重组激活基因蛋白造成B细胞非抗原受体基因位点发生转位的机制研究

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31370874
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    80.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0801.固有免疫
  • 结题年份:
    2017
  • 批准年份:
    2013
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2014-01-01 至2017-12-31

项目摘要

The lymphocytes can produce a highly diverse repertoire of antigen receptors through V(D)J recombination by using the lymphocyte specific proteins(RAGs)encoded by the recombination activating gene. RAGs bind and cleave the DNA at the recombination signal sequences (RSSs) that flank each antigen receptor gene segment. The mouse and human genomes contain millions of cryptic RSS(cRSS) sequences, which might cause chromosomal deletions and translocations by RAGs potential binding and cleaveage. Based on this issue, We will purify pre-B cells from the mice which express RAGs, establish the genome-wide binding for RAG targeting by using RAG ChIP-seq assay, and select the nonantigen receptor genes which could be bound by RAGs. We will clone the vectors which include the nonantigen receptor genes targeted by RAGs, and will show whether the RAGs have the abilities to cleave them or not. We will figure out which regions in RAGs are important for RAG binding to nonantigen receptor loci. We will indicate that abnormal V(D)J recombination by RAG overexpression and so on will cause the chromosomal translocations between antigen receptor loci and nonantigen receptor loci (oncogenes).All these results not only will elucidate the mechanisms for RAG targeting to the nonantigen receptor loci, but also will provide the reasons why lymphoid neoplasms occur.
淋巴细胞通过重组激活基因蛋白(recombination activating gene,RAG)特异性结合并断裂抗原受体基因片段旁的重组信号序列(recombination signal sequences, RSSs)实现V(D)J的重组,产生多样性的抗原受体基因。基因组含有大量类似RSS(cRSS)序列,RAG对cRSS序列的结合和断裂可能造成了基因的丢失和转位。为此,本研究从小鼠分离出表达RAG的pre-B细胞,运用RAG ChIP-seq技术筛选出基因组中RAG结合的非抗原受体基因,构建含有上述基因载体并检测RAG对这些基因的断裂作用。研究不同结构的RAG结合非抗原受体基因位点的机制,阐明RAG过度表达等异常V(D)J重组是造成免疫球蛋白基因与非抗原受体基因(原癌基因)转位的原因。该研究不仅发现了RAG诱导非抗原受体基因位点发生转位的机制,而且为淋巴细胞肿瘤的发生提供了理论依据。

结项摘要

早期发育的T或B淋巴细胞通过重组激活基因蛋白(recombination activating gene,RAG)特异性结合并断裂抗原受体基因片段旁的重组信号序列(recombination signal sequences, RSSs)实现抗原受体基因重排,产生多样性的抗原受体基因。但是基因组含有大量类似RSS(cRSS)序列,RAG对cRSS序列的结合和断裂可能造成了基因的丢失和转位。为此,本研究从小鼠分离出表达RAG的pre-B细胞,运用RAG ChIP-seq技术筛选出基因组中RAG结合的1500个非抗原受体基因,分析这些基因的cRss序列发现,它们具有RAG的结合位点但没有断裂位点。我们提出基因组cRss的结构对基因组的稳定性起着保护作用。IgH基因重组是一个连续的过程,先发生DH到JH的重组,再发生VH到DJH的重组。由于VH基因数量众多、VH基因片段与DJH连接体距离较远以及缺乏合适的研究模型,VH到DJH重组的机理尚未完全阐明。我们发现RAG对IgH的VH基因的结合机制为在DH到JH重组后,DJH连接体这种结构有助于VH基因发生高水平转录,基因活化的H3k4me3和H3K27ac组蛋白修饰,RAG方有机会结合到VH。完成VH到DJH重组。DNA甲基化作为表观遗传学的重要标志,在Igk重组和Igk等位基因排斥中起作用。我们的研究成果提示了RAG2的350-383可以调节pre-B细胞阶段的Igk基因位点发生DNA去甲基化,但突变了RAG2的350-383区域维持Igk基因位点DNA甲基化但并不影响Igk重组。提示DNA去甲基化可能不影响基因重排但对Igk等位基因排斥中起作用,从而保持免疫球蛋白分子的特异性和基因组的稳定性。

项目成果

期刊论文数量(2)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
RAG2 involves the Igκ locus demethylation during B cell development
RAG2 涉及 B 细胞发育过程中的 Igγ 位点去甲基化
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    Mol Immunol
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Caijun Wu;Yanying Dong;Xiaohui Zhao;Ping Zhang;Mingzhe Zheng;Hua Zhang;Shichang Li;Yaofeng Jin;Yunfeng Ma;Yanhong Ji
  • 通讯作者:
    Yanhong Ji

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其他文献

BCR-ABL1~+粒细胞白血病小鼠模型的建立及其鉴定
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    转化医学电子杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    张萍;李琛;郑铭喆;张华;季延红
  • 通讯作者:
    季延红

其他文献

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季延红的其他基金

V(D)J重组脱靶效应促进Ph染色体阳性急性淋巴细胞白血病发生机制
  • 批准号:
    81670157
  • 批准年份:
    2016
  • 资助金额:
    60.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目
重组激活基因蛋白和转录因子Pax5相互作用形成免疫球蛋白基因V(H)到DJ(H)重排的机制
  • 批准号:
    31170821
  • 批准年份:
    2011
  • 资助金额:
    60.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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