面向临床决策辅助的电子病历文本结构化方法与知识挖掘研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    61702033
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    25.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    F0214.新型计算及其应用基础
  • 结题年份:
    2020
  • 批准年份:
    2017
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2018-01-01 至2020-12-31

项目摘要

Massive Electronic Medical Record (EMR) text may hide abundant unknown clinical knowledge. Although current Natural Language Processing (NLP) technique can divide the Chinese EMR text into structured words, it is still hard to attain satisfactory accuracy in terms of clinical research and decision-making support, which is the biggest barrier to realize computer-aided EMR text analysis. This project focuses on how to find out clinical knowledge from EMR text, and the usage of these knowledge to support clinical decision making and management. In this project, drawing on the NLP technique, we will integrate machine learning, hyper networks, and related theories to explore the technique of self-constructing dictionary, as well as the automatic structuring method for EMR text at the semantic level. Furthermore, we investigate how to use the mined clinical knowledge to support medical decision making through automatic clinical pathway modeling. The outcomes and methodology of this research will provide an interdisciplinary research agenda for clinical medicine through the lens of information technologies, which possesses important scientific significance.
海量电子病历文本数据中隐藏着诸多可能未知的临床知识。现有的自然语言处理技术虽然一定程度上能够实现将中文电子病历文本结构化分解,但其精确程度还无法满足面向临床实践的医学知识挖掘和决策辅助支持,这成为使用计算机分析非结构化的电子病历文本数据最大的障碍。本项目研究如何从这些电子病历文本中挖掘出临床知识,并将这些知识用于临床决策支持与管理。研究中将在当前自然语言处理技术基础上,引入机器学习、超网络等技术与理论,探索具有自学习能力的专业术语词典构建技术,以及语义层面的电子病历文本结构化分解技术,从中挖掘隐藏的临床知识,并基于这些知识实现以临床路径自动建模为核心的临床决策辅助支持。本项目的研究成果与研究思路,将能够为临床医学的相关研究提供信息技术视角的跨学科解决方案与思路,具有重要的科学意义。

结项摘要

电子病历是临床治疗活动中客观记录治疗全过程的重要数据资源,其中包括文本数据在内的不同数据类型数据的数据量极大,难以直接采用常规的数据挖掘分析方法进行处理与深度挖掘。医生或研究人员在研究过程中对电子病历的使用通常采用手工抽取相关信息的方式,效率较低且难以开展大规模的研究工作。在此背景下,以提高电子病历数据的可用性为目标,本项目研究相关理论与算法技术,实现电子病历的结构化,并进一步开展相关信息的挖掘与知识抽取研究,提升电子病历数据对临床治疗与临床管理决策的价值。项目采用合作医院提供的经过脱敏和去隐私处理的真实电子病历数据,在研究中重点针对电子病历数据的清洗加工、电子病历文本的结构化问题、电子病历的时间序列结构化问题、面向临床路径决策的电子病历治疗模式挖掘问题、数据驱动的医院运营优化问题、多属性决策的方法等问题展开了研究。基于上述研究内容,项目提出了相关的算法模型,分别从数据层面、可视化层面、以及辅助决策层面取得了相应的研究结果。这些研究成果有助于实现对电子病历相关数据内容的深度分析与挖掘,为临床医生、临床管理人员以及研究人员提供决策相关的信息与知识。相比传统的电子病历在上述场景下的使用方式,本项目的相关研究工作一方面能够提升临床决策效率,另一方面有助于挖掘不易察觉的重要临床决策线索和信息。

项目成果

期刊论文数量(8)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(2)
中文超声文本结构化与知识网络构建方法研究
  • DOI:
    10.13266/j.issn.0252-3116.2019.16.012
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    图书情报工作
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    尚小溥;许吴环;赵红梅;张润彤;朱遷
  • 通讯作者:
    朱遷
A Text Structuring Method for Chinese Medical Text Based on Temporal Information.
一种基于时间信息的中文医学文本文本结构方法
  • DOI:
    10.3390/ijerph15030402
  • 发表时间:
    2018-02-27
  • 期刊:
    International journal of environmental research and public health
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Zhang R;Chu F;Chen D;Shang X
  • 通讯作者:
    Shang X
SNOMED CT体系下医疗健康大数据映射和迁移方法研究
  • DOI:
    10.3772/j.issn.1000-0135.2018.05.010
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    情报学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    陈东华;张润彤;付磊;尚小溥;朱晓敏
  • 通讯作者:
    朱晓敏
数据驱动的大型医院门诊系统服务效率与患者流研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    管理科学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    张润彤;赵红梅;许媛;张雄;王超;尚小溥
  • 通讯作者:
    尚小溥
Discovering Medication Patterns for High-Complexity Drug-Using Diseases Through Electronic Medical Records
通过电子病历发现高复杂性用药疾病的用药模式
  • DOI:
    10.1109/access.2019.2937892
  • 发表时间:
    2019-01-01
  • 期刊:
    IEEE ACCESS
  • 影响因子:
    3.9
  • 作者:
    Huang,Huiqun;Shang,Xiaopu;Fu,Lei
  • 通讯作者:
    Fu,Lei

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其他文献

绿色计算背景下的网络管理研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    计算机科学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    李亚;彭海云;尚小溥;张润彤
  • 通讯作者:
    张润彤
数据驱动的大型医院门诊系统服务效率与患者流关系研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    管理科学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    张润彤;赵红梅;许媛;张雄;王超;尚小溥
  • 通讯作者:
    尚小溥

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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