激酶锚定蛋白AKAP8促进AID介导抗体类别转换的机制研究

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基本信息

  • 批准号:
    31900655
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    24.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0808.疫苗、抗体与免疫干预
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2019
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2020-01-01 至2022-12-31

项目摘要

Activation-induced cytidine deaminase (AID) mediates class switch recombination (CSR) and plays key roles in producing multiple diversity of antibodies in B cells. With the helps from many cofactors of AID, phosphorylated AID by Protein kinase A (PKA) is recruited to the repetitive G-rich Switch region of immunoglobulin genes and mediates double-strand breaks. However, whether A-kinase anchor proteins (AKAP) members as a cofactor involve in CSR process has yet been studied. Through data analysis and RNAi screening, we identified that AKAP8 is a novel factor which promotes CSR. Further experiments suggested that CSR promotion by AKAP8 is independent of typical PKA anchoring and probable through its association with AID. Basing of functional analysis and interaction protein clustering, AKAP8 is found to enhance histone modification, recognize G-rich sequences, and interact with RNA processing components. It is reasonable to speculate that AKAP8 may specifically promote the recruitment of AID in the Switch region, which in turn enhances CSR. In this project, we design a serial of experiments to study in depth the effects of AKAP8 on the histone modification and formation of specific structures such as R-loop in the Switch region, and dissect the molecular basis of AID recruiting to Switch regions promoted by AKAP8. Finally, we aim to reveal the functional characteristics of AKAP8 in promoting AID mediated CSR and uncover the correlated mechanism from multiple aspects. The project will also benefit the studies on diseases induced by AID off-targeting.
激活诱导胞嘧啶脱氨酶(AID)介导抗体类别转换(CSR),是B细胞产生多样性抗体的关键因子。AID被激酶磷酸化,在众多辅因子调控下,介导Ig基因Switch区双链断裂。申请人通过表型筛选,鉴定得到影响CSR的新因子激酶锚定蛋白AKAP8。进一步实验显示,AKAP8促进CSR不依赖典型的激酶锚定作用,但与AID存在互作。通过AKAP8功能分析,发现其能够增强组蛋白修饰,与RNA代谢加工组分存在互作关系,并识别G-rich序列。据此推测:AKAP8可能特异性调控Switch区AID的招募,进而影响CSR。本课题拟采用系列技术手段,深入研究AKAP8在Switch区组蛋白修饰和R-loop等特征结构形成的作用,并解析AKAP8促进Switch区招募AID的分子基础,从多层面揭示AKAP8调节AID介导CSR关键过程的功能特点,同时为AID脱靶向诱发疾病的研究提供信息。

结项摘要

本项目源于探索关键激酶锚定蛋白家族成员对激活诱导胞嘧啶脱氨酶AID介导抗体类别转换的影响研究课题。AID在B淋巴细胞中诱导表达,是产生多样性抗体的关键因子。AID异常激活时,可脱靶向导致Ig-非Ig基因转位、癌突变及基因组不稳定,是诱发骨髓瘤等癌症发生的重要因素之一。本项目针对筛选获得影响类别转换表型的AKAP8蛋白,采用了系列分子生物学手段,证实AKAP8通过结合R-loop区,调控免疫球蛋白基因Switch区R-loop形成机制,从抗体类别转换模型出发,解释AKAP8在调控R-loop的分子机制。.本项目证实关键蛋白AKAP8促进AID介导类别转换重组,但是不依赖于AKAP家族激酶锚定活性,而是通过促进AID表达水平实现。同时发现AKAP8在免疫球蛋白基因有富集,后续证明AKAP8能够结合R-loop区,并于R-loop结合蛋白存在互作。本项目初步揭示AKAP8通过调控R-loop区促进免疫球蛋白GLTs转录及AID表达水平,增强AID介导类别转换重组,并尝试探索AKAP8在作用于R-loop区调控机制,为深入探究AKAP8分子功能提供了实验基础。同时,利用本项目资助,验证了干细胞中AKAP8与R-loop、R-loop相关蛋白的结合,及R-loop相关蛋白在外泌体中的作用。综上,本项目从调控R-loop功能的角度,发现AKAP8新功能及调控特征,为深入研究AKAP8在抗体类型转换和R-loop结构调节提供理论和实验基础。

项目成果

期刊论文数量(2)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
UBE2O ubiquitinates PTRF/CAVIN1 and inhibits the secretion of exosome-related PTRF/CAVIN1
UBE2O 泛素化 PTRF/CAVIN1 并抑制外泌体相关 PTRF/CAVIN1 的分泌
  • DOI:
    10.1186/s12964-022-00996-z
  • 发表时间:
    2022-11-28
  • 期刊:
    Cell Communication and Signaling
  • 影响因子:
    8.4
  • 作者:
    Xiaotong Cen;Qing Chen;Bin Wang;Hongjie Xu;Xu Wang;Yixia Ling;Xiaofei Zhang;Dajiang Qin
  • 通讯作者:
    Dajiang Qin
Magnetic Nano-Sized SDF-1 Particles Show Promise for Application in Stem Cell-Based Repair of Damaged Tissues
磁性纳米 SDF-1 颗粒在基于干细胞的受损组织修复中显示出应用前景
  • DOI:
    10.3389/fbioe.2022.831256
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    Frontiers in Bioengineering and Biotechnology
  • 影响因子:
    5.7
  • 作者:
    Wang, Xu;Han, XinXin;Qiu, Yi;Sun, Jianbo
  • 通讯作者:
    Sun, Jianbo

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  • 通讯作者:
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  • 通讯作者:
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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