转录因子EgWRI1s在油棕脂肪酸组分差异形成中的调控机理研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31870670
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    60.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1611.经济林学
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2018
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2019-01-01 至2022-12-31

项目摘要

The oil content of oil palm fruit and its compositions are important agronomic traits. Mesocarp of oil palm fruit is rich in oleic acid and palmitic acid, but its endosperm contains large amounts of lauric acid. The formation mechanism of this difference is unclear. WRI1 is an AP2 type transcriptional factor and a key regulator for oil biosynthesis. The project uses oil palm mesocarp and endosperm as target for the study, and focuses on scientific question that EgWRI1s may play a role in regulating the differential fatty acid composition formation in oil palm mesocarp and endosperm. By using the yeast one-hybrid technology to screen upstream regulatory factors and the downstream target genes for EgWRI1s and the isolated regulatory factors and the promoter of the target genes will be verified by EMSA experiments. Preliminary analytical the factors that may govern the differential expression of EgWRI1s in mesocarp and endosperm; by functional verification of EgWRI1s and screening of target genes in fatty acid synthesis, and learning how these involve in fatty acids synthetic in mesocarp or endosperm which were under the control of EgWRI1-1 or EgWRI1-2; through the traits and target gene mutation investigation and correlation analysis, to verify the role of regulatory factors and target genes in the regulation of oil palm fatty acid synthesis. The study will establish the regulatory network of fatty acid syntheses for EgWRI1s in oil palm, and explores the effects and control mechanisms to resolve EgWRI1’s role regulating the differential fatty acid composition formation of oil palm mesocarp and endosperm, which will enrich the theory of metabolic adjustment of oil content and oil composition in oil palm.
油棕果的含油量及其组分是重要的农艺性状,其中果皮富含棕榈酸和油酸而果仁含大量月桂酸,但差异形成的机制还不清楚。WRI1是AP2类的转录因子,是油脂合成的重要调控因子。本项目以油棕中果皮和果仁为研究对象,围绕EgWRI1s在中果皮和果仁脂肪酸组分差异形成中的调控作用这一科学问题开展研究。通过酵母单杂交技术筛选EgWRI1s的上游调控因子和鉴定下游的靶基因,通过EMSA技术对调控因子和靶基因的启动子进行验证,初步解析EgWRI1s在中果皮和果仁差异表达的调控机制;了解靶基因如何在EgWRI1-1或EgWRI1-2的调控下参与了中果皮和果仁脂肪酸的合成;通过性状与目标基因变异的调查及关联分析,验证调控因子及靶基因在油棕脂肪酸合成调控中的作用。初步建立EgWRI1s的调控网格,解析EgWRI1s在油棕脂肪酸组分差异形成中的调控机理,丰富油棕含油量和油脂组分代谢调节及其性状形成和演变的理论。

结项摘要

油棕具“世界油王”美称,油棕果的含油量及其组分是其重要的农艺性状,其中果皮富含棕榈酸和油酸而果仁含大量月桂酸,但差异形成的机制还不清楚。针对以上问题,本项目开展了油棕AP2类转录因子 EgWRI1s 的上游调控因子的筛选及相关基因家族的全基因组方向,油棕 EgWRI1s 油脂合成相关靶基因的鉴定及其表达特征分析,开展了油棕含油量及组分差异与相关基因变异的相关性分析。相关研究表明EgWRI1-1和EgWRI1-2在时空表达上存在显著的差异,WRI1-1主要在油棕果授粉后81、95和111天的中果皮中的表达量最高,在果仁组织的所有发育阶段及125、142和152天的中果皮的表达极低;WRI1-2的情况正好相反,在在油棕果授粉后81、95和111天的果仁中的表达量最高,在中果皮的所有发育阶段基本不表达。初步筛选到EgWRI1s上游调控因子EgLEC1、EgLEC2、EgABI3、EgFUS3,下游靶基因EgEAR-1、EgEAR-2、EgFATB3、EgFabD等脂肪酸合成相关酶基因与WRI1-2呈现基因共表达,而EgFatB2、EgFatB1、EgHAD-2、EgACC/BCCP-1与WRI1-1呈现基因共表达。通过随机文库分别筛选EgWRI1-1、EgWRI1-2基因的潜在靶基因结合的元件14个和48个,鉴定了其对应的相关联的下游基因;通过64份资源的基因组重测序数据和脂肪酸含量的关联分析,在油棕染色体1(NC_025993.1)上获得4个SNP关联位点,在关联区域附近发现两个醛酮还原酶基因(AKR1),开发了与脂肪酸合成相关基因的内含子多态性标记13个,其中包括一个WRI1-1-2的等位基因标记。本研究的结果将成为油料作物(特别是非种子器官)脂肪酸合成调控机理的重要补充,同时也将丰富油棕等木本油料作物含油量和油脂组分的代谢调节及性状形成与演变的理论,为油棕油脂组分的品质改良,油棕分子辅助育种的开展提供科学依据。

