布洛芬降解基因克隆、功能分析及降解机理研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    31070453
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    32.0万
  • 负责人：
    卫亚红
  • 依托单位：
    西北农林科技大学
  • 学科分类：
    C0303.生理生态学
  • 结题年份：
    2013
  • 批准年份：
    2010
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2011-01-01 至2013-12-31

项目摘要

以布洛芬降解菌鞘氨醇单胞菌属（Sphingomonas sp.）菌株Ibu-3和Ibu-4为研究对象，阐明菌株Ibu-3和Ibu-4降解布洛芬的可能机理；筛选福斯质粒文库中阳性亚克隆菌株；确定转座子插入突变体文库中丧失积累褐色邻苯二酚聚合物突变体；构建高效安全的布洛芬降解工程菌株。本项研究不仅可从分子水平阐明布洛芬降解机理，还将为布洛芬降解菌剂研发，城市污水脱布洛芬前期处理以及饮用水源保护区水体中布洛芬去除提供菌种保障。研究成果将有助于挖掘我国宝贵的降解PPCPs新生污染源微生物菌种资源库中布洛芬降解菌株种质资源，丰富我国医药品污染微生物降解关键基因库。

结项摘要

从西安污水处理厂排污口水样以及水底污泥沉积物中筛选得到7株布洛芬降解备选菌株，选择4株细菌为研究对象，以细菌通用引物27F和1492R进行菌落PCR并测序。该4株菌16S rDNA序列获得GenBank登录号（序列号：JX196956、JX196957、JX196958以及JX196959）并且构建了4株菌的系统发育树。分别构建了基于Klebsiella sp. Yangling I2、Pseudomonas sp. Yangling I4、Microbacterium sp. Yangling I10以及Acinetobacter sp. Yangling I14等4株菌的福斯质粒文库，筛选福斯质粒文库中阳性亚克隆菌株以阐明菌株降解布洛芬的可能机理。选用I2（克雷伯氏菌属）、I4（假单胞菌属）和I14（不动杆菌属）为研究对象，开展了其对布洛芬同系物苯甲酸，苯丙酸，对苯二酚，邻苯二酚，间苯二酚，对甲基苯甲酸以及邻甲基苯甲酸等的降解谱研究。开展了该4株布洛芬降解菌株抗菌谱标记，确定了其抗生素致死浓度，同时进行了PCR扩增抗性基因（ARG）以及I类整合子检测。进一步开展了布洛芬高效降解菌重金属抗性研究，确定了供试菌株MTC、测定了重金属胁迫生长曲线。为布洛芬降解菌株的重金属抗性机理研究奠定基础。开展了菌株Klebsiella sp. Yangling I2的全基因组测序，通过RAST系统注释，揭示了该菌株苯系物降解相关基因以及重金属抗性相关基因等基因簇，从分子水平阐明了布洛芬降解和重金属抗性机理。本项研究从分子水平阐明了布洛芬降解机理，为布洛芬降解菌剂研发，城市污水脱布洛芬前期处理以及饮用水源保护区水体中布洛芬去除提供了菌种保障。研究成果有助于挖掘我国宝贵的降解PPCPs新生污染源微生物菌种资源库中布洛芬降解菌株种质资源，丰富了我国医药品污染微生物降解关键基因库。

项目成果

期刊论文数量（1）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
布洛芬微生物降解研究进展
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2011
  • 期刊：
    微生物学报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    卫亚红;刘杰;曲东;Yahong Wei1,Jie Liu1,Dong Qu2 1College of Life Sci
  • 通讯作者：
    Yahong Wei1,Jie Liu1,Dong Qu2 1College of Life Sci

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其他文献

Solirubrobacter taibaiensis sp. nov., isolated from a stem of Phytolacca acinosa Roxb.
太白紫光杆菌
  • DOI：
    10.1007/s10482-014-0194-4
  • 发表时间：
    2014-05
  • 期刊：
    Antonie van Leeuwenhoek International Journal of General and Molecular Microbiology
  • 影响因子：
    2.6
  • 作者：
    张磊;朱玲芳;司美茹;李长富;赵亮;卫亚红;沈锡辉
  • 通讯作者：
    沈锡辉
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Nafulsella 基因组序列草案
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2014
  • 期刊：
    Genome Announcements
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    张磊;司美茹;朱玲芳;李长富;卫亚红;沈锡辉
  • 通讯作者：
    沈锡辉

其他文献

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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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