BRD7通过调控染色质重塑促进转录激活区域DNA双链断裂同源重组修复的分子机制及功能研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81872140
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    62.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H1804.肿瘤遗传与进化
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2018
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2019-01-01 至2022-12-31

项目摘要

Chromatin remodeling mediated gene transcription regulation and DNA damage response are tightly coordinated. Recent studies indicate that transcriptionally active chromatin recruits homologous recombination protein at DNA double-strand breaks (DSBs). During the process, ATM prevents RNA polymerase II elongation-dependent chromatin decompensation at regions distal to DSBs. However, little is known about the mechanism that links DNA damage responses and nascent transcription on a contiguous stretch of chromatin. Therefore, we hypothesized that there is a chromatin remodeling proteins involved in HR repair and transcriptional activity near DSBs. In recently studies, we have found that chromatin remodeling protein BRD7 is a direct substrate of ATM and ATR. Furthermore, we also observed that the depletion of BRD7 resulted in defective transcriptional repression upon DSBs. On the one hand, we demonstrated that BRD7 depletion impaired MRN complex recruitment to DSBs and inhibited HR repair efficiency; on the other hand, chromatin structure is more compact in BRD7-depleted cells. Functional study indicated that BRD7 depletion rendered cells more sensitive toward Etoposide, CPT treatment due to its deficiency of HR repair. Taken together, our aims of this study are further clarifying the molecular mechanism and significance of BRD7-mediated regulation of HR repair in response to DNA damage, and providing strong theoretical basis for reasonable selection of PARP inhibitors in cancer therapy.
染色质重塑与基因转录调控和DNA损伤修复有着密切的联系。同源重组修复(HR)发生时,染色质结构呈松弛状态,同时RNA转录被抑制,但具体机制仍不明确。我们近期研究发现:1) 染色质重塑因子BRD7可结合同源修复感应复合物(MRN)参与HR修复; 2) 在修复过程中,BRD7不仅促进染色质的松弛,而且招募转录抑制复合物(NuRD)抑制HR区域的转录活性;3) 上述功能的发挥依赖于ATM介导的BRD7磷酸化信号;4) BRD7的缺失导致HR修复能力下降,使细胞对化疗药物及PARP 抑制剂更加敏感。由此我们提出科学假设:BRD7通过调控染色质重塑促进转录激活区域DNA双链断裂同源重组修复。本研究将进一步阐明BRD7作为染色质重塑因子参与DNA损伤修复过程中的染色质重塑、DNA修复方式的选择、转录抑制分子机制以及肿瘤学功能,为DNA损伤相关的放化疗方案选择及合理使用PARP1抑制剂提供新的理论依据。

结项摘要

DNA双链断裂(DNA double-strand breaks, DSBs)是最严重的DNA损伤类型之一,如果不能及时修复或修复错误,则会导致基因突变、基因组不稳定及肿瘤相关等重大疾病的发生。为应对内外源性因素诱导的DSBs,机体进化出非常保守的DNA损伤应答反应,包括DNA损伤修复通路的启动、细胞周期检测点激活及基因转录的暂停等效应。当细胞内发生DSBs时,细胞首先在DNA断裂的附近激活蛋白激酶ATM。激活的ATM磷酸化染色体组蛋白H2AX,从而招募下游的MDC1/RNF8/RNF168等信号分子,启动早期的DNA损伤信号传递和修复。最近又发现ATM还具有抑制转录的新功能:通过调节DSBs处组蛋白H2A的单泛素化水平从而调控RNA聚合酶ǁ介导的转录活性,维持基因组-表观组的完整性。然而,ATM是如何兼顾DNA损伤修复与DSBs处的转录抑制活性的分子机制还很不清楚。我们发现其中的关键枢纽分子:染色质重塑复合物PBAF亚基BRD7。本研究发现激酶ATM通过直接结合并磷酸化BRD7,促进DSBs处转录活性的停滞以及进一步增强DNA修复效应蛋白的募集,从而维持基因组-表观组的完整性。功能上发现,BRD7缺失或磷酸化突变导致DSBs处转录抑制的解除,抵抗HR修复通路的启动,提示BRD7基因可作为乳腺癌(BRCA野生型)潜在的放化疗增敏剂和靶向药物作用靶点。

项目成果

期刊论文数量(14)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(2)
LncRNA DSCAM-AS1 interacts with YBX1 to promote cancer progression by forming a positive feedback loop that activates FOXA1 transcription network
LncRNA DSCAM-AS1 与 YBX1 相互作用,通过形成激活 FOXA1 转录网络的正反馈环来促进癌症进展
  • DOI:
    10.7150/thno.47830
  • 发表时间:
    2020-01-01
  • 期刊:
    THERANOSTICS
  • 影响因子:
    12.4
  • 作者:
    Zhang, Yin;Huang, Yong-Xin;Yin, Dong
  • 通讯作者:
    Yin, Dong
ATM-Dependent Recruitment of BRD7 is required for Transcriptional Repression and DNA Repair at DNA Breaks Flanking Transcriptional Active Regions.
转录抑制和 DNA 修复需要 ATM 依赖的 BRD7 募集,以实现转录活性区域侧翼 DNA 断裂处的 DNA 修复
  • DOI:
    10.1002/advs.202000157
  • 发表时间:
    2020-10
  • 期刊:
    Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Hu K;Li Y;Wu W;Xie L;Yan H;Cai Y;Chen D;Jiang Q;Lin L;Chen Z;Liao JY;Zhang Y;Koeffler HP;Yin D;Song E
  • 通讯作者:
    Song E
Activation of bivalent factor DLX5 cooperates with master regulator TP63 to promote squamous cell carcinoma.
二价因子DLX5的激活与主调控因子TP63协同促进鳞状细胞癌
  • DOI:
    10.1093/nar/gkab679
  • 发表时间:
    2021-09-20
  • 期刊:
    Nucleic acids research
  • 影响因子:
    14.9
  • 作者:
    Huang Y;Yang Q;Zheng Y;Lin L;Xu X;Xu XE;Silva TC;Hazawa M;Peng L;Cao H;Ding Y;Lu D;Berman BP;Xu LY;Li EM;Yin D
  • 通讯作者:
    Yin D
Transcription factor NFYA promotes G1/S cell cycle transition and cell proliferation by transactivating cyclin D1 and CDK4 in clear cell renal cell carcinoma
透明细胞肾细胞癌中转录因子NFYA通过反式激活细胞周期蛋白D1和CDK4促进G1/S细胞周期转变和细胞增殖
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    American Journal of Cancer Research
  • 影响因子:
    5.3
  • 作者:
    Li Yu;Xiao Xing;Chen Hengxing;Chen Zhen;Hu Kaishun;Yin Dong
  • 通讯作者:
    Yin Dong
Overexpression of lncRNAs with endogenous lengths and functions using a lncRNA delivery system based on transposon.
使用基于转座子的lncRNA递送系统过度表达具有内源长度和功能的lncRNA
  • DOI:
    10.1186/s12951-021-01044-7
  • 发表时间:
    2021-10-02
  • 期刊:
    Journal of nanobiotechnology
  • 影响因子:
    10.2
  • 作者:
    Zhang Y;Huang YX;Jin X;Chen J;Peng L;Wang DL;Li Y;Yao XY;Liao JY;He JH;Hu K;Lu D;Guo Y;Yin D
  • 通讯作者:
    Yin D

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  • 通讯作者:
    何明

其他文献

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尹东的其他基金

TRIM28介导的RCC2蛋白SUMO化修饰调控细胞有丝分裂的机制和功能研究
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    82073067
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    2020
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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