细胞迁移动力学的实验与理论研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    11434001
  • 项目类别:
    重点项目
  • 资助金额:
    360.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    A2013.软凝聚态与生物物理
  • 结题年份:
    2019
  • 批准年份:
    2014
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2015-01-01 至2019-12-31

项目摘要

The migration of bacteria or mammalian cell is very popular in nature. It is the appropriate response for living cell to seek for better micro-environment and run away from danger, such as bacteria chemotaxis, antibiotic phenomena, wound healing, and cancer cell metastasis. The experimental and theoretical studies of cell migration can help us to figure out the control network, and better understand the complex behavior of cells. It is now one of the research frontier in quantitative biology. This project is an interdisciplinary study conducted between physics and quantitative biology. We will aim at the key problems and develop trends of cell migration on the basis of our accumulated experience in the research fields of microfluidics and quantitative biology. We will build up new experimental and theoretical methods, aiming at getting progresses in spatiotemporal bacteria chemotaxis behavior, bacteria-antibiotic spatiotemporal fitness dynamics and the cancer cell migration dynamics.
细菌/细胞迁移行为广泛地存在于自然界中,是生命体为了应对周围的复杂的环境变化采取的普遍行为,例如细菌的趋化行为,细菌-霉菌的抗生行为,伤口表皮细胞的迁移,癌细胞的转移等。其动力学的实验与理论研究对定量地刻画其控制网络,揭示生命的复杂行为有重要的意义,目前已经成为国际上研究的热点。本项目属于物理学与定量生物学的交叉学科研究,将瞄准细胞迁移动力学的关键问题与发展趋势,在多年积累的微流控与定量生物学研究的基础上,建立一些标准的实验与理论研究方法,力争在细菌时空趋化性,菌群-抗生素的时空适应行为以及癌细胞迁移动力学上取得突破。

结项摘要

项目组开展了系列针对细菌,细胞迁移动力学的实验与理论研究工作。1. 建立了周期性行波浓度场赛道并调整波速,发现了细菌趋化运动过程中的“跃迁”行为,工作被美国物理协会APS做亮点报道;2.发现绿脓杆菌趋化运动中的单鞭毛对称调节行为,并从理论上证明其此类调节行为使得其趋化效率最优,工作被同行专家在F1000上以“New Finding”亮点推荐;3.发现了双梯度浓度场下细菌群体的奇特“逃逸条带”行为,定量描述此行为并解释了其中的生物物理机理;4.共生菌群的群落结构,比率的动力学行为及对群体耐药性的影响进行了定量研究,发现菌群空间协作机制,为克服菌群的高耐药性特征提供了可能的机制;5.定量研究了3D条件下癌干细胞和癌细胞的不同迁移动力学; 发现了癌干细胞在癌细胞的联合迁移行为中的作用,为癌症诊断和靶向治疗提供了重要参考;6.整合物理分离捕获循环肿瘤细胞的方法,实现高通量下92%的循环肿瘤细胞捕获效率,成功实现临床测试肿瘤病人与正常人血液中类循环肿瘤细胞数量的检测。.在本项基金的支持下,项目组共发表38篇SCI收录论文,其中Nature Physics 1篇,PNAS 一篇,PRL 1篇, Communications Biology 1篇,Lab on a Chip 2篇,mBio 1篇,Plos Computational Biology 2篇。获批国家发明专利一项,在国际会议上做邀请报告十七人次。

项目成果

期刊论文数量(41)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(1)
Barrier Crossing in Escherichia coli Chemotaxis
大肠杆菌趋化性中的屏障穿越
  • DOI:
    doi:10.1103/physrevlett.118.098101
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    PHYSICAL REVIEW LETTERS
  • 影响因子:
    8.6
  • 作者:
    Li Zhaojun;Cai Qiuxian;Zhang Xuanqi;Si Guangwei;Ouyang Qi;Luo Chunxiong;Tu Yuhai
  • 通讯作者:
    Tu Yuhai
营养缺乏和碱性环境对粪肠球菌侵入人工微管系统的影响
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    实用口腔医学杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    孙晓强;王淑静;罗春雄;侯本祥
  • 通讯作者:
    侯本祥
A parallel and quantitative cell migration assay using a novel multi-well-based device
使用新型多孔装置进行并行定量细胞迁移测定
  • DOI:
    10.1007/s10544-016-0122-7
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    BIOMEDICAL MICRODEVICES
  • 影响因子:
    2.8
  • 作者:
    Quan Qianghua;Zhang Shuwen;Wang Xudong;Ouyang Qi;Wang Yugang;Yang Gen;Luo Chunxiong
  • 通讯作者:
    Luo Chunxiong
The evaluation of E-faecalis colonies dissolution ability of sodium hypochlorite in microenvironment by a novel device
新型装置评价微环境中粪肠球菌菌落次氯酸钠溶解能力
  • DOI:
    10.1007/s10544-018-0279-3
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    Biomedical Microdevices
  • 影响因子:
    2.8
  • 作者:
    Sun Xiaoqiang;Li Shaorong;Wang Shujing;Luo Chunxiong;Hou Benxiang
  • 通讯作者:
    Hou Benxiang
A Genetically Encoded Protein Polymer for Uranyl Binding and Extraction Based on the SpyTag-SpyCatcher Chemistry
基于 SpyTag-SpyCatcher 化学的用于铀酰结合和提取的基因编码蛋白质聚合物
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    ACS SYNTHETIC BIOLOGY
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Yang Xiaoyu;Wei Jingyi;Wang Yuqing;Yang Changru;Zhao Shijun;Li Cheng;Dong Yiming;Bai Ke;Li Yuexuan;Teng Huaiyuan;Wang Dingyu;Lyu Nayun;Li Jiamian;Chang Xuyao;Ning Xin;Ouyang Qi;Zhang Yihao;Qian Long
  • 通讯作者:
    Qian Long

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其他文献

动态应答人工生物系统研究进展
  • DOI:
    10.1360/n052015-00051
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
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  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    杨弋;娄春波;刘海燕;马小军;李益民;欧阳颀
  • 通讯作者:
    欧阳颀
Social influence in small-world networks
小世界网络中的社会影响
  • DOI:
    10.1088/1009-1963/11/12/312
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    Chin Physics
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    孙凯;毛晓明;欧阳颀
  • 通讯作者:
    欧阳颀
Experimental study of the dimensionality of black-eye patterns
黑眼图案维数的实验研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    Phys. Rev. E
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    周朝显;郭宏宇;欧阳颀
  • 通讯作者:
    欧阳颀
Noise effect in metabolic networks
代谢网络中的噪声效应
  • DOI:
    10.1088/1674-1056/18/12/069
  • 发表时间:
    2009-12-01
  • 期刊:
    Bioinformatics
  • 影响因子:
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  • 作者:
    李政言;谢正伟;陈同;欧阳颀
  • 通讯作者:
    欧阳颀
新型多孔单细胞观测芯片设计及在细菌抗药性研究中的应用
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    北京大学学报(自然科学版)
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    姜香丹;欧阳颀;罗春雄
  • 通讯作者:
    罗春雄

其他文献

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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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