中内标获取提供了新的选择; 以丹磺酰哌嗪为模板化合物,以质谱ESI(+)离子化和反相色谱保留理论为指导,设计并合成了12个新型磺酰哌嗪类质谱探针,比较评价了12个新型磺酰哌嗪类质谱探针的质谱增敏效果,确定并开发出了最优质谱探针SK-10,其增敏效率比Dns-PP最高可提高300倍;首次将“一侧多评”引入代谢组学研究,建立了基于微波辅助化学衍生化的酰基肉碱LC-MS/MS分析方法;设计并优化了两步固相萃取同时制备代谢组和脂质组的样本预处理方法,建立整合“已知物质绝对定量”与“未知物质半定量”组合检测方法,覆盖13类代谢物、8个代谢途径、近500种小分子物质的高灵敏宽覆盖LC/MS定量分析新方法。所建方法实际应用于儿童毛细支气管炎分子分型研究,筛选了潜在生物标志物并建立了疾病亚型的预测模型。本课题的开展推动了代谢组分析向“高精准、宽覆盖 ”方向发展,所建立的技术体系和分析方法可为临床伴随诊断和疾病生物标志物发现提供有力支撑。本项目相关研究目前已发表SCI论文13篇,申请发明专利2项,培养博士研究生2名,硕士研究生5名。

项目成果

期刊论文数量(13)
专著数量(0)
科研奖励数量(1)
会议论文数量(0)
专利数量(2)
Absolute Quantification of Acylcarnitines Using Integrated Tmt-PP Derivatization-Based LC-MS/MS and Quantitative Analysis of Multi-Components by a Single Marker Strategy
使用基于 Tmt-PP 衍生化的集成 LC-MS/MS 对酰基肉碱进行绝对定量,并通过单标记策略对多组分进行定量分析
  • DOI:
    10.1021/acs.analchem.1c02606
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    Analytical Chemistry
  • 影响因子:
    7.4
  • 作者:
    Tang T;Zhang P;Li S;Xu D;Li W;Tian Y;Jiao Y;Zhang Z;Xu F
  • 通讯作者:
    Xu F
Metabolomics-driven identification of adenosine deaminase as therapeutic target in a mouse model of Parkinson's disease
代谢组学驱动的腺苷脱氨酶鉴定作为帕金森病小鼠模型的治疗靶点
  • DOI:
    10.1111/jnc.14774
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    Journal of Neurochemistry
  • 影响因子:
    4.7
  • 作者:
    Huang Wanqiu;Xu Yazhou;Zhang Ytutin;Zhang Pei;Zhang Qiangian;Zhang Zunjian;Xu Fengguo
  • 通讯作者:
    Xu Fengguo
Chemoselective Probes Serving as Promising Derivatization Tools in Targeted Metabolomics Research
化学选择性探针在靶向代谢组学研究中作为有前途的衍生化工具
  • DOI:
    10.1007/s41664-020-00125-0
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    Journal of Analysis and Testing
  • 影响因子:
    4.7
  • 作者:
    Chen Jie;Tian Yuan;Zhang Yu-xin;Xu Feng-guo
  • 通讯作者:
    Xu Feng-guo
Tryptophan Pathway-Targeted Metabolomics Study on the Mechanism and Intervention of Cisplatin-Induced Acute Kidney Injury in Rats
色氨酸通路靶向代谢组学研究顺铂所致大鼠急性肾损伤的机制及干预
  • DOI:
    10.1021/acs.chemrestox.1c00110
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    Chemical Research in Toxicology
  • 影响因子:
    4.1
  • 作者:
    Tan B;Chen J;Qin S;Liao C;Zhang Y;Wang D;Li S;Zhang Z;Zhang P;Xu F
  • 通讯作者:
    Xu F
Subcellular metabolomics: Isolation, measurement, and applications
亚细胞代谢组学:分离、测量和应用
  • DOI:
    10.1016/j.jpba.2021.114557
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    J Pharm Biomed Anal
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Qin S;Zhang Y;Tian Y;Xu F;Zhang P
  • 通讯作者:
    Zhang P

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其他文献

药物代谢组学研究进展
  • DOI:
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  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
    张尊建
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  • DOI:
    --
  • 发表时间:
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  • 期刊:
    药学进展
  • 影响因子:
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  • 作者:
    黄寅;张伟;张尊建;许风国
  • 通讯作者:
    许风国
LC-MS/MS法研究大承气汤与其君药大黄物质基础间的相关性
  • DOI:
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  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    中国药科大学学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    刘颖;田媛;宋瑞;董海娟;张尊建;许风国
  • 通讯作者:
    许风国
代谢组学信息获取与数据预处理瓶颈问题探讨
  • DOI:
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  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    药学进展
  • 影响因子:
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  • 作者:
    黄寅;张伟;张尊建;许风国
  • 通讯作者:
    许风国

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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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