项目成果

期刊论文数量(9)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(1)
WRI1调控植物油脂合成的研究进展
  • DOI:
    10.19802/j.issn.1007-9084.2021177
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    中国油料作物学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    金龙飞;周丽霞;曹红星;杨耀东
  • 通讯作者:
    杨耀东
基于转录组测序的油棕脂肪酸合成基因的筛选及分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    分子植物育种
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    周丽霞;吴翼;张安妮;杨耀东
  • 通讯作者:
    杨耀东
Genome-wide identification and expression analysis of bZIP transcription factors in oil palm (Elaeis guineensis Jacq.) under abiotic stress
非生物胁迫下油棕 (Elaeis guineensis Jacq.) bZIP 转录因子的全基因组鉴定和表达分析
  • DOI:
    10.1158/2326-6066.cir-19-0554
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    Protoplasma
  • 影响因子:
    2.9
  • 作者:
    Lixia Zhou;Rajesh Yarra
  • 通讯作者:
    Rajesh Yarra
The oil palm R2R3-MYB subfamily genes EgMYB111 and EgMYB157 improve multiple abiotic stress tolerance in transgenic Arabidopsis plants
油棕R2R3-MYB亚家族基因EgMYB111和EgMYB157提高转基因拟南芥植物的多种非生物胁迫耐受性
  • DOI:
    10.1007/s00299-021-02814-1
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    Plant Cell Reports
  • 影响因子:
    6.2
  • 作者:
    Lixia Zhou;Rajesh Yarra;Yaodong Yang;Yanju Liu;Mengdi Yang;Rajesh Yarra
  • 通讯作者:
    Rajesh Yarra
Development of Intron Polymorphism Markers and Their Association With Fatty Acid Component Variation in Oil Palm
油棕内含子多态性标记的开发及其与脂肪酸成分变化的关联
  • DOI:
    10.3389/fpls.2022.885418
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    Frontiers in Plant Science
  • 影响因子:
    5.6
  • 作者:
    Li, Jing;Yang, Yaodong;Sun, Xiwei;Liu, Rui;Xia, Wei;Shi, Peng;Zhou, Lixia;Wang, Yong;Wu, Yi;Lei, Xintao;Xiao, Yong
  • 通讯作者:
    Xiao, Yong

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椰子脂肪酸积累及与FatB基因表达关系研究
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  • 发表时间:
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  • 期刊:
    广西植物
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    周丽霞;吴翼;杨耀东
  • 通讯作者:
    杨耀东
椰子保守microRNA预测和特征分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    广东农业科学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    周丽霞;杨耀东;肖勇;马子龙
  • 通讯作者:
    马子龙
压电材料中相共存态与其性能的关系(英文)
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    中国材料进展
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    周超;薛德祯;杨耀东;任晓兵
  • 通讯作者:
    任晓兵

其他文献

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椰子R2R3-MYBs转录因子在外果皮颜色形成中的作用及调控机理研究
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    2020
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    58 万元
  • 项目类别:
    面上项目

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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