基于异质性调查数据的贝叶斯地理统计联合模型的开发和应用

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81703320
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    20.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H3011.流行病学方法与卫生统计
  • 结题年份:
    2020
  • 批准年份:
    2017
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2018-01-01 至2020-12-31

项目摘要

High-resolution maps depicting the geographical distribution of disease risk assist disease control by delivering control interventions at areas of highest risk. Bayesian geostatistical modeling is the most rigorous inferential approach for estimating the disease risk at areas without observed data by relating survey data with potential predictors and by taking into account the spatial correlation between survey locations. In the absence of single surveys covering the whole study region, survey data are compiled from bibliometric searches, heterogeneous between locations. There are two kinds of heterogeneity that draw special attention, that is point-areal heterogeneity and age heterogeneity. Until now, no practical geostatistical modes are developed yet to properly address them. The current proposed research aim to develop advanced geostatistical joint models to address data heterogeneity, particularly point-areal heterogeneity and age heterogeneity, and analyze data combined from different spatially geo-referenced prevalence surveys. As an application example, the developed models will be used to analyze survey data of neglected tropical diseases in Asia. These diseases were historically overlooked but are the most common chronic infections in the poorest areas in Asia. Data heterogeneity will be addressed and more precise high-resolution risk maps will be produced. In addition, with combination of transmission dynamic models, series of temporal change risk maps under proposed interventions will be predicted that allow estimate the resource input, as well as the time needed to achieve transmission control or elimination. The current proposed research will provide innovative methodology, up-to-date knowledge and new ideas for disease control and prevention.
贝叶斯地理统计模型,考虑调查点间的空间关联性,量化疾病与影响因素的关系,估算没有调查数据的地方疾病的患病风险,产生高精度的疾病分布地图,指导干预措施用于最需要的地方。在资源有限的情况下,需要整合所有已知调查数据进行分析,不同调查方案、调查时间、诊断方法、人群结构、报告形式等,构成了地理信息数据的异质性问题。实际工作中,有两种异质性对分析结果影响较大:点、面数据异质性和年龄异质性,目前尚没有很好的地理统计模型解决以上问题。本课题拟开发针对以上异质性的地理统计模型,结合其他异质性问题,构建多层次地理统计联合模型。被忽视的热带病(NTD)是亚洲贫困地区最重要的传染病之一,作为应用实例,本课题拟收集亚洲NTD的大量调查数据,应用开发的新模型对数据进行整合分析,更准确的估算该类疾病的高精度分布地图,并结合疾病的动态传播模型,预测干预措施下患病风险的动态变化地图,为疾病防治提供新方法、新知识和新思路。

结项摘要

贝叶斯地理统计模型,考虑调查点间空间关联性,量化疾病与影响因素的关系,估算没有调查数据的地方疾病的患病风险,产生高精度的疾病风险地图,指导干预措施用于最需要的地方。在资源有限下,需要整合分析所有已知调查数据,而不同调查方案、调查时间、诊断方法、人群结构、报告形式等,构成了调查数据的异质性问题。本研究在方法上,基于用面栅格点空间效应的加权平均近似面的空间效应的方法,构建了点、面数据联合模型;基于年龄自相关模型描述疾病在年龄上的分布特征、及年龄点对应空间效应的加权平均近似年龄段空间效应的方法,构建了年龄异质性的地理统计模型。以上模型的基础上,通过诊断方法作为协变量、构建等距时间节点的时空效应并投射到不规则的调查时间上、不同形式患病数据共享关键参数等方法,解决调查数据中调查时间异质性、诊断方法异质性、数据形式异质性等问题,并考虑空间混杂效应、及年龄点、时间点过多时计算负担重等问题,开发了多层次联合模型框架。应用上,针对调查数据收集过程中信息的量大、冗繁等问题,构建了“亚洲贫穷相关传染病公开数据库”信息共享平台,共计收集了亚洲被忽视热带病11603条疾病调查数据;以构建的多层次联合地理统计模型为框架,结合实际数据中出现的异质性问题,构建相应的联合地理统计模型,并制作完成了东南亚土源性线虫病、东南亚后睾吸虫病、韩国华支睾吸虫病、广东省年龄别华支睾吸虫病、中国主要流行省份血吸虫病、孟加拉育龄妇女生殖道感染、及广东省年龄别两周总患病率的高精度风险地图,展现高风险地区,为疾病的空间靶向防控和卫生资源配置提供重要信息。同时,以广东省华支睾吸虫病为例,以高精度患病地图作为基线值,结合传染病的数学传播模型,预测最优策略下疾病的动态变化地图,明确了该方法的可行性。此方法可扩展到其他被忽视热带病,为干预策略的选择提供信息。总体而言,本研究从方法和应用两方面,为被忽视的热带病调查数据的分析和应用提供重要参考。

项目成果

期刊论文数量(6)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
中国华支睾吸虫病的人群干预措施与防治效果研究进展
  • DOI:
    10.3969/j.issn.1672-3619.2020.02.031
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    热带医学杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    黄小红;方悦怡;赖颖斯
  • 通讯作者:
    赖颖斯
Assessment of control strategies against Clonorchis sinensis infection based on a multi-group dynamic transmission model
基于多群体动态传播模型的华支睾吸虫感染控制策略评估
  • DOI:
    10.1371/journal.pntd.0008152
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    PLoS Neglected Tropical Diseases
  • 影响因子:
    3.8
  • 作者:
    Huang Xiao-Hong;Qian Men-Bao;Zhu Guang-Hu;Fang Yue-Yi;Hao Yuan-Tao;Lai Ying-Si
  • 通讯作者:
    Lai Ying-Si
华支睾吸虫病预防性化疗SIS模型构建和应用
  • DOI:
    10.16462/j.cnki.zhjbkz.2020.08.017
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    中华疾病控制杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    黄小红;方悦怡;赖颖斯
  • 通讯作者:
    赖颖斯
Model-based spatial-temporal mapping of opisthorchiasis in endemic countries of Southeast Asia
基于模型的东南亚流行国家阿片吸虫病时空测绘
  • DOI:
    10.7554/elife.59755
  • 发表时间:
    2021-01-12
  • 期刊:
    eLife
  • 影响因子:
    7.7
  • 作者:
    Zhao TT;Feng YJ;Doanh PN;Sayasone S;Khieu V;Nithikathkul C;Qian MB;Hao YT;Lai YS
  • 通讯作者:
    Lai YS
High-resolution mapping of reproductive tract infections among women of childbearing age in Bangladesh: a spatial-temporal analysis of the demographic and health survey
孟加拉国育龄妇女生殖道感染的高分辨率绘图:人口和健康调查的时空分析
  • DOI:
    10.1186/s12889-021-10360-4
  • 发表时间:
    2021-02-12
  • 期刊:
    BMC Public Health
  • 影响因子:
    4.5
  • 作者:
    Feng C;Li R;Shamim AA;Ullah MB;Li M;Dev R;Wang Y;Zhao T;Liao J;Du Z;Ling Y;Lai Y;Hao Y
  • 通讯作者:
    Hao Y

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其他文献

其他文献

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赖颖斯的其他基金

基于时空传播动力学模型联合地理统计模型的传染病时空建模方法的开发与应用
  • 批准号:
    82073665
  • 批准年份:
    2020
  • 资助金额:
    56 万元
  • 项目类别:
    面上项目

相似国自然基金

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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