高通量微纳液滴生成技术及在数字PCR中的应用

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    61571428
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    67.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    F0124.生物电子学与生物信息处理
  • 结题年份:
    2019
  • 批准年份:
    2015
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2016-01-01 至2019-12-31

项目摘要

Early diagnosis of major diseases is one of the current major social needs. In conventional methods, it’s difficult to detect trace amounts of biomarkers. However, digital PCR technique can detect low-abundance biomarkers in complex background, which is an effective solution for early diagnosis. High-throughput and uniform micro/nano droplets can ensure a high performance of digital PCR system. In conventional microfluidic structures (which is difficult to be integrated), shearing force is used to generate droplets. This project intends to get rid of shearing force, develop a new and easy-integrated droplet spontaneously generation (DSG) structure. Meanwhile, by study the mechanism of the DSG structure, and remove the coupling relations during integration, we will achieve a high-throughput micro/nano droplet generation technology. As a demonstration, we intend to apply this technique to digital PCR assay. To detect the mutant EGFR gene in the early lung cancer, we plan to design an integrated digital PCR chip, which includes the sample dispersion, PCR amplification and detection steps, to achieve a rapid quantitative detection. After this project, we will achieve high-throughput and uniform micro/nano droplets, which is expected to solve the low-throughput bottleneck in droplet-based microfluidics.
重大疾病的早期诊断是我国当前的重大社会需求之一。常规的检测方法通常难以检测出病人血液中微量的标志物;数字PCR技术可在复杂背景下检测出低丰度的标志物,是重大疾病早期诊断的有效解决方案。数字PCR系统中,高通量(短时间内产生巨量)、尺寸均一的微单元是其性能的保障。在液滴微流控的传统结构中,分散相被连续相切割成一个个微液滴,由于需依靠稳定的剪切力,因而难以通过并行化实现高通量。本项目拟摆脱剪切力的束缚,发展一种新型、易于集成的液滴自发产生结构,并通过研究该结构中液滴产生的机理,探索去除并行化过程中耦合关系的方法,实现高通量微纳液滴生成技术。在此基础上,针对早期肺癌病人血液中的EGFR基因突变体,设计一款集成样品分散、扩增以及检测等步骤的数字PCR芯片,实现核酸突变体的快速定量检测。通过本项目的开展,将实现高通量,均一的微纳液滴,此项工作可望解决液滴微流控技术中通量低的技术瓶颈。

结项摘要

重大疾病的早期诊断是我国当前的重大社会需求之一。数字PCR技术可在复杂背景下检测出低丰度的标志物,是重大疾病早期诊断的有效解决方案。然而,在数字PCR系统中,高通量、尺寸均一的微单元是其性能的保障。在本项目中,我们提出了一种液滴自发生成的新型结构(DSG结构),通过机理研究证实此项结构具有结构简单、易集成等优点(此项结构已经获得了一项国际专利)。随后,我们通过并行化集成该DSG结构,发展了高通量液滴生成技术,并实现了MHz的液滴生成通量。此项技术可望解决液滴微流控技术中通量低的技术瓶颈。为了验证上述高通量液滴生成技术的性能,我们在项目支持下开发了具有自主知识产权的集液滴高通量生成、PCR扩增与结果读出为一体的数字PCR芯片。此项研究成果已获得了北京精准医疗公司的风险投资(初期投资1000万元)。在项目进一步的开展过程中,我们通过工业化注塑工艺,实现了一体式数字PCR芯片的批量化生产。同时,也开发了与一体式数字PCR芯片相配套的样本制备系统及结果扫描分析系统(两项医疗器械注册证申报中)。116例的临床测试证实了高通量液滴生成技术的有效性,以及数字PCR芯片及系统可实现EGFR突变的快速、定量检测。这些工作为我们推进高通量、一体化数字PCR检测技术奠定了坚实的技术基础。

项目成果

期刊论文数量(11)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(1)
专利数量(6)
High aspect ratio induced spontaneous generation of monodisperse picolitre droplets for digital PCR
高纵横比诱导自发生成用于数字 PCR 的单分散皮升液滴
  • DOI:
    10.1063/1.5011240
  • 发表时间:
    2018-01-01
  • 期刊:
    BIOMICROFLUIDICS
  • 影响因子:
    3.2
  • 作者:
    Xu, Xiaonan;Yuan, Haojun;Yao, Shuhuai
  • 通讯作者:
    Yao, Shuhuai
Detection of KRAS mutations using double-stranded toehold-exchange probes
使用双链脚趾交换探针检测 KRAS 突变
  • DOI:
    10.1016/j.bios.2016.01.055
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    Biosensors and Bioelectronics(IF=7.476)
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Wu Zhenhua;Ma Tianle;Coll Jean-Luc;Liu Fangming;Zhang Honglian;Ma Yunfei;Wang Zhishuo;Jin Qinghui;Mao Hongju;Zhao Jianlong
  • 通讯作者:
    Zhao Jianlong
Novel Microfluidic Droplet Digital PCR Chip for High Sensitive Detection of Nucleic Acid
用于高灵敏度核酸检测的新型微流控液滴数字PCR芯片
  • DOI:
    10.7503/cjcu20170012
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    Chemical Journal of Chinese Universities
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Yuan Haojun;Gao Wanlei;Jing Fengxiang;Liu Songsheng;Zhou Hongbo;Chunping Jia;Jin Qinghui;Zhao Jianlong;Yuan Haojun;Gao Wanlei;Jia CP
  • 通讯作者:
    Jia CP
A panel of promoter methylation markers for invasive and noninvasive early detection of NSCLC using a quantum dots-based FRET approach
使用基于量子点的 FRET 方法,用于侵入性和非侵入性早期检测 NSCLC 的一组启动子甲基化标记物
  • DOI:
    10.1016/j.bios.2016.05.067
  • 发表时间:
    2016-11-15
  • 期刊:
    BIOSENSORS & BIOELECTRONICS
  • 影响因子:
    12.6
  • 作者:
    Ma, Yunfei;Bai, Yanan;Mao, Hongju
  • 通讯作者:
    Mao, Hongju
A Facile Strategy for Visualizing and Modulating Droplet-Based Microfluidics
可视化和调节基于液滴的微流体的简便策略
  • DOI:
    10.3390/mi10050291
  • 发表时间:
    2019-04
  • 期刊:
    Micromachines
  • 影响因子:
    3.4
  • 作者:
    Gao Zehang;Peng Huo;Zhu Minjie;Wu Lei;Jia Chunping;Zhou Hongbo;Zhao Jianlong
  • 通讯作者:
    Zhao Jianlong

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  • 作者:
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  • 通讯作者:
    周洪波

其他文献

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周洪波的其他基金

基于纳流体芯片平台的流动电势研究
  • 批准号:
    61006086
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  • 项目类别:
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相似国自然基金

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